| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,190,100 | T→G | I105M (ATT→ATG) | yjaZ → | stationary phase growth adaptation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,190,100 | 0 | T | G | 98.6% | 486.7 / ‑2.9 | 139 | I105M (ATT→ATG) | yjaZ | stationary phase growth adaptation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base G (61/76); total (62/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
GCGCCTAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATTCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGGAAAAG > NC_000913/4190002‑4190196 | tcgcCTAACGAATCTCGACCCGTCAGCCAGCACCTGTATTTCTTAACGCGCGCACTCTTGAAAATAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCACCGTTATTc < 2:1659700/99‑1 (MQ=255) gcCTAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCAt < 2:3027462/100‑1 (MQ=255) ccTAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATg > 1:3031233/1‑100 (MQ=255) ccTAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATg > 1:3021687/1‑100 (MQ=255) cTAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGGTATAACTTAGCGCGCACACACTCAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTatgcatgc > 2:3807954/1‑100 (MQ=255) tAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGcc < 1:3504356/100‑1 (MQ=255) aaaGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGACCTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCg > 1:1397801/1‑100 (MQ=255) aaGCATCGCCTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATACCgg < 2:3381853/100‑1 (MQ=255) gAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGt > 2:2854789/1‑100 (MQ=255) aTCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTAt > 1:526589/1‑100 (MQ=255) aTCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTAt < 2:1309038/100‑1 (MQ=255) ctcGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATgg < 1:1280870/100‑1 (MQ=255) tcGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGACAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGt < 1:1881995/100‑1 (MQ=255) tcGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGt < 1:4082865/100‑1 (MQ=255) tcGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGt > 1:306916/1‑100 (MQ=255) tcGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACCGAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGt < 2:1818125/100‑1 (MQ=255) cGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTa > 2:331696/1‑100 (MQ=255) cGTCCCTTCTGCAAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTa > 2:3847825/1‑100 (MQ=255) gTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAg > 1:2460104/1‑100 (MQ=255) gTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAg > 1:3593326/1‑100 (MQ=255) ccTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTa > 2:1509414/1‑100 (MQ=255) ccTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTa > 1:2224398/1‑100 (MQ=255) cTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTAt < 1:589529/100‑1 (MQ=255) cTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTAt < 1:2014573/100‑1 (MQ=255) cTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTAt < 2:1036643/100‑1 (MQ=255) cTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTAt < 1:3725308/100‑1 (MQ=255) cTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTAt < 1:1207255/100‑1 (MQ=255) ttCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATg < 2:1405400/100‑1 (MQ=255) cTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGcc < 1:1354219/100‑1 (MQ=255) cTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGcc < 2:2053225/100‑1 (MQ=255) tGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCg < 2:754531/100‑1 (MQ=255) ccAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTg < 1:3560423/100‑1 (MQ=255) ccAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTg > 2:2936361/1‑100 (MQ=255) ccAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTg > 1:1625784/1‑100 (MQ=255) cAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGa > 2:431685/1‑100 (MQ=255) aGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTGTGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGAt < 1:3274763/100‑1 (MQ=255) aGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTTAt < 2:1811849/100‑1 (MQ=255) aGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGAt < 2:1677556/100‑1 (MQ=255) aGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGAt > 1:1361919/1‑100 (MQ=255) cACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTg < 2:1046259/100‑1 (MQ=255) aCCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGa > 1:1931138/1‑100 (MQ=255) ccGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTCGCTATGCCGTGATTGAg > 2:216703/1‑100 (MQ=255) ccGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAg > 1:2831524/1‑100 (MQ=255) gTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGt > 1:1287505/1‑100 (MQ=255) ttATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAACGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTg > 2:1543844/1‑100 (MQ=255) ttATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTg > 1:3477884/1‑100 (MQ=255) tgtaACTTAGCGCGCACAGACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTgg > 2:491736/3‑100 (MQ=255) tataACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTgg < 1:2858461/100‑1 (MQ=255) tataACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTgg > 1:2643677/1‑100 (MQ=255) taACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTgaga > 2:584543/1‑97 (MQ=255) taACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGAc < 2:1208207/100‑1 (MQ=255) cTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAACGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTa > 1:2255635/1‑100 (MQ=255) cTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTa > 1:2000506/1‑100 (MQ=255) aGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGAc > 2:2439565/1‑100 (MQ=255) gcACACACTTAAACAGCACTATTTTGGCGCTGCCAGAATGCAACGTTATGCATGCCGGGGATGGTAGCTATGCCGTGATTGTGGTGGACTTAGACggagg < 2:3036754/100‑1 (MQ=255) gcACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACggagg < 1:294213/100‑1 (MQ=255) cacacaCTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACggagga > 1:2181196/1‑100 (MQ=255) cacacaCTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACggagga > 1:1089959/1‑100 (MQ=255) cacacaCTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACggagga < 1:3929713/100‑1 (MQ=255) acacacTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGgaggag > 2:2941467/1‑100 (MQ=255) cacacTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGgaga > 1:897317/1‑100 (MQ=255) cTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAg > 2:3447995/1‑100 (MQ=255) cTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAg > 1:3387776/1‑100 (MQ=255) ttAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAgg > 1:314404/1‑100 (MQ=255) tAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGc < 2:1588553/100‑1 (MQ=255) aaaaaGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCa > 1:3689081/1‑100 (MQ=255) gAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTa > 2:3163489/1‑100 (MQ=255) gAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTa < 1:1901475/100‑1 (MQ=255) aCTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATTCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACt > 1:2403271/1‑100 (MQ=255) aCTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACt > 1:153839/1‑100 (MQ=255) aCTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACt < 1:1667708/100‑1 (MQ=255) cTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCTGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACtt > 1:1446548/1‑100 (MQ=255) tATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACttt < 1:2261097/100‑1 (MQ=255) ttttGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTttgt < 2:1278666/100‑1 (MQ=255) ttGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTttgttg < 1:1898169/100‑1 (MQ=255) tGGCGCTGCCAGAAAGCAACGGTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGc < 2:1745306/100‑1 (MQ=255) cgcTGCCAGAAAGCAACGTTATGAATGCCGGGGATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTATTTTGTTGCGtt > 2:2958515/1‑100 (MQ=255) tGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAg < 2:1472100/100‑1 (MQ=255) naGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGc > 1:3693305/2‑100 (MQ=255) cAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAgggn < 2:1738177/100‑2 (MQ=255) cAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGc < 1:905622/100‑1 (MQ=255) gAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCtt < 1:2239324/100‑1 (MQ=255) aaaGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCttt < 1:3609171/100‑1 (MQ=255) aGCAACGTTATGGACGCCGGGTATGGGAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCa < 2:3649850/100‑1 (MQ=255) gCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAg > 2:2166936/1‑100 (MQ=255) gCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAg < 1:1627302/100‑1 (MQ=255) cAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGTTTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAgg < 2:3629255/100‑1 (MQ=255) cAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAgn < 1:1891713/100‑2 (MQ=255) cAACGTGATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAgg > 2:3507547/1‑100 (MQ=255) aaCGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAggg < 1:399874/100‑1 (MQ=255) aaCGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAggg < 1:703749/100‑1 (MQ=255) aaCGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAggg < 1:667203/100‑1 (MQ=255) aaCGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAggg < 1:2609385/100‑1 (MQ=255) aCGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGga > 1:1686561/1‑100 (MQ=255) aCGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGga < 1:1136326/100‑1 (MQ=255) cGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGgaa > 2:3792313/1‑100 (MQ=255) ttATGCATGCCGGTTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGTAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGgaaaa < 1:4075324/100‑1 (MQ=255) ttATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGgaaaa > 1:1851429/1‑100 (MQ=255) tATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGgaaaag > 1:635948/1‑100 (MQ=255) tATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGgaaaag > 1:3535339/1‑100 (MQ=255) | GCGCCTAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATTCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGGAAAAG > NC_000913/4190002‑4190196 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |