| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,127,751 | T→G | E188D (GAA→GAC) | gmd ← | GDP‑D‑mannose dehydratase, NAD(P)‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,127,751 | 0 | T | G | 98.0% | 514.7 / ‑0.9 | 152 | E188D (GAA→GAC) | gmd | GDP‑D‑mannose dehydratase, NAD(P)‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base G (71/77); total (74/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
TATTGCCGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGATTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTGGCGACCGCATA > NC_000913/2127654‑2127846 | tatTGCCGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTc < 2:778954/100‑1 (MQ=255) tGCCGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAATGACGGATTCGCGGCGGCGCGCGGAGTCCTg > 2:1842459/1‑100 (MQ=255) gCCGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATgg > 2:850742/1‑100 (MQ=255) gCCGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATgg > 2:3509917/1‑100 (MQ=255) ccGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGATTCATGGt > 2:453734/1‑100 (MQ=255) ccGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGt < 2:2763976/100‑1 (MQ=255) ccGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGt < 2:3895847/100‑1 (MQ=255) ccGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGt < 2:2027239/100‑1 (MQ=255) gAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTg < 1:3349779/100‑1 (MQ=255) gAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTg > 2:19838/1‑100 (MQ=255) gAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTg < 2:20089/100‑1 (MQ=255) gAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTg < 1:117546/100‑1 (MQ=255) gAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTg > 1:425534/1‑100 (MQ=255) gAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCGGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTg < 1:2001992/100‑1 (MQ=255) gAGGTACAGGCAAGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGTGTTTGAGCGGGTGATTTTGAGGTTACCGGAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGAAGTCATGGTTg < 2:1593211/100‑1 (MQ=255) tggTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGa < 2:238465/99‑1 (MQ=255) aGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGa < 2:124138/100‑1 (MQ=255) ggTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGaa > 1:242341/1‑100 (MQ=255) ggTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGaa > 1:3891083/1‑100 (MQ=255) gTACAGGCACGCCTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAag < 2:1645951/100‑1 (MQ=255) gTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGACGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGGCATGGTTGAag > 1:3459525/1‑100 (MQ=255) tACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAaga > 1:2207297/1‑100 (MQ=255) aCAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGATTCATGGTTGAagag > 2:1782056/1‑100 (MQ=255) aCAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAagag > 2:3976661/1‑100 (MQ=255) aCAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTGGGCGAGTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAagag < 1:152456/100‑1 (MQ=255) aGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGaa < 1:1385150/100‑1 (MQ=255) aGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGaa > 1:3945294/1‑100 (MQ=255) ggCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAAt > 2:2538934/1‑100 (MQ=255) gCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAAtt > 1:2473414/1‑100 (MQ=255) gCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAAtt > 1:4045698/1‑100 (MQ=255) gCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAAtt > 2:517210/1‑100 (MQ=255) cACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTc > 1:350575/1‑100 (MQ=255) cGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCg > 1:1768913/1‑100 (MQ=255) cGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCg < 1:1250783/100‑1 (MQ=255) gACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGt < 1:3295611/100‑1 (MQ=255) aCTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGtt > 1:1566403/1‑100 (MQ=255) aCTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGtt < 2:132038/100‑1 (MQ=255) aCTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGtt > 2:3422791/1‑100 (MQ=255) tCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTAc < 1:1018730/100‑1 (MQ=255) ccAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACa > 1:519270/1‑100 (MQ=255) ccAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACa > 1:955248/1‑100 (MQ=255) cAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAg < 1:3912277/100‑1 (MQ=255) cAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAg < 1:2300011/100‑1 (MQ=255) cAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAg > 1:1622544/1‑100 (MQ=255) cAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAg < 1:1848849/100‑1 (MQ=255) aGCCCCGGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGGTACAgg < 2:3479543/100‑1 (MQ=255) ccTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTa > 1:1002550/1‑100 (MQ=255) ccTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTa < 2:2049311/100‑1 (MQ=255) ccTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTa < 2:1837246/100‑1 (MQ=255) cTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGAGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTAc > 2:2468633/1‑100 (MQ=255) tGGGGGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACa < 2:3528927/100‑1 (MQ=255) tGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACa > 1:2751241/1‑100 (MQ=255) gggCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACAt < 2:463919/100‑1 (MQ=255) gggCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACAt < 1:371925/100‑1 (MQ=255) gCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGc > 1:84408/1‑100 (MQ=255) aTGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGt < 1:1934790/100‑1 (MQ=255) aTGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGt < 2:3158208/100‑1 (MQ=255) gTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAg < 1:1531829/100‑1 (MQ=255) ttGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAgg < 1:2491062/100‑1 (MQ=255) ttGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCACGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAgg < 1:3766892/100‑1 (MQ=255) tGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGa > 2:2301249/1‑100 (MQ=255) cGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTc > 2:1119237/1‑100 (MQ=255) cGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTc > 2:3480819/1‑100 (MQ=255) cGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGCGAGTCATGGTTGGAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTc > 2:1859213/1‑100 (MQ=255) gATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCa > 1:1420342/1‑100 (MQ=255) aTTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCan < 1:3241034/100‑2 (MQ=255) aTTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCAc > 2:220085/1‑100 (MQ=255) ttGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACg < 2:1028443/100‑1 (MQ=255) ttGCGCGGGTGATTTTGCGGGGAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACg < 2:660832/100‑1 (MQ=255) gcgcGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGt < 1:650818/100‑1 (MQ=255) gcgGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAg < 2:73565/100‑1 (MQ=255) cgGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGt > 2:2098985/1‑100 (MQ=255) ggTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTa > 1:2938048/1‑100 (MQ=255) ggTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTa > 1:600265/1‑100 (MQ=255) gTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACACGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTaa < 1:3277957/100‑1 (MQ=255) tGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAAc < 2:1275795/100‑1 (MQ=255) tGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAAc < 1:114125/100‑1 (MQ=255) ttGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGa > 1:842754/1‑100 (MQ=255) tGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGAt < 2:2723485/100‑1 (MQ=255) tGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGAt < 1:2778969/100‑1 (MQ=255) cGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATcc > 1:1997220/1‑100 (MQ=255) gggTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCa > 2:913117/1‑100 (MQ=255) gggTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGGTGAAGAGAATTCCGTTAGAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGGAGTTAACGGTGATCCa > 2:2827740/1‑100 (MQ=255) gTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGt < 1:1872525/100‑1 (MQ=255) tAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTa < 1:2257349/100‑1 (MQ=255) aaCGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAg > 2:290842/1‑100 (MQ=255) gAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGATTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCg < 1:1923050/100‑1 (MQ=255) gAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCg > 2:1937304/1‑100 (MQ=255) ggTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTAc > 2:115075/1‑100 (MQ=255) ggTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTAc < 2:82991/100‑1 (MQ=255) ggTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGCCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTAAAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTAc > 1:2120610/1‑100 (MQ=255) gTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACa > 1:1782264/1‑100 (MQ=255) gTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACa > 1:2965/1‑100 (MQ=255) tttCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAg > 2:3189026/1‑100 (MQ=255) ccgcGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTgg < 2:1395261/100‑1 (MQ=255) cgcggcgcggGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTGGc > 2:3430564/1‑100 (MQ=255) cggcgcggGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTGGCGa < 1:1122929/100‑1 (MQ=255) gcgcggGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTGGCGAcc < 2:1419250/100‑1 (MQ=255) cgcggGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTGGCGACCg > 2:1001413/1‑100 (MQ=255) cggGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTGGCGACCGCa > 2:1255354/1‑100 (MQ=255) | TATTGCCGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGATTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTGGCGACCGCATA > NC_000913/2127654‑2127846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |