| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,403,148 | A→C | N371H (AAC→CAC) | hflK → | modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,403,148 | 0 | A | C | 99.4% | 614.6 / ‑4.2 | 175 | N371H (AAC→CAC) | hflK | modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base C (100/74); total (100/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.29e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
CGCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATAACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGATATTATGG > NC_000913/4403052‑4403244 | cGCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACg > 1:392284/1‑100 (MQ=255) gCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCTGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACgg < 2:828964/100‑1 (MQ=255) gCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACgg > 2:2168740/1‑100 (MQ=255) gCAAAGTACTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACTAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAATAGCGATCACgg < 2:3706083/100‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTg < 1:2608849/100‑1 (MQ=255) gTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCa < 1:1953961/100‑1 (MQ=255) gCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGc > 1:4061030/1‑100 (MQ=255) cTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGGGCGATCACGGTGCCAGCa > 2:3119476/1‑100 (MQ=255) ggTTAACGATAAAGGTGGCAAACTGGTGGTTCAGCCGATAGCCCAAATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCAGGCGTCGGAGTGCGGTCACGGTGCGAGCAAt > 2:1611508/1‑100 (MQ=255) ttAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATct > 1:2964333/1‑100 (MQ=255) tcaaCGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATct > 1:2224884/3‑100 (MQ=255) tAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctg > 1:3207859/1‑100 (MQ=255) tAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctg > 2:1086194/1‑100 (MQ=255) tAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctg > 2:1543749/1‑100 (MQ=255) aaCGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctgc < 1:2469815/100‑1 (MQ=255) cGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctgctg > 1:1616910/1‑100 (MQ=255) cGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctgctg > 1:924943/1‑100 (MQ=255) cGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctgctg > 2:1306632/1‑100 (MQ=255) cGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctgctc > 2:353814/1‑99 (MQ=255) gATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCtgctgc < 2:3182542/100‑1 (MQ=255) gATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGAGGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGCTCACGGTGCCAGCAATCtgctgc > 2:3289163/1‑100 (MQ=255) ggagagTGGCAAACTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGACGAGCGATCACGGTGCCCGCAATCTGCTGCGt > 1:378650/6‑100 (MQ=255) aaGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGCAGAGCGATCACGGTGCCCGCAATCTGCTGCGTCt > 2:2703259/1‑100 (MQ=255) aaGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCt > 2:2986631/1‑100 (MQ=255) aGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTg < 1:2086112/100‑1 (MQ=255) aGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTg > 1:999574/1‑100 (MQ=255) gTGGCAACCTGATGGGTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTgcc > 2:399814/1‑100 (MQ=255) tGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTgccg < 1:2398811/100‑1 (MQ=255) gCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGGCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTgccgcc < 2:3622663/100‑1 (MQ=255) aaCCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAg < 1:3799917/100‑1 (MQ=255) aCCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGc < 2:909006/100‑1 (MQ=255) ccTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGcc < 2:16784/100‑1 (MQ=255) ccTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGcc > 1:3992949/1‑100 (MQ=255) ccTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGcc < 1:1528950/100‑1 (MQ=255) gATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCctct > 2:2881614/1‑100 (MQ=255) ggTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTtcc < 2:2291044/100‑1 (MQ=255) gTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTtcct < 2:1282871/100‑1 (MQ=255) ttCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTtcctc < 1:473961/100‑1 (MQ=255) tCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTtcctcc > 1:2060399/1‑100 (MQ=255) tCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTtcctcc < 1:288533/100‑1 (MQ=255) cTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGTCAGCCTCTTCCTCca > 2:307407/1‑100 (MQ=255) tGCCGTTGGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGTAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCcac < 1:3750909/100‑1 (MQ=255) cGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAAc > 1:821909/1‑100 (MQ=255) cGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAAc > 1:1026916/1‑100 (MQ=255) cGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCACCAGCCTCTTCCTCCACAAc > 1:1401930/1‑100 (MQ=255) tAGACCAGATGCGGAAAGGTGGTAACGCCCCGGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAg < 1:31758/100‑1 (MQ=255) aGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGt > 2:855614/1‑100 (MQ=255) gACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTg > 1:2694097/1‑100 (MQ=255) gACCAGATGCAGAGAGGTGGTAACGCTACTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTAACGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTg > 2:1344052/1‑100 (MQ=255) aCCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTgg > 2:3480872/1‑100 (MQ=255) ccAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGa > 1:537042/1‑100 (MQ=255) ccAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGa > 2:2690861/1‑100 (MQ=255) ccAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGa > 2:1106597/1‑100 (MQ=255) cAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGag > 1:962395/1‑100 (MQ=255) cAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGag < 1:1749305/100‑1 (MQ=255) cAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGag < 2:1424773/100‑1 (MQ=255) cAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGag < 2:2146991/100‑1 (MQ=255) agagGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGGAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagc < 2:482950/100‑1 (MQ=255) aGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagc > 2:1303932/1‑100 (MQ=255) aTGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaa > 2:2487471/1‑100 (MQ=255) tGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaag > 2:2228921/1‑100 (MQ=255) gCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaagc > 1:3281057/1‑100 (MQ=255) gCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaagc > 1:3436885/1‑100 (MQ=255) gCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaagc > 2:2609637/1‑100 (MQ=255) gCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaagc > 1:1900393/1‑100 (MQ=255) cTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaagca > 2:1856793/1‑100 (MQ=255) cTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaagca < 2:57242/100‑1 (MQ=255) cTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaagca < 1:2750420/100‑1 (MQ=255) tGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAgcaagcaa > 2:3221342/1‑100 (MQ=255) gAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAac > 1:849685/1‑100 (MQ=255) gAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAac < 1:1105743/100‑1 (MQ=255) gAAACGTGGTAACGCCCCTTCGGCGATGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTTCTGCGTCTGCCGCCAGGCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAac < 2:385158/100‑1 (MQ=255) aaGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAacac > 2:1952591/1‑100 (MQ=255) aGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAacacn < 1:1426136/100‑2 (MQ=255) aGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACAcg > 1:2061969/1‑100 (MQ=255) ggtggtAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACAcgt < 1:312892/100‑1 (MQ=255) gtggtAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCGGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACAcgtc < 2:3151474/100‑1 (MQ=255) tggtAACGCCCCGGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACAcgtcg < 2:2268853/100‑1 (MQ=255) ggtAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACAcgtcgt > 1:286816/1‑100 (MQ=255) ggtAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACAcgtcgt > 1:1271851/1‑100 (MQ=255) tAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTcc > 2:493431/1‑100 (MQ=255) ngCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTccacc > 1:3260957/2‑100 (MQ=255) cGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTccacc > 1:3498160/1‑100 (MQ=255) cGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTccacc > 2:342743/1‑100 (MQ=255) ccccTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAg > 2:2205715/1‑100 (MQ=255) ccTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTc > 2:935547/1‑100 (MQ=255) ccTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTc < 1:3714847/100‑1 (MQ=255) ccTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTc > 1:201936/1‑100 (MQ=255) cTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCa > 2:194787/1‑100 (MQ=255) tGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAg > 2:618984/1‑100 (MQ=255) gcggcgAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAgg < 2:2863128/100‑1 (MQ=255) cggcgAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAggg < 1:909731/100‑1 (MQ=255) cggcgAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAggg > 1:2529299/1‑100 (MQ=255) gcgAAGAGCGCTCTCGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCTAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCg < 1:1030385/100‑1 (MQ=255) gcgAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCg < 1:2201188/100‑1 (MQ=255) cgAAGGGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGa < 2:1070559/100‑1 (MQ=255) gCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCGCAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGAtattat > 1:393698/1‑100 (MQ=255) gCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGAtattat > 1:3003362/1‑100 (MQ=255) cGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGATATCATg < 1:3138283/100‑1 (MQ=255) gATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGATATTATgg > 1:2108520/1‑100 (MQ=255) | CGCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATAACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGATATTATGG > NC_000913/4403052‑4403244 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |