| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,423,570 | A→C | intergenic (‑31/+166) | yfcI ← / ← hisP | transposase_31 family protein/histidine ABC transporter ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,423,570 | 0 | A | C | 99.3% | 492.1 / ‑4.1 | 142 | intergenic (‑31/+166) | yfcI/hisP | transposase_31 family protein/histidine ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base C (62/79); total (62/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TGGATGGCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGACGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACTTTTAC > NC_000913/2423477‑2423665 | tGGATGGCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGAc < 2:3485529/100‑1 (MQ=255) ggATGGCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACa < 1:2955694/100‑1 (MQ=255) ggATGGCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACa > 1:416609/1‑100 (MQ=255) ggCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATaa > 2:749830/1‑100 (MQ=255) ggCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATaa < 1:3683170/100‑1 (MQ=255) ggCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATaa < 1:1584237/100‑1 (MQ=255) cGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAAcc > 2:491788/1‑100 (MQ=255) gTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCa > 1:26380/1‑100 (MQ=255) gTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCa > 1:3169601/1‑100 (MQ=255) aaaaaaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACg < 2:1927336/100‑1 (MQ=255) aaaaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGAt > 1:2468285/1‑100 (MQ=255) aaaaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGAt > 1:2264050/1‑100 (MQ=255) aaaaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGAt < 2:2689213/100‑1 (MQ=255) aaaaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGAt > 1:1331963/1‑100 (MQ=255) aaaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGAtt < 2:84799/100‑1 (MQ=255) aaaGATTCAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCTACAATAACCACGAtt < 2:3035450/100‑1 (MQ=255) aaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTa < 2:460986/100‑1 (MQ=255) aaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTa < 1:1166557/100‑1 (MQ=255) gATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCTAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAac < 1:3785158/100‑1 (MQ=255) aTTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACACTAACCACGATTAaca > 2:1201952/1‑100 (MQ=255) aTTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAaca < 1:3269018/100‑1 (MQ=255) tttAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAacac < 1:723964/100‑1 (MQ=255) ttAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACAcc > 1:2580547/1‑100 (MQ=255) tAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACAccc > 2:822636/1‑100 (MQ=255) aaaTACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACAcccc > 2:1117343/1‑99 (MQ=255) aaaTACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCa > 2:3122674/1‑100 (MQ=255) aaaTACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCa > 1:1749006/1‑100 (MQ=255) aaaTACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCa < 1:212536/100‑1 (MQ=255) aaTACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCaa < 2:2514753/100‑1 (MQ=255) aaTACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCaa > 2:228404/1‑100 (MQ=255) aTACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAAt > 1:3714292/1‑100 (MQ=255) aCCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgc < 2:2729965/100‑1 (MQ=255) aCCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgc < 2:2306045/100‑1 (MQ=255) aCCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGACGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgc < 1:1084731/100‑1 (MQ=255) ccGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgca > 2:2510198/1‑100 (MQ=255) ccGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgca < 2:1628431/100‑1 (MQ=255) cGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACCATAACCACGCTTAACACCCAATgccg > 2:2100331/1‑98 (MQ=255) cGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgcag > 1:1236804/1‑100 (MQ=255) cGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgcag < 1:2313918/100‑1 (MQ=255) gCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgcagc < 2:2236912/100‑1 (MQ=255) gCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgcagc < 1:1913266/100‑1 (MQ=255) catcatGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgcagca < 1:2017261/100‑1 (MQ=255) tcatGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACACAATGCCgcagg < 2:692205/100‑1 (MQ=255) catGCGGCGTGGAAGTTGTCGATAGTGACATGGCGTTCCGTCACCCCCCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAgcaggc > 2:1608823/1‑100 (MQ=255) gcggcgCGGAAGTTTTTGATATTTGAAGGGCGTGCCGTCACCCCGTAAATATAATACCCGGCGTCAACAACCACGATTAACACCCAATGCAgccgccagg < 2:3757795/100‑2 (MQ=255) ggcgTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGttt < 1:1030741/100‑1 (MQ=255) cgTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGttttt < 2:2043162/100‑1 (MQ=255) cgTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGttttt > 2:1688779/1‑100 (MQ=255) gTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTa < 2:3891850/100‑1 (MQ=255) gTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTa < 1:595935/100‑1 (MQ=255) ggAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATc < 2:3056972/100‑1 (MQ=255) ggAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATc > 1:2531975/1‑100 (MQ=255) aaGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCACTCAAATTTAAGATGCCGCGACACTAACAACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTCTTTATCtt > 2:1774307/1‑100 (MQ=255) aGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCttt > 2:3358549/1‑100 (MQ=255) gTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTg < 2:3054317/100‑1 (MQ=255) ttGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTgg < 2:173641/100‑1 (MQ=255) gTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGAc > 1:4002183/1‑100 (MQ=255) gTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACACCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGAc < 1:2163583/100‑1 (MQ=255) cGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAg > 2:3497786/1‑100 (MQ=255) gATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGc < 1:3195358/100‑1 (MQ=255) tGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAAtt > 1:2307494/1‑100 (MQ=255) ttCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTc < 1:556073/99‑1 (MQ=255) tCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCa > 2:544885/1‑100 (MQ=255) tCAGGGCGTACCGTCACCCCTCAACGTTAGGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCa < 2:1844390/100‑1 (MQ=255) aTGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGa > 1:3908320/1‑100 (MQ=255) aTGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGa < 2:758016/100‑1 (MQ=255) aTGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTGAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGa < 2:2815853/100‑1 (MQ=255) tGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGaa < 2:3586839/100‑1 (MQ=255) ggCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAg < 1:2285372/100‑1 (MQ=255) ggCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAg < 1:46096/100‑1 (MQ=255) ggCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAg < 1:1372973/100‑1 (MQ=255) ggCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCAACAATAACCACGATTAACCCCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAg < 2:2036030/100‑1 (MQ=255) cGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTa > 2:567529/1‑100 (MQ=255) ccGTCACCCCTCTAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGACTTCAGAAGTAtgtt > 1:1839817/1‑100 (MQ=255) cGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTAttttt > 2:3611512/1‑100 (MQ=255) gTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTa > 1:1524979/1‑100 (MQ=255) tCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAg < 1:334076/100‑1 (MQ=255) cACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGc < 2:1763402/100‑1 (MQ=255) aCCGCTCAAATTTAAGATGCGGCGACAATAACCAGCATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTCGAGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTcgcg < 2:2479472/100‑1 (MQ=255) ccccTGAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCGGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCgg < 1:3869119/100‑1 (MQ=255) cccTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGa > 1:3596236/1‑100 (MQ=255) cccTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGa > 1:2230465/1‑100 (MQ=255) cacTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAAAGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTGTAGCGGa > 2:3711876/3‑100 (MQ=255) ccTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACTCAATTGAGCAGGCAGTTTATATCTTTGGACATCGAATTCAGAAGTATCTTTAGCTGAc > 2:3406289/1‑100 (MQ=255) ccTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGAc < 2:3970720/100‑1 (MQ=255) ccTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGAc < 1:242873/100‑1 (MQ=255) ccTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGAc < 2:2292980/100‑1 (MQ=255) tCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTg < 2:2975187/100‑1 (MQ=255) cAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTGTCTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGt > 1:1590585/1‑100 (MQ=255) aaaTTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTa < 1:2567163/100‑1 (MQ=255) aaTTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTaa > 2:3982182/1‑100 (MQ=255) tttAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACt < 1:965250/100‑1 (MQ=255) ttAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCCGTCTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACtt > 1:3452759/1‑100 (MQ=255) ttAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACtt > 1:1657146/1‑100 (MQ=255) tAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACttt < 1:16101/100‑1 (MQ=255) aaGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACtttt < 1:2632117/100‑1 (MQ=255) aGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACTTTTa < 1:1491882/100‑1 (MQ=255) gATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACTTTTAc < 2:3374472/100‑1 (MQ=255) gATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACTTTTAc < 2:3254959/100‑1 (MQ=255) gATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACTTTTAc > 1:17837/1‑100 (MQ=255) | TGGATGGCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGACGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACTTTTAC > NC_000913/2423477‑2423665 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |