| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,476,115 | A→C | N227H (AAT→CAT) | yjgL → | SopA‑central‑domain‑like hexapeptide repeat protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,476,115 | 0 | A | C | 98.8% | 569.9 / ‑5.9 | 162 | N227H (AAT→CAT) | yjgL | SopA‑central‑domain‑like hexapeptide repeat protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base C (89/71); total (89/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
TCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAA > NC_000913/4476018‑4476211 | cTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCAtt < 1:1735842/100‑1 (MQ=255) tACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCAttt > 1:3854779/1‑100 (MQ=255) tACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCAttt > 1:630842/1‑100 (MQ=255) aCAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTa < 1:2799353/100‑1 (MQ=255) aCAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTa < 1:2083298/100‑1 (MQ=255) cAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTaa > 1:2450695/1‑100 (MQ=255) aGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTaaa > 1:837541/1‑100 (MQ=255) gAAATTAAATAATCTACAGCAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACCGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAAt > 2:3687899/1‑100 (MQ=38) gAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAAt > 2:827478/1‑100 (MQ=255) aTTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGAt < 2:193454/100‑1 (MQ=255) tAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATtc > 1:1598737/1‑100 (MQ=255) aataatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATtctc > 2:3445636/1‑100 (MQ=255) aataatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATtctc > 2:1029479/1‑100 (MQ=255) ataatCGACAGAAGTTAAATAAACTACTGAATGTAAATAATATACTTGTGTTAAATAATCCGCAAGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCa < 2:819937/100‑1 (MQ=255) taatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAg < 1:2568096/100‑1 (MQ=255) aatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAgg > 2:656278/1‑100 (MQ=255) tCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAg < 2:1847892/100‑1 (MQ=255) gcTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATATTATCCAGGGGTGAAATAATCCTCAGGAGTTATAGGATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAg < 2:243209/99‑1 (MQ=255) cTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGt < 2:2709457/100‑1 (MQ=255) tACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGtt > 1:599532/1‑100 (MQ=255) tACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGtt > 2:930578/1‑100 (MQ=255) cAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTaa > 1:3514824/1‑100 (MQ=255) cAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTaa > 2:1448083/1‑100 (MQ=255) cAGAAGTTAAATAATCTACCGAAGTTAAACAATATACAGGGGTGAAAAAATCCTATGGAGATAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTTAGGTGTTaa < 2:948800/100‑1 (MQ=25) gAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTaaan < 1:2681371/100‑2 (MQ=255) gTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAAc > 1:3974108/1‑100 (MQ=255) ttAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACt > 1:901345/1‑100 (MQ=255) aaaTAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCg < 2:3307980/100‑1 (MQ=255) aaaTAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCg > 2:1229958/1‑100 (MQ=255) ataatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCCTTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCgaa > 2:2516285/1‑98 (MQ=255) ataatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCa < 1:1027146/100‑1 (MQ=255) ataatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCa > 1:2514164/1‑100 (MQ=255) taatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAg > 2:2094956/1‑100 (MQ=255) aatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAgg < 1:2463570/100‑1 (MQ=255) aatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAgg < 1:833625/100‑1 (MQ=255) tACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAAtt > 2:44024/1‑100 (MQ=255) tACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAAtt > 2:3927883/1‑100 (MQ=255) aCTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTa > 1:3559518/1‑100 (MQ=255) cTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaa > 2:336346/1‑100 (MQ=255) tGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaaa > 2:3451802/1‑100 (MQ=255) gAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAAt < 2:3674107/100‑1 (MQ=255) gAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAAt > 2:1982111/1‑100 (MQ=255) gAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAAt > 1:988201/1‑100 (MQ=255) gAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCACAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAAt > 1:3350774/1‑100 (MQ=255) aGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAg < 1:744825/100‑1 (MQ=255) aGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAg < 1:1168143/100‑1 (MQ=255) aGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAg > 1:3285568/1‑100 (MQ=255) gTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGt > 1:2317301/1‑100 (MQ=255) gTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGt > 1:413301/1‑100 (MQ=255) gTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAAGTAAATAGt > 2:269416/1‑100 (MQ=255) ttAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTc < 2:2927618/100‑1 (MQ=255) tAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTcc < 1:1376565/100‑1 (MQ=255) aataatATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCcac > 1:2933377/1‑100 (MQ=255) taataTACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAg > 2:2389303/1‑100 (MQ=255) atatACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGa > 1:1028117/1‑100 (MQ=255) tataCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAg < 1:3555192/100‑1 (MQ=255) tataCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAg < 2:2585819/100‑1 (MQ=255) tataCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAg < 2:2859528/100‑1 (MQ=255) ataCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGt < 1:425190/100‑1 (MQ=255) taCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGtt > 1:1140550/1‑100 (MQ=255) taCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGtt > 2:3311869/1‑100 (MQ=255) cAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTaa > 1:919627/1‑100 (MQ=255) cAGGGGTTAAATAATCCTCAAGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTaa < 1:1114592/100‑1 (MQ=255) aGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTaaa < 1:1497086/100‑1 (MQ=255) ggggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAAt > 1:1841449/1‑100 (MQ=255) ggggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAAt > 1:3407358/1‑100 (MQ=255) gggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATg < 2:32353/100‑1 (MQ=255) gcgTTAACTCATCCTCCGGAGTTAAATAAATCGCAGCAATTACATGATTCTCAGGAGTTAAACAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGCTAAATg < 2:3391840/98‑1 (MQ=255) ggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGa > 2:1806596/1‑100 (MQ=255) ggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGa < 2:1755821/100‑1 (MQ=255) ggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGa < 1:225111/100‑1 (MQ=255) gTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTGAATGATTCCCAGAAGTTAAATAACTCAAAGGAATTTAATAGCCCACAGGACTTAAATGaa > 2:3072662/1‑99 (MQ=25) ttAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGAtg > 1:4080891/1‑99 (MQ=255) tAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATcc < 2:1376361/100‑1 (MQ=255) tAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATcc < 2:870731/100‑1 (MQ=255) tAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATcc < 1:1942386/100‑1 (MQ=255) aaaTAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCg < 1:1659145/100‑1 (MQ=255) aaaTAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCg > 2:679971/1‑100 (MQ=255) aataatCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGc > 2:906733/1‑100 (MQ=255) aatCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAgg < 1:318297/100‑1 (MQ=255) atCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGa < 1:1661337/100‑1 (MQ=255) tcctccGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAg < 2:3171241/100‑1 (MQ=255) tCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAg < 1:1497909/100‑1 (MQ=255) cTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGtt > 2:483145/1‑100 (MQ=255) tCAGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTa < 2:2823938/100‑1 (MQ=255) aGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTaaa > 1:1676251/1‑100 (MQ=255) aGGAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTaaa < 2:3162514/100‑1 (MQ=255) ggAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTNTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTaaan < 2:3013976/100‑2 (MQ=255) ggAGTTAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAaat < 1:3664407/100‑1 (MQ=255) tAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCGACAGGAGTTATATGATCCGCAGGAGTTAAATAATtc > 2:3786117/1‑100 (MQ=255) tAAATAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATtc > 1:47216/1‑100 (MQ=255) aaaTAATCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATtct > 2:1533301/1‑100 (MQ=255) ataatCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCa < 2:910224/100‑1 (MQ=255) taatCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAg < 2:1558266/100‑1 (MQ=255) taatCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAg < 2:1808894/100‑1 (MQ=255) aatCCGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAgg < 1:3229007/100‑1 (MQ=255) cGCAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACtt > 2:1172638/1‑100 (MQ=255) gcagcaTTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTa > 2:536405/1‑100 (MQ=255) gcagcaTTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTa < 2:3527695/100‑1 (MQ=255) cAGCATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTaa > 2:3217202/1‑100 (MQ=255) | TCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAA > NC_000913/4476018‑4476211 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |