| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,318,639 | A→C | F413C (TTT→TGT) | rcsC ← | hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,318,639 | 0 | A | C | 99.3% | 492.6 / ‑4.2 | 139 | F413C (TTT→TGT) | rcsC | hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base C (76/62); total (77/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.60e-01 | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
TCCACCAGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACAAAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTAAAATAT > NC_000913/2318543‑2318738 | tCCACCAGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAAt > 2:551296/1‑100 (MQ=255)tCCACCAGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAAt < 2:1014716/100‑1 (MQ=255) caccaGCACACAAATGGCCACGTTTTCCATACGATAACGCGAATCGACGCTGCAGACTCACAGACTAGTATTGTTCCTGCTCAGGACATCCACACAAttt > 2:1806854/1‑99 (MQ=255) caccaGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTg > 1:882743/1‑100 (MQ=255) accaGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGa > 2:1090638/1‑100 (MQ=255) caGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTTCTATAGCGCGAAGGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGTcc < 2:692379/100‑1 (MQ=255) caGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGAcc < 2:2980995/100‑1 (MQ=255) caGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGAcc < 2:1671559/100‑1 (MQ=255) aGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACct > 1:1026324/1‑100 (MQ=255) aGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACct < 2:2093799/100‑1 (MQ=255) gCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCGGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACctg < 2:955141/100‑1 (MQ=255) cacacaAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACctgc < 2:650812/100‑1 (MQ=255) cacaAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACctgctg > 2:3174334/1‑100 (MQ=255) cacaAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACctgctg > 1:2306078/1‑100 (MQ=255) cacaAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACctgctg > 2:1272201/1‑100 (MQ=255) cacaAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGAGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACctgctg > 1:3271000/1‑100 (MQ=255) gaactGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGAGGGGTATTGTCGCTGGTCACGACATGACCACAATTTGCCTGCTGcc > 2:347614/5‑100 (MQ=255) tGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCcaca < 1:1206066/100‑1 (MQ=255) tGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTCACCTGCTGCCcaca > 1:2999533/1‑100 (MQ=255) ggCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGACTGGACGAAGCTGATTTGCAGCTTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCcacga > 2:3979484/1‑98 (MQ=255) ggCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAAGGGACGAAGCAGATTCGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAg < 2:3851363/100‑1 (MQ=255) tccACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGa < 2:3177475/99‑1 (MQ=255) gCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGa > 1:4064904/1‑100 (MQ=255) ccACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGAt > 2:2975565/1‑100 (MQ=255) ccACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGAt > 2:632036/1‑100 (MQ=255) ccACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGAt > 1:2196311/1‑100 (MQ=255) cACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATa > 2:2287103/1‑100 (MQ=255) cGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAAt < 2:253361/100‑1 (MQ=255) ttttCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAAttt < 2:2115204/100‑1 (MQ=255) cATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGt > 2:248949/1‑100 (MQ=255) ataaCGATGGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACCATTGACCTGCTGCCCACAGATAAGTTGCGtn < 2:3073907/97‑2 (MQ=255) aTTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTc > 1:2458100/1‑100 (MQ=255) aTTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTc > 1:258216/1‑100 (MQ=255) aTTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTc > 2:3540659/1‑100 (MQ=255) aTTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTc > 2:2944938/1‑100 (MQ=255) tACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAg > 2:2854906/1‑100 (MQ=255) cGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTc > 2:3121883/1‑100 (MQ=255) gATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCg < 2:773926/100‑1 (MQ=255) gcgcGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTgg > 1:2955785/1‑100 (MQ=255) gcgcGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTCGCGTCAGTCGTTgg > 1:3163877/1‑100 (MQ=255) cgcgAATGGACGAAGCTGCTTTCCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCACTCGTTGGc > 2:787594/1‑100 (MQ=255) cgcgAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGc < 2:1984877/100‑1 (MQ=255) cgcgAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGc < 1:3914313/100‑1 (MQ=255) cgcgAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGc > 2:2689803/1‑100 (MQ=255) cgAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCgg > 2:1160471/1‑100 (MQ=255) gAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGt > 1:1561431/1‑100 (MQ=255) gAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACAAAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGt > 1:1984743/1‑100 (MQ=255) aaTGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCGCCAGGTAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGtg > 2:936975/1‑99 (MQ=255) aaTGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTc > 1:1124954/1‑100 (MQ=255) tctgACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTcc < 1:2356340/97‑1 (MQ=255) aTGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTcc < 2:482855/100‑1 (MQ=255) tGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCt < 2:1362022/100‑1 (MQ=255) tGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCt < 1:2583608/100‑1 (MQ=255) gACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTccaga > 2:2320108/1‑97 (MQ=255) cGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGTCCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCCCATg < 2:844917/100‑1 (MQ=255) cGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATg > 2:360939/1‑100 (MQ=255) cTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTaa > 2:3900322/1‑100 (MQ=255) tGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAg > 1:133651/1‑100 (MQ=255) gATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACGTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGc > 1:3583367/1‑100 (MQ=255) aTTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCa < 1:144098/100‑1 (MQ=255) aTTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCa < 1:3421927/100‑1 (MQ=255) tttGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCat > 2:1990033/1‑100 (MQ=255) tGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCatat > 2:3713821/1‑100 (MQ=255) cAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCTTACGCatgagg > 1:2396502/1‑96 (MQ=255) cAGATTGGTATTGATGCTGGTCAGGACCTCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCGTGCGTAAGCATATTg > 2:3744265/1‑100 (MQ=255) aGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTga < 2:3252078/100‑1 (MQ=255) aGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTga < 2:617907/100‑1 (MQ=255) aGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTga < 2:3738814/100‑1 (MQ=255) gATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTgag < 1:1767279/100‑1 (MQ=255) gATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTgag > 1:3225911/1‑100 (MQ=255) gATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTgag > 1:1612457/1‑100 (MQ=255) tGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATa < 2:1597680/100‑1 (MQ=255) ggTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAg > 1:1609752/1‑100 (MQ=255) ggTATTGTTGCTGGTCAGGACAGCAACACAATTGACCTGCTGCCCACATATAATTTGCGTCAGTCGTGGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAg < 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ttgCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATgcg < 1:3590346/100‑1 (MQ=255) tgCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATgcgc > 2:301464/1‑100 (MQ=255) gCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGcc > 1:1556545/1‑100 (MQ=255) tGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAg < 1:455963/100‑1 (MQ=255) tGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAg < 2:1089988/100‑1 (MQ=255) cAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCg > 2:1718128/1‑100 (MQ=255) ggACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGtt < 1:3931940/100‑1 (MQ=255) aCATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTAc < 2:3014859/100‑1 (MQ=255) aCATCAACACAATTGACCGGCTGCCCACAGATAATTTTCGTCAGGCGTGGGCGTTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTAc < 1:4079517/100‑1 (MQ=255) cATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGAGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACt > 1:1938171/1‑100 (MQ=255) aTCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACtt > 2:3709487/1‑100 (MQ=255) tCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTa < 2:1782519/100‑1 (MQ=255) tCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTa < 1:1069175/100‑1 (MQ=255) caacacAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCGTATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTaa > 1:2015652/1‑100 (MQ=255) caacacAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTaa > 1:829325/1‑100 (MQ=255) caacacAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCAAGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTaa > 2:2746498/1‑100 (MQ=255) aacacAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTaaa < 1:151591/100‑1 (MQ=255) acacAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTaaaa > 2:1175184/1‑100 (MQ=255) aaaTTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTAAAatat > 1:915684/1‑100 (MQ=255) | TCCACCAGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACAAAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTAAAATAT > NC_000913/2318543‑2318738 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |