| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,365,991 | 0 | T | G | 23.9% | 273.5 / 82.0 | 144 | A261A (GCA→GCC) | dcuA | C4‑dicarboxylate antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (55/53); new base G (19/15); total (75/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
CATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAA > NC_000913/4365892‑4366086 | cATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGAtt < 1:3515792/100‑1 (MQ=255)cATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGAtt > 1:945177/1‑100 (MQ=255) tACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGc > 2:1669155/1‑100 (MQ=255) ccTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGt < 1:464451/100‑1 (MQ=255) ccTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATAAGGAGTGCga > 2:3725400/1‑99 (MQ=255) cTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGAGtt > 2:1125215/1‑100 (MQ=255) tGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTtg > 1:2512787/1‑100 (MQ=255) gCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTtgg < 2:3147004/100‑1 (MQ=255) tttGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTtggtg > 1:285652/1‑100 (MQ=255) tttGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTtggtg < 2:1154009/100‑1 (MQ=255) ttGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTtggtgg > 1:1852652/1‑100 (MQ=255) ttGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTtggtgg > 2:2525310/1‑100 (MQ=255) gAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGgtggtg < 1:2861900/100‑1 (MQ=255) gAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGAACAGGATTGCGTTGgtggtg > 2:1662191/1‑100 (MQ=255) aaGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGgtgt < 2:66976/100‑1 (MQ=255) aaGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGgtgt > 2:2729963/1‑100 (MQ=255) aaGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGgtgt > 2:3843278/1‑100 (MQ=255) aGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGtt < 1:3954849/100‑1 (MQ=255) gTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTtca > 2:1093697/1‑100 (MQ=255) tGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTtcat > 1:306095/1‑100 (MQ=255) gCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTtcatc < 1:1969312/100‑1 (MQ=255) cTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTtcatca > 1:2174883/1‑100 (MQ=255) cTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTtcatca < 2:1958622/100‑1 (MQ=255) cTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTtcatca > 1:3464777/1‑100 (MQ=255) ggAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGc > 1:2748111/1‑100 (MQ=255) ggAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGAGCAGGATTGCGTTGGTGGTGGTCATCAGc > 2:1477108/1‑100 (MQ=255) tcttGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCgg < 2:460748/98‑1 (MQ=255) aGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCgg > 1:369298/1‑100 (MQ=255) aGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTGTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTTAGCATGATGCTCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCgg < 2:3804618/100‑1 (MQ=255) aGTGGAGGGTGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCgg < 2:2709105/100‑1 (MQ=255) tGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGttt > 1:2716169/1‑100 (MQ=255) tGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCggaga > 1:469698/1‑97 (MQ=255) tGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGttt > 1:1023211/1‑100 (MQ=255) gAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGtttt < 1:3146920/100‑1 (MQ=255) gAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGtttt < 1:644278/100‑1 (MQ=255) gAGGATGTTGGCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGGCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGtttt < 2:3250048/100‑1 (MQ=255) gggtgttgtCGGTATCGACGTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTc < 2:2569271/97‑1 (MQ=255) ggATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTc > 1:1174639/1‑100 (MQ=255) gttgtCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAAcc < 2:2188970/100‑1 (MQ=255) gttgtCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAAcc > 2:200818/1‑100 (MQ=255) gttgtCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAAcc < 1:2322054/100‑1 (MQ=255) gtCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGAGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGa > 2:3147971/1‑100 (MQ=255) tCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGAc > 2:2655257/1‑100 (MQ=255) tCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGAc < 1:1015408/100‑1 (MQ=255) cGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGAcc < 1:1063883/100‑1 (MQ=255) ggTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGAccc > 2:1289009/1‑100 (MQ=255) ggTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGAccc < 2:1288364/100‑1 (MQ=255) ggTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGAccc > 1:1852842/1‑100 (MQ=255) gTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGATCCa < 2:41794/100‑1 (MQ=255) tATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGCTGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTGCATCAGCGGTTTTTCAATCAGACCAAt > 2:2765544/1‑100 (MQ=255) tCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGc < 1:3284954/100‑1 (MQ=255) tCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTCTTTCAACCAGACCCATGc > 2:1598159/1‑100 (MQ=255) cGACTTTACAGAGAACGGCGGTCCGAGCTGCAACGCGGAGCATGATGATCCGGCTTGCATCGGTGTTGTTCGTCAGCGGTTTTTCAACCAACCCCATGCt > 2:285373/1‑100 (MQ=255) aCTTTACAGATAACGGTGGTCGGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCCGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTg < 1:3805783/100‑1 (MQ=255) aCTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTg < 1:1652870/100‑1 (MQ=255) cTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTgg > 1:1500803/1‑100 (MQ=255) cTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTgg > 1:1379365/1‑100 (MQ=255) tttACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTggg < 2:3618522/100‑1 (MQ=255) ttACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGc < 1:1582392/100‑1 (MQ=255) ttACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGc < 1:3043280/100‑1 (MQ=255) ttACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGc < 1:327377/100‑1 (MQ=255) tcaCAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTgggt < 1:2029286/98‑2 (MQ=255) aCAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTg > 1:82351/1‑100 (MQ=255) cAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGGTTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGt < 2:3744769/100‑1 (MQ=255) cAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGt > 2:2989072/1‑100 (MQ=255) aGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGtt < 1:1312978/100‑1 (MQ=255) aGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGtt > 2:1826028/1‑100 (MQ=255) tttcGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGTTGTTCATCAGCGGTTATTCAACCAGACACATGCTTGGGCTGTtgat > 2:1851320/4‑100 (MQ=255) tAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGAGCCATGCTTGGGCTGTtgat > 2:3569149/1‑100 (MQ=255) tAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTtgat < 1:1195988/100‑1 (MQ=255) aaCGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTtgatg < 1:2505374/100‑1 (MQ=255) aaCGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTtgatg < 1:2170249/100‑1 (MQ=255) aaCGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTtgatg < 1:1512805/100‑1 (MQ=255) cGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTgatgat < 1:56978/100‑1 (MQ=255) acgtggtCAGAGTTGCAACGCTGATCATGATGATCAGGATCGCGTTGGTTGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTgatgat < 2:3330474/98‑1 (MQ=255) ggtggtCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTTTTTTTTTTTCATGCTTGGGCTGTTGATGAtt > 2:3243460/1‑100 (MQ=255) gacAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTCCGTTGGTGGCGTTCATCAGCAGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGAGGATTGCAt > 2:935699/3‑100 (MQ=255) tCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATa < 2:1745785/100‑1 (MQ=255) tCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATa < 1:1282681/100‑1 (MQ=255) tCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATa < 1:1987806/100‑1 (MQ=255) cAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAg > 2:2420110/1‑100 (MQ=255) tGCAACGCTGAGCAGGATGATCAGGACTGCGTTGGTGGTGTTCATCACCGGTTTATCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAAcc > 2:3738579/1‑100 (MQ=255) gCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCa > 1:2071033/1‑100 (MQ=255) gCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTGTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCa > 2:602670/1‑100 (MQ=255) cAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCAc > 1:3924563/1‑100 (MQ=255) cGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGcc < 2:2603/100‑1 (MQ=255) cGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGcc < 1:1115922/100‑1 (MQ=255) cGCTGAGCATGATGATCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGcc > 2:1906470/1‑100 (MQ=255) cGCAGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGcc > 1:3144958/1‑100 (MQ=255) gCTGAGCATGATGACCAGGATTGCGTTGGTGGGGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGTGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCa < 2:3017519/100‑1 (MQ=255) cATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACg > 1:2490553/1‑100 (MQ=255) atgatgATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTTTTTTTTTTTTATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATATCCACGCCAACTACGc > 2:2874115/1‑100 (MQ=255) atgatgATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGc > 2:863587/1‑100 (MQ=255) tgatgaTCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACAACGcc > 2:3975979/1‑100 (MQ=255) tgatgaTCAGGATGGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGcc > 1:2300936/1‑100 (MQ=255) tgatgaTCAGGATCGCGTTTGCGGTGTTCATCAGCGGTTTTTGAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGcc > 1:3478666/1‑100 (MQ=255) gatCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCcagc > 1:1645596/1‑100 (MQ=255) gatCAGGATTGCGTTGGAGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCcagc > 2:2207266/1‑100 (MQ=255) tCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCcagcag > 2:136099/1‑100 (MQ=255) ggATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGaa > 2:2637283/1‑100 (MQ=255) | CATACCTGCTTTGAAGGTGCTGGAGTTGAGGATGTTGTCGGTATCGACTTTACAGATAACGGTGGTCAGAGTTGCAACGCTGAGCATGATGATCAGGATTGCGTTGGTGGTGTTCATCAGCGGTTTTTCAACCAGACCCATGCTTGGGCTGTTGATGATTGCATAGATAACCACGCCAACTACGCCCAGCAGGAA > NC_000913/4365892‑4366086 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |