Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 546,173 | T→G | E64A (GAA→GCA) | allD ← | ureidoglycolate dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 546,173 | 0 | T | G | 97.0% | 545.3 / 3.4 | 168 | E64A (GAA→GCA) | allD | ureidoglycolate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/3); new base G (82/81); total (84/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.46e-01 |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
ATGTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTTCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCAATA > NC_000913/546076‑546269 | tGTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACCCCGGTgcgc > 2:3456472/1‑100 (MQ=255) tCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCgga > 2:418947/1‑99 (MQ=255) ccATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGtt < 1:2931930/100‑1 (MQ=255) acATACCCAATGTCGCGGCGACCTGTCCGGCGGCAGTGTCGGCATGTAAGGTTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCGAGACGAATCTCCGGTGAGCGGtt < 2:1495772/99‑1 (MQ=255) cATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTg < 1:880250/100‑1 (MQ=255) tACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGt > 1:2534869/1‑100 (MQ=255) cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGTCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 2:512698/1‑100 (MQ=255) cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 1:3434064/1‑100 (MQ=255) cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 1:3203388/1‑100 (MQ=255) cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 2:1863559/1‑100 (MQ=255) cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGGTGGTgc > 2:847379/1‑100 (MQ=255) cctttgCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgccg < 2:1700883/98‑1 (MQ=255) aTTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgccgc > 2:3154681/1‑100 (MQ=255) tttCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCt < 1:1637988/100‑1 (MQ=255) tttCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCt > 2:1193290/1‑100 (MQ=255) tCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTTCGCGGTTGGTGCCGCCttt < 1:1458027/100‑1 (MQ=255) cgccgcGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCtttt < 2:874417/100‑1 (MQ=255) cgccgcGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGGTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCGtttt > 1:3656096/1‑100 (MQ=255) gccgcGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTg < 1:1749337/100‑1 (MQ=255) gccgcGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTg > 1:3487183/1‑100 (MQ=255) gccgcGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTg < 1:164718/100‑1 (MQ=255) cgcgACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATATAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGaa < 2:192677/100‑1 (MQ=255) gcgACCGGTCCGGCGGCATTGTCGGCAGGTAAAATTGCCGGGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGGGGTTGGTGCCGCCTTTTGaaa < 2:482957/100‑1 (MQ=255) cgACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAAt < 2:3088503/100‑1 (MQ=255) gACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATg < 2:1196807/100‑1 (MQ=255) ccTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCg > 2:3964847/1‑100 (MQ=255) cTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCC‑TTTGAAATGCGtt < 2:1489584/100‑1 (MQ=255) gTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTc > 2:110781/1‑100 (MQ=255) ccGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcg < 1:3138186/100‑1 (MQ=255) ccGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcg > 1:1088875/1‑100 (MQ=255) cggcggCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcgc > 1:2333199/1‑100 (MQ=255) cggcggCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcgc > 1:214266/1‑100 (MQ=255) ggcggcATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcgcg < 1:1103339/100‑1 (MQ=255) gcggcATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCgt < 2:370962/100‑1 (MQ=255) ggcATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCgtag < 1:3466823/100‑1 (MQ=255) aTTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTAt > 2:1097500/1‑100 (MQ=255) tGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTc > 1:3963831/1‑100 (MQ=255) gTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTcc > 2:2279636/1‑100 (MQ=255) tCGGCATGTAAAATTGCCGAGCATGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCa < 2:464618/100‑1 (MQ=255) tCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCa < 2:2360283/100‑1 (MQ=255) gatctaTGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCa < 1:2261299/95‑1 (MQ=255) cGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGCAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAc < 1:2662690/100‑1 (MQ=255) cGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAc < 2:2297576/100‑1 (MQ=255) cGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAc < 2:2516839/100‑1 (MQ=255) cGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTGTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAc > 2:1867304/1‑100 (MQ=255) cGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTGTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTGGTGAAATTCGTTCCGCGTAGTGTTCCAc > 2:582354/1‑100 (MQ=255) ggCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAcg > 1:776341/1‑100 (MQ=255) ggCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAcg > 1:1177546/1‑100 (MQ=255) gCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAcgc < 2:3057059/100‑1 (MQ=255) aTGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCaagatc > 2:2226650/1‑95 (MQ=255) aTGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACgcgc > 2:2599425/1‑100 (MQ=255) tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa > 1:474563/1‑100 (MQ=255) tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa > 1:1847548/1‑100 (MQ=255) tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa < 2:3851872/100‑1 (MQ=255) tGTAAAATTACCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCGAGACGAAACTCCTGTGTGCGGGCGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGGAGTTTTGCTCGGGCa > 2:3208951/1‑100 (MQ=255) gTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCAc > 2:3228709/1‑100 (MQ=255) tAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGCTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCAcc > 1:431509/1‑100 (MQ=255) gCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCAt > 1:2577726/1‑100 (MQ=255) gCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCAt > 2:1133613/1‑100 (MQ=255) ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCTGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg > 2:3188676/1‑100 (MQ=255) ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg < 2:2728441/100‑1 (MQ=255) ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg > 1:1054190/1‑100 (MQ=255) ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg < 2:3407521/100‑1 (MQ=255) ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGAGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg < 2:332524/100‑1 (MQ=255) cGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATga < 1:2248613/100‑1 (MQ=255) cGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGGGGGTGCCGCCTTTTGACATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATga > 1:180839/1‑100 (MQ=255) gAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATgag > 2:1792074/1‑100 (MQ=255) gAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATgag < 1:1543780/100‑1 (MQ=255) gCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGagag < 2:833819/100‑1 (MQ=255) cACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGt > 1:3014399/1‑100 (MQ=255) aCGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAACCTCCGGTGCGGGGTTGGTGGCGCCTTTTGAAATGCTTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGTCATGGGAGTg < 2:1447707/100‑1 (MQ=255) ggCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGa > 1:622004/1‑100 (MQ=255) ggCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGa > 2:2840612/1‑100 (MQ=255) gCCCGGTTTCCTCAAGACGGAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTCGTATTCCACGCGCACCGCCCCATGACAGCGGAt > 2:3656176/1‑100 (MQ=255) gCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGAt < 1:3336664/100‑1 (MQ=255) cccGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATc > 1:3473530/1‑100 (MQ=255) ccGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATcc < 2:3783339/100‑1 (MQ=255) ccGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATcc < 1:847278/100‑1 (MQ=255) tttCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCctct < 1:1370933/100‑1 (MQ=255) ttCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCTGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTg < 2:3594230/100‑1 (MQ=255) ttCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTg < 2:1114174/100‑1 (MQ=255) tCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTgg < 2:2789216/100‑1 (MQ=255) ccTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGc > 1:3039706/1‑100 (MQ=255) cTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCGCCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCa < 1:4013998/100‑1 (MQ=255) cTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCa > 1:884818/1‑100 (MQ=255) cTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCa < 2:3161163/100‑1 (MQ=255) tCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCAt < 1:2717079/100‑1 (MQ=255) cAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATc < 2:2229967/100‑1 (MQ=255) cAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCCGGCATc > 1:2075724/1‑100 (MQ=255) aaGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCg < 1:112559/100‑1 (MQ=255) gACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGc > 1:3545436/1‑100 (MQ=255) gACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGc < 1:561313/100‑1 (MQ=255) cGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGt > 1:2827913/1‑100 (MQ=255) aaaCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTaa > 2:721216/1‑100 (MQ=255) aaaCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTaa > 2:797357/1‑100 (MQ=255) aaCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTaaa > 2:997581/1‑100 (MQ=255) aCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTCCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAc < 1:3898677/100‑1 (MQ=255) cTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAcc < 2:760058/100‑1 (MQ=255) cTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAcc > 2:2248124/1‑100 (MQ=255) cTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAcc < 1:1081256/100‑1 (MQ=255) | ATGTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTTCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCAATA > NC_000913/546076‑546269 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |