| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,452,800 | T→G | I77S (ATC→AGC) | ytfT → | putative sugar ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,452,800 | 0 | T | G | 93.9% | 466.4 / 12.0 | 148 | I77S (ATC→AGC) | ytfT | putative sugar ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (6/3); new base G (70/69); total (76/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
GTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGA > NC_000913/4452703‑4452895 | gtggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCg < 2:2651898/100‑1 (MQ=255) tggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAgcgc > 1:2535371/1‑100 (MQ=255) tggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAgcgc > 1:1849304/1‑100 (MQ=255) ggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGcc > 1:776705/1‑100 (MQ=255) gtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCa > 2:8296/1‑100 (MQ=255) gtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCa > 1:1423949/1‑100 (MQ=255) tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCAc > 1:2779852/1‑100 (MQ=255) tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCAc > 1:4069736/1‑100 (MQ=255) tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCAc > 1:1718156/1‑100 (MQ=255) cAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTg < 2:619424/100‑1 (MQ=255) ggATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTggg > 1:1790451/1‑100 (MQ=255) gATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGa < 2:1481351/100‑1 (MQ=255) gATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGa > 1:526121/1‑100 (MQ=255) ggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGa > 2:1260084/1‑100 (MQ=255) ggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGa > 1:2320613/1‑100 (MQ=255) gCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGAt < 2:738274/100‑1 (MQ=255) gCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGAt > 2:1531911/1‑100 (MQ=255) cGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGAtc < 1:2483761/100‑1 (MQ=255) cGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGAtc < 1:479422/100‑1 (MQ=255) ttGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGAtctct > 1:3009706/1‑100 (MQ=255) gTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTcc < 2:3452844/100‑1 (MQ=255) gTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTcc < 1:645669/100‑1 (MQ=255) gTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTcc > 1:245718/1‑100 (MQ=255) tCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGt > 2:2006704/1‑100 (MQ=255) ggTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAg > 1:2589666/1‑100 (MQ=255) gTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgg < 1:2164368/100‑1 (MQ=255) gTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCGCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgg < 2:1677982/100‑1 (MQ=255) gCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGc > 1:2103422/1‑100 (MQ=255) cccATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCgg < 2:2737732/100‑1 (MQ=255) ccaaTAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACACTGGTAAGCGAAACCGGTGGGCTTGATATCTCCGTCGGGGAgg > 2:984704/4‑100 (MQ=255) aTAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGa > 2:2947546/1‑100 (MQ=255) aTAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGa > 2:3182669/1‑100 (MQ=255) tAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGAt < 2:2797392/100‑1 (MQ=255) tAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGAt < 2:1377830/100‑1 (MQ=255) tAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGAt < 2:2797923/100‑1 (MQ=255) tAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGAt < 2:345335/100‑1 (MQ=255) aGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATg < 1:377314/100‑1 (MQ=255) aGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATg > 1:3947199/1‑100 (MQ=255) aGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATg > 2:1210259/1‑100 (MQ=255) aGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATg < 2:3794901/100‑1 (MQ=255) gACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATgg > 1:1474663/1‑100 (MQ=255) gACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATgg < 2:2927151/100‑1 (MQ=255) gACACTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTTATgg < 1:2873730/100‑1 (MQ=255) aCATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGc < 1:3523253/100‑1 (MQ=255) cATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCt > 2:2137461/1‑100 (MQ=255) tCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGCTGGCTATc > 2:3635758/1‑100 (MQ=255) tCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATc < 1:1675466/100‑1 (MQ=255) tCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATc > 1:1521461/1‑100 (MQ=255) cTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCg < 1:2528532/100‑1 (MQ=255) tAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGcc < 1:1751500/100‑1 (MQ=255) tAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGcc > 1:398911/1‑100 (MQ=255) aCCGTGCAGCTCCCGTGGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCgg > 2:702375/1‑100 (MQ=255) ccGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCggn < 2:1514969/100‑2 (MQ=255) ccGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGa > 1:2645951/1‑100 (MQ=255) ccGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGa > 2:776836/1‑100 (MQ=255) ccGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGCGATAGCCATCACCgcc < 1:1044511/100‑3 (MQ=255) cGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAg > 2:2263456/1‑100 (MQ=255) cGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAg < 1:3266628/100‑1 (MQ=255) cGTGCAGCTCCCGTTGCGTCACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATTTCACCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAg > 2:3312368/1‑100 (MQ=255) gTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGc < 1:1399746/100‑1 (MQ=255) gTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGc < 1:297663/100‑1 (MQ=255) tGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGGTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGcc < 1:2030118/100‑1 (MQ=255) tGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGcc > 2:1132108/1‑100 (MQ=255) tGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGcc < 2:2550081/100‑1 (MQ=255) gCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCca < 1:3381775/100‑1 (MQ=255) gCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCca > 1:887112/1‑100 (MQ=255) gCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCca > 1:3962289/1‑100 (MQ=255) aGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCcaca < 1:8398/100‑1 (MQ=255) gCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACaa > 1:3990101/1‑100 (MQ=255) cTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAAc > 1:77406/1‑100 (MQ=255) cGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCt > 1:13671/1‑100 (MQ=255) ttGCGTTACGGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGc < 2:1974850/100‑1 (MQ=255) cGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGTCAGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGAt < 2:3907370/100‑1 (MQ=255) cGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGAt < 1:3625935/100‑1 (MQ=255) cGTTACTGGCGATGGGCATGACGCTGGTGAGCGCCTTCAGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGAt < 2:1879996/100‑1 (MQ=255) gTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATg > 2:1582675/1‑100 (MQ=255) aCTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACg < 1:1201504/100‑1 (MQ=255) tGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGt > 2:2577556/1‑100 (MQ=255) tGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACAGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGCCGGTGATGGCTATCGCTGGAGCCACCACGGCTGCGCTGACGGt > 2:3036256/1‑100 (MQ=255) ggCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTc > 1:506529/1‑100 (MQ=255) gATTGGCCTGACGCTGGAGAGCGCCACCGGTGCGATTGATCTCTACGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTcgcg < 1:3744943/100‑1 (MQ=255) atgggCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCgg < 2:2050828/97‑1 (MQ=255) aTTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCgg < 1:605368/100‑1 (MQ=255) aTTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCgg < 2:3121031/100‑1 (MQ=255) aTTGGCATGACGCTGGGGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATCGCTGTCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCgg < 2:3755875/100‑1 (MQ=255) tttgCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGTTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGTCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCggg < 2:3125517/97‑1 (MQ=255) tGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGa > 1:1560350/1‑100 (MQ=255) ggCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCCCGGGAt > 2:1389647/1‑100 (MQ=255) gCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGAtt > 2:1920980/1‑100 (MQ=255) cATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTc < 1:2727907/100‑1 (MQ=255) cATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTc > 2:1279946/1‑100 (MQ=255) aTGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCa > 2:3238489/1‑100 (MQ=255) gACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGc > 1:1905318/1‑100 (MQ=255) aCGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGcc > 2:3549376/1‑100 (MQ=255) cGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCt > 2:1451392/1‑100 (MQ=255) cGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCt > 1:227814/1‑100 (MQ=255) cGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCt > 1:1640682/1‑100 (MQ=255) gCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTg < 2:56117/100‑1 (MQ=255) tGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGcc < 1:3409690/100‑1 (MQ=255) gTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTCTCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCCGGATTCAGCCTGCCGa > 2:2498650/1‑100 (MQ=255) | GTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGA > NC_000913/4452703‑4452895 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |