Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,698,520 | A→C | T103P (ACC→CCC) | bcsG → | DUF3260 family cellulose production inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,698,520 | 0 | A | C | 96.6% | 492.6 / 2.4 | 151 | T103P (ACC→CCC) | bcsG | DUF3260 family cellulose production inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/3); new base C (76/68); total (79/72) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.69e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.63e-01 |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
TGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAAT > NC_000913/3698423‑3698616 | tGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTccc < 1:739535/100‑1 (MQ=255) gCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCg > 1:4034320/1‑100 (MQ=255) gCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGCAAACCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGACGGGGTTCAGTCCCg > 2:3811619/1‑100 (MQ=255) cccTGCCGATCGGCTTTGCTTCGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGa > 1:3483414/1‑100 (MQ=255) ccTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGat < 2:1808938/100‑1 (MQ=255) cTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGatt > 2:1390066/1‑100 (MQ=255) cTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGatt < 1:3527589/100‑1 (MQ=255) cTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGatt > 1:1511837/1‑100 (MQ=255) tGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGatta > 1:455122/1‑100 (MQ=255) gCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGattat > 2:1500902/1‑100 (MQ=255) gCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGattat < 1:120751/100‑1 (MQ=255) aTCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGTATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGCTTCAGTCCCGATTATTTaa > 2:1191046/1‑100 (MQ=255) aTCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTaa < 1:2607730/100‑1 (MQ=255) cGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATc < 2:2854090/100‑1 (MQ=255) cGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATc > 1:1708487/1‑100 (MQ=255) ggCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCg < 2:207916/100‑1 (MQ=255) ggCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCg > 1:257402/1‑100 (MQ=255) ggCTTTGCTTTGTTCTGCCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCACAGGGGGCGGGGTGCAGTCCCGATTATTTaagct > 2:233801/1‑97 (MQ=255) ggCTTTGCGTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTTGCGGGGTTCAGTCCCAAATATTTAATCg < 2:651424/100‑1 (MQ=255) tttgctttgTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGAcc < 1:1677149/100‑1 (MQ=255) gctttgTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTGCCGATTATTTAATCGACCTTg > 2:791714/1‑100 (MQ=255) gctttgTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTg < 1:875997/100‑1 (MQ=255) ctttgTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGt > 1:3637764/1‑100 (MQ=255) ctttgTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCAGAAAGCATAATGAGCCAGAGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCGGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGt > 1:3792979/1‑100 (MQ=255) tttgTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTc < 1:2482849/100‑1 (MQ=255) tttgTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTc < 2:1710869/100‑1 (MQ=255) tttgTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGCCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTCATCGACCTTGTc < 2:1728831/100‑1 (MQ=255) ttgTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTca < 1:1921063/100‑1 (MQ=255) tgTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCGAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAGTCGACCTTGTcac < 2:3601771/100‑1 (MQ=255) tgTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTcac < 1:2730723/100‑1 (MQ=255) tgTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTcac < 2:1038353/100‑1 (MQ=255) tgTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTcac < 1:183736/100‑1 (MQ=255) gTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTcaca > 1:2324498/1‑100 (MQ=255) tCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACg < 1:228193/100‑1 (MQ=255) tGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCt < 1:732836/100‑1 (MQ=255) gacATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGATCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCtt > 2:3706622/3‑100 (MQ=255) gCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCttt > 2:1080938/1‑100 (MQ=255) atctcacCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTttat < 1:1080034/96‑1 (MQ=255) aTGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTttat > 1:3181048/1‑100 (MQ=255) aTGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTttat < 1:3528742/100‑1 (MQ=255) aTGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTttat > 1:2860982/1‑100 (MQ=255) aTGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTttat < 1:1475842/100‑1 (MQ=255) tGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTttatt < 1:3745909/100‑1 (MQ=255) tGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTttatt < 2:3143389/100‑1 (MQ=255) tGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTttatt < 2:446480/100‑1 (MQ=255) cacCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTttatagat > 2:1058078/1‑96 (MQ=255) cacCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAAc < 2:1158823/100‑1 (MQ=255) acCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACt > 1:2869988/1‑100 (MQ=255) ccTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATATAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTg < 1:3269080/100‑1 (MQ=255) tGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGc < 2:2826788/100‑1 (MQ=255) tGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGc < 1:1041803/100‑1 (MQ=255) gTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAg > 1:264296/1‑100 (MQ=255) gCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAgatg > 1:875445/1‑100 (MQ=255) gCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAgatg > 1:1007894/1‑100 (MQ=255) ccTGGCCCGGAAAGCATAATGCGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAgatga < 2:1237102/100‑1 (MQ=255) ccTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAgatga > 2:2813187/1‑100 (MQ=255) tGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGAtt < 1:2499240/100‑1 (MQ=255) tGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGAtt < 1:185946/100‑1 (MQ=255) cccGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGCCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTggg < 2:1649976/100‑1 (MQ=255) ccGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTgggg > 1:1588438/1‑100 (MQ=255) ccGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATGgggg > 2:687111/1‑100 (MQ=255) ccGGAAAGCAGAATGGGCCGGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCGCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTCGCTGGCAGATGATTgggg < 2:2466110/100‑1 (MQ=255) ggAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGcc > 1:3316153/1‑100 (MQ=255) aaGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCAtt > 1:45096/1‑100 (MQ=255) gCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCAtttt > 1:3917241/1‑100 (MQ=255) tAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGt > 2:1653992/1‑100 (MQ=255) aTGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGttt < 1:886834/100‑1 (MQ=255) aTGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATGGGGGCCATTTTTGttt > 2:603819/1‑100 (MQ=255) tGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGtttt > 2:2936431/1‑100 (MQ=255) tGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGtttt > 1:2605245/1‑100 (MQ=255) gAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTtta < 2:3703638/100‑1 (MQ=255) aGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGGTGAGTGGGGCCATTTTTGTTttat > 2:390742/1‑100 (MQ=255) aGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTttat < 1:575440/100‑1 (MQ=255) aGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTttat < 1:3071859/100‑1 (MQ=255) gCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTttatt > 1:2023232/1‑100 (MQ=255) gCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTttatt < 2:2665135/100‑1 (MQ=255) gCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTttatt > 1:3914984/1‑100 (MQ=255) gCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTttatt > 1:3757115/1‑100 (MQ=255) ccAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGCGGCCATttttttttttttt > 2:3572936/1‑99 (MQ=255) cAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAg > 2:2701419/1‑100 (MQ=255) cAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAg < 2:1800281/100‑1 (MQ=255) gTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGc < 1:3945145/100‑1 (MQ=255) gTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGc > 2:3239006/1‑100 (MQ=255) gCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTgg < 2:222373/100‑1 (MQ=255) gCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTgg > 1:2930578/1‑100 (MQ=255) gCAGGTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTgg > 2:3859193/1‑100 (MQ=255) cAGGTGGCGGGGTGCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGt < 2:3132633/100‑1 (MQ=255) ggTGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTa > 2:1530301/1‑100 (MQ=255) tGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTAtt > 1:2895851/1‑100 (MQ=255) tGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTAtt < 1:2170255/100‑1 (MQ=255) tGGCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTAtt > 1:1787270/1‑100 (MQ=255) ggCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTc > 2:2332034/1‑100 (MQ=255) gCGGGGTTGAGCCACGATTATTCGATCGACGGTGTCGCTCGTTTTTTTAGCTGGCTTATGAGTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCGTGGTTATTcc < 2:3218842/100‑1 (MQ=255) gCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTcc < 1:3526611/100‑1 (MQ=255) gCGGGGTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTcc < 1:3828873/100‑1 (MQ=255) gggTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGt > 2:3808380/1‑100 (MQ=255) gTTCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTGATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTca > 1:3410012/1‑100 (MQ=255) ttCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTTTTTTTTTTTTCGCCTGGATATCCCTGTcac > 2:905791/1‑100 (MQ=255) ttCAGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTcac < 2:3951035/100‑1 (MQ=255) aGTCCCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTGATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAAt > 1:2210003/1‑100 (MQ=255) | TGCCCTGCCGATCGGCTTTGCTTTGTTCTGGCATGACACCTGGTTGCCTGGCCCGGAAAGCATAATGAGCCAGGGTTCGCAGGTGGCGGGGTTCAGTACCGATTATTTAATCGACCTTGTCACACGCTTTATTAACTGGCAGATGATTGGGGCCATTTTTGTTTTATTAGTGGCCTGGTTATTCCTGTCACAAT > NC_000913/3698423‑3698616 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |