| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 299,214 | A→C | F574C (TTC→TGC) | paoC ← | PaoABC aldehyde oxidoreductase, Moco‑containing subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 299,214 | 0 | A | C | 98.0% | 505.7 / 0.8 | 148 | F574C (TTC→TGC) | paoC | PaoABC aldehyde oxidoreductase, Moco‑containing subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base C (80/65); total (82/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACT > NC_000913/299118‑299310 | cGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCAtt > 1:173482/1‑100 (MQ=255) ccGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCa > 1:1414018/1‑100 (MQ=255) ggACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAAt < 1:2918930/100‑1 (MQ=255) ccGAGCTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctc < 1:4065370/100‑1 (MQ=255) ccGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctn < 1:3260452/100‑2 (MQ=255) cGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctct > 1:477075/1‑100 (MQ=255) cGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctct < 2:1774358/100‑1 (MQ=255) cGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctct > 2:2508772/1‑100 (MQ=255) cGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctct > 1:2232264/1‑100 (MQ=255) cTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTc > 2:736951/1‑100 (MQ=255) ttCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTcc < 2:2653683/100‑1 (MQ=255) tctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCg > 1:1325787/1‑100 (MQ=255) tcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCt > 2:3380268/1‑100 (MQ=255) cccGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTg < 1:856871/100‑1 (MQ=255) cccGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTg < 2:2896443/100‑1 (MQ=255) cGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTc > 2:3729279/1‑100 (MQ=255) gTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCa > 1:2661408/1‑100 (MQ=255) tCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAg < 1:3920088/100‑1 (MQ=255) gcTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTg > 2:1899886/1‑100 (MQ=255) tATGCACGCCGACCTACACAAAATGCTCGGCAAAGCTCGACTGCTGGTACTATCTGCTAAGTCTTCCGCATTCACAGCTCGCTTCCGCTCCCAGtgttcc > 2:3625167/1‑95 (MQ=255) tGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgc > 2:3536740/1‑100 (MQ=255) gCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgcc > 2:1582635/1‑100 (MQ=255) aCGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTg > 1:3709645/1‑100 (MQ=255) cGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGc > 1:1670107/1‑100 (MQ=255) cGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGc > 2:1490974/1‑100 (MQ=255) cGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGc < 1:143918/100‑1 (MQ=255) cGCCGACCTCCACAAAAGGCCCGGCAAAGTTGGACGGCGGGTCCTTTTTTCGCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCTGCTGTCAGTCTGCCGCCTGc < 2:3991885/100‑1 (MQ=255) gCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCg < 1:801962/100‑1 (MQ=255) gACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTg < 2:1642338/100‑1 (MQ=255) gACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTg < 1:1706248/100‑1 (MQ=255) ccTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGTCGCCTGCGGTGGc < 1:760488/100‑1 (MQ=255) ccTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGc > 2:3138385/1‑100 (MQ=255) ccTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGc > 1:2360423/1‑100 (MQ=255) cTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCt > 1:3442921/1‑100 (MQ=255) cTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCt < 1:3990623/100‑1 (MQ=255) tCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCtt > 2:1358266/1‑100 (MQ=255) ccACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTGCGCATTCAATGCTCTCTTCCACTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTc > 2:3936599/1‑100 (MQ=255) cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 2:1342942/100‑1 (MQ=255) cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 2:915599/100‑1 (MQ=255) cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 1:2373144/100‑1 (MQ=255) caAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCTCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATg < 2:72827/100‑1 (MQ=255) caAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATg > 1:3118604/1‑100 (MQ=255) caAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATg > 1:253203/1‑100 (MQ=255) caAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTACTGCTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCCTTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATg < 2:2609658/100‑1 (MQ=255) aaaTGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTa > 2:347001/1‑100 (MQ=255) cccGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTg > 1:3572143/1‑100 (MQ=255) ccGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTgg < 2:2378722/100‑1 (MQ=255) cGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc < 2:2620871/100‑1 (MQ=255) cGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc > 2:1309653/1‑100 (MQ=255) cGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc > 2:1101685/1‑100 (MQ=255) cGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc < 1:2290237/100‑1 (MQ=255) cGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc > 2:558392/1‑100 (MQ=255) cGGCAAAGGCCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCATCCGCTGGCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc < 2:3048460/100‑1 (MQ=255) cAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCt > 2:1715171/1‑100 (MQ=255) aaaGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGCCTTCATGTAGCGTGGCGCtt < 2:1018896/100‑1 (MQ=255) aaGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTc > 2:3362120/1‑100 (MQ=255) ggTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCgg < 2:2884150/100‑1 (MQ=255) gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg < 1:3483714/100‑1 (MQ=255) gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg < 1:1554163/100‑1 (MQ=255) gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg > 1:3070105/1‑100 (MQ=255) gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg > 1:1201654/1‑100 (MQ=255) gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg < 2:2052449/100‑1 (MQ=255) cGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTa < 1:3798447/100‑1 (MQ=255) aCTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTAcc < 1:1248469/100‑1 (MQ=255) aCTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTAcc < 2:1669012/100‑1 (MQ=255) gctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGtt > 1:2432580/1‑100 (MQ=255) gctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTCCGGGTACCGtt > 2:3191674/1‑100 (MQ=255) ctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTg < 2:22410/100‑1 (MQ=255) ctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTg < 1:1953444/100‑1 (MQ=255) tgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg > 2:872021/1‑100 (MQ=255) tgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg < 1:1050398/100‑1 (MQ=255) tgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg > 1:3442988/1‑100 (MQ=255) tgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg < 2:338141/100‑1 (MQ=255) ggTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGt > 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tctTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCt > 1:4019944/1‑100 (MQ=255) ctTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCtt > 2:2333002/1‑100 (MQ=255) tttGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTg < 1:3165736/100‑1 (MQ=255) tttGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTg > 2:2005936/1‑100 (MQ=255) tttGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTg > 2:2716039/1‑100 (MQ=255) cTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGt > 2:670022/1‑100 (MQ=255) cTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGt > 1:355649/1‑100 (MQ=255) cTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGt > 1:907306/1‑100 (MQ=255) cAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCg < 1:2852779/100‑1 (MQ=255) cAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCg > 1:331476/1‑100 (MQ=255) aGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCgg < 1:1347564/100‑1 (MQ=255) aGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCgg < 2:3357945/100‑1 (MQ=255) aGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCgg < 1:3906698/100‑1 (MQ=255) tgtTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCa < 1:1034106/100‑1 (MQ=255) gtTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCaa > 1:1004901/1‑100 (MQ=255) tCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAAc > 1:4019362/1‑100 (MQ=255) tCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAAc > 2:473744/1‑100 (MQ=255) tCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAAc > 1:2078678/1‑100 (MQ=255) ccGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACt > 2:1608732/1‑100 (MQ=255) | CGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACT > NC_000913/299118‑299310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |