| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,966,875 | T→G | S153S (TCT→TCG) | rho → | transcription termination factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,966,875 | 0 | T | G | 97.7% | 556.6 / ‑1.4 | 171 | S153S (TCT→TCG) | rho | transcription termination factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/2); new base G (77/89); total (80/91) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
TCGACAAACCTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCTACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCACCGCCGAAAGCCGGTAAAACC > NC_000913/3966778‑3966971 | tCGACAAACCTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGAc < 1:1061750/100‑1 (MQ=255)tCGACAAACCTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGAc < 2:3314528/100‑1 (MQ=255)tCGACAAACCTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGAc < 2:1978367/100‑1 (MQ=255) cGACAAACCTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACt > 1:81176/1‑100 (MQ=255) cGACAAACCTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACt > 1:3637462/1‑100 (MQ=255) cGACAAACCTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACt < 1:1946138/100‑1 (MQ=255) cGACAAACCTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACt > 1:1584724/1‑100 (MQ=255) gACAAACCTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTg > 2:2667186/1‑100 (MQ=255) cAAACCTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGaa > 2:2067354/1‑100 (MQ=255) aaaCCTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAg < 2:2671037/100‑1 (MQ=255) aaCCTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGCGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTACCGGTTCGACTAAAGa > 2:3169190/1‑100 (MQ=255) aaCCTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGa > 1:2759531/1‑100 (MQ=255) ccTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGAtt < 2:3435630/100‑1 (MQ=255) ccTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGAtt > 2:662070/1‑100 (MQ=255) cTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGAttt > 2:115871/1‑100 (MQ=255) tGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTa < 1:4027535/100‑1 (MQ=255) tGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTa > 1:1685786/1‑100 (MQ=255) tGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTa > 1:286206/1‑100 (MQ=255) gAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTaa > 2:189340/1‑100 (MQ=255) aaaaCGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGTGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAAc < 1:2640959/100‑1 (MQ=255) aaaaCGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAAc < 1:3819867/100‑1 (MQ=255) aaaaCGCCCGCAACAAAACCCTCCTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAACCTCTCCTCTGCGTATGGACCGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAAc < 2:1513879/100‑1 (MQ=255) aaCGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCTACTGAAGATTTAACTg > 2:2548963/1‑100 (MQ=255) cGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCt > 1:2253985/1‑100 (MQ=255) cGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCt < 2:1377379/100‑1 (MQ=255) gCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTc > 2:2531989/1‑100 (MQ=255) cccGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTcg > 1:3840558/1‑100 (MQ=255) ccGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTcgc > 2:264546/1‑100 (MQ=255) caacaaAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTa > 2:3183350/1‑100 (MQ=255) caaAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTg > 1:652518/1‑100 (MQ=255) aaaaTCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTgg < 2:1557895/100‑1 (MQ=255) aaaaTCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTgg < 2:79800/100‑1 (MQ=255) aaaaTCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTgg < 1:1960925/100‑1 (MQ=255) aaaTCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGa > 1:1669614/1‑100 (MQ=255) aaTCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGAt > 1:2731312/1‑100 (MQ=255) aTCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATc < 2:905474/100‑1 (MQ=255) tCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCt < 1:2276422/100‑1 (MQ=255) ccTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCtn < 1:1279251/100‑2 (MQ=255) ccTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTg < 2:3221650/100‑1 (MQ=255) ctctTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTgg > 1:362349/1‑100 (MQ=255) ctctTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTgg > 2:1150584/1‑100 (MQ=255) tctTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGc > 1:208312/1‑100 (MQ=255) tctTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGc < 1:3345485/100‑1 (MQ=255) ttGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATc < 1:2905362/100‑1 (MQ=255) tGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCa < 1:3613225/100‑1 (MQ=255) agaACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCAcc < 2:2036917/100‑1 (MQ=255) agaACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCAcc < 1:300267/100‑1 (MQ=255) cTTACCCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATc < 1:3659574/100‑1 (MQ=255) cTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTAtn < 1:3253529/100‑2 (MQ=255) cTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATc < 2:1101677/100‑1 (MQ=255) cTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATc > 1:4026407/1‑100 (MQ=255) aaCCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGt < 2:367947/100‑1 (MQ=255) ccccGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCg > 1:3142267/1‑100 (MQ=255) ccccGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCg < 2:3858982/100‑1 (MQ=255) ccccGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGCGGTAACGGTTCAACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGtag > 2:1827463/1‑98 (MQ=255) cccGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGt < 1:3703092/100‑1 (MQ=255) ccGCGGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGAGGTAACGGTTCGGCTGAACATTTCACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTg < 2:758400/100‑1 (MQ=255) cGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCTACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTgg < 2:777784/100‑1 (MQ=255) cGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTgg < 1:2786847/100‑1 (MQ=255) cGCAAAGTCTCGTCGGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGt < 2:555532/100‑1 (MQ=255) cGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGt > 2:1296976/1‑100 (MQ=255) cGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGt < 1:1692282/100‑1 (MQ=255) cGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGt > 1:2201509/1‑100 (MQ=255) gCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTg > 1:3227391/1‑100 (MQ=255) gCAAACTCTCGTCAGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCACGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGATCGTGGTCAGCGta > 2:203300/1‑99 (MQ=255) cAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTgg > 2:3492421/1‑100 (MQ=255) 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1:2514438/100‑1 (MQ=255) gagtttGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGAtt < 1:1321059/95‑1 (MQ=255) cGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATtg > 2:1317108/1‑100 (MQ=255) gTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATtgt < 2:2924312/100‑1 (MQ=255) cTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTgg > 2:2883290/1‑100 (MQ=255) tGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGc < 2:2432093/100‑1 (MQ=255) gCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCa < 1:1341353/100‑1 (MQ=255) cGTATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCAc > 1:929630/1‑100 (MQ=255) gTATGGAACGGGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAAGTGCTCGCGTACTGGATCTGGCGTCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCAcc > 2:141875/1‑100 (MQ=255) tATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCAccg < 2:2717687/100‑1 (MQ=255) tATGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGATCTGATTGTGGCAccg > 2:3352668/1‑100 (MQ=255) acggAACGTGGTACCGGTTCGAATCAAGCTTTAACTGCTCGAGTTCTGAATCTTGCATCACCTTTCGCTCGTGGTCAGCGTGGTCAGACTGTGGCAccgc < 2:1578186/98‑1 (MQ=255) aTGGAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCAccgc > 1:348332/1‑100 (MQ=255) ggAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCAccgccg > 2:3005760/1‑100 (MQ=255) ggAACGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCAccgccg > 1:1524895/1‑100 (MQ=255) cGTGGTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCACCGCCGAAAg < 2:3045630/100‑1 (MQ=255) ggTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCACCGCCGAAAGCCg > 2:1713701/1‑100 (MQ=255) ggTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCACCGCCGAAAGCCg > 1:3226809/1‑100 (MQ=255) gTAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCACCGCCGAAAGCCgg < 1:1634519/100‑1 (MQ=255) tAACGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCACCGCCGAAAGCCGGt < 1:2243074/100‑1 (MQ=255) aaCGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCACCGCCGAAAGCCGGTa < 1:329368/100‑1 (MQ=255) aCGGTTCGACTGAAGAGTTAACTGCTTGAGGACTGGATCTGGCATCACCTATCGATCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCACCGCCGAAAGCCGGTaa < 2:3512116/100‑1 (MQ=255) cGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCACCGCCGAAAGCCGGTaaa > 2:3534465/1‑100 (MQ=255) cGGTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCACCGCCGAAAGCCGGTaaa < 1:1895725/100‑1 (MQ=255) ggTTCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCACCGCCGAAAGCCGGTaaaa < 1:2137203/100‑1 (MQ=255) ttCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCACCGCCGAAAGCCGGTAAAAcc > 1:2157359/1‑100 (MQ=255) ttCGACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCACCGCCGAAAGCCGGTAAAAcc > 2:3248536/1‑100 (MQ=255) | TCGACAAACCTGAAAACGCCCGCAACAAAATCCTCTTTGAGAACTTAACCCCGCTGCACGCAAACTCTCGTCTGCGTATGGAACGTGGTAACGGTTCTACTGAAGATTTAACTGCTCGCGTACTGGATCTGGCATCACCTATCGGTCGTGGTCAGCGTGGTCTGATTGTGGCACCGCCGAAAGCCGGTAAAACC > NC_000913/3966778‑3966971 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |