Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 623,458 | T→G | L387V (TTG→GTG) | entS → | enterobactin exporter, iron‑regulated |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 623,458 | 0 | T | G | 97.8% | 481.4 / ‑3.1 | 139 | L387V (TTG→GTG) | entS | enterobactin exporter, iron‑regulated |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/2); new base G (60/74); total (61/78) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
AGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGC > NC_000913/623363‑623553 | aGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTgtgtt < 1:3051642/100‑1 (MQ=255) gAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTgtgttg > 1:2370032/1‑100 (MQ=255) aaCGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGa > 2:764553/1‑100 (MQ=255) aCGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGAt > 1:3836713/1‑100 (MQ=255) tGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTAt > 1:681439/1‑100 (MQ=255) tGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGGGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTAt > 1:1673780/1‑100 (MQ=255) aCGGGAGATGACATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTCGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCg < 2:2195079/100‑1 (MQ=255) cGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCgg > 1:896036/1‑100 (MQ=255) ggCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCg < 1:2916346/100‑1 (MQ=255) ggCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCg < 1:3840161/100‑1 (MQ=255) ggCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCg > 1:1820715/1‑100 (MQ=255) ggCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCg > 1:3637187/1‑100 (MQ=255) cGATGCGATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCgtg < 2:3796825/100‑1 (MQ=255) tGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGtgttg > 2:699333/1‑100 (MQ=255) gCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGtgttgt < 2:3857239/100‑1 (MQ=255) gCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGtgttgt > 1:4048230/1‑100 (MQ=255) accATCGGCCCGTCGCTGTTGACTCTTTTGCACGCGATTATGACACCGGTTGGTTACCAAAGCGCGACCGGTTTTCATCTGTTGATTATCGGCGtgttgt < 2:479250/99‑1 (MQ=255) cATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTa > 2:1438443/1‑100 (MQ=255) cATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTa > 2:1155264/1‑100 (MQ=255) cATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTa < 1:340745/100‑1 (MQ=255) aTAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTAt < 1:3441867/100‑1 (MQ=255) tAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTAtt < 1:3511874/100‑1 (MQ=255) aGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtg < 1:2712860/100‑1 (MQ=255) aGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtg < 2:742499/100‑1 (MQ=255) ggcgcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgc > 1:2755350/1‑100 (MQ=255) ggcgcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgc > 1:379079/1‑100 (MQ=255) ggcgcggcacTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgc < 2:1039809/100‑1 (MQ=255) cgcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctg > 2:2702078/1‑100 (MQ=255) gcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctgg < 2:3919964/100‑1 (MQ=255) gcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctgg < 2:521234/100‑1 (MQ=255) gcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctgg < 1:903341/100‑1 (MQ=255) cggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctggt > 2:554741/1‑100 (MQ=255) cggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctggt > 1:2203434/1‑100 (MQ=255) cggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctggt < 1:1998355/100‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctggtgc > 1:1612130/1‑100 (MQ=255) cgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctggtgct < 1:280547/100‑1 (MQ=255) cgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctggtgct > 2:709964/1‑100 (MQ=255) tgctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTgctggtgctggt < 1:2948471/100‑1 (MQ=255) tgctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTgctggtgctggt > 1:1586669/1‑100 (MQ=255) gctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGctggtgctggtg < 2:1234954/100‑1 (MQ=255) gctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGctggtgctggtg < 2:431001/100‑1 (MQ=255) gctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGctggtgctggtg < 2:95119/100‑1 (MQ=255) gctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGctggtgctggtg < 1:2106343/100‑1 (MQ=255) ctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCtggtgg < 1:608882/100‑1 (MQ=255) ctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCtggtgg < 1:3120934/100‑1 (MQ=255) gggTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGGGCGGTTTTGGTGTGTTGCTTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAg < 1:1992964/100‑1 (MQ=255) ggtggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGt > 2:543739/1‑100 (MQ=255) ggtggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGt < 1:2149550/100‑1 (MQ=255) ggtggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGt < 2:3131263/100‑1 (MQ=255) gtggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGtt > 2:914339/1‑100 (MQ=255) tggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTg < 1:1123401/100‑1 (MQ=255) ggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGc > 1:2395927/1‑100 (MQ=255) gtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCg < 1:580102/100‑1 (MQ=255) gtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCg < 2:2177638/100‑1 (MQ=255) cgcgATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACAtttt > 2:2683248/1‑100 (MQ=255) cgcgATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACAtttt > 2:500509/1‑100 (MQ=255) atgatgACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGCGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGcc < 1:1317844/100‑1 (MQ=255) atgatgACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGcc < 1:2630753/100‑1 (MQ=255) gatgaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTGGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAg < 1:3844113/100‑1 (MQ=255) catgaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGACCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAg < 2:1620390/99‑1 (MQ=255) tgaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAc > 1:2758793/1‑100 (MQ=255) tgaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAc > 1:1237641/1‑100 (MQ=255) tgaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTGATTGCTGGTGCTGGGGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAc > 2:3207975/1‑100 (MQ=255) tgaCACCGGTTGCTGCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAc < 2:3061195/100‑1 (MQ=255) acacCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgc > 1:1176028/1‑100 (MQ=255) cacCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgcc > 1:1222039/1‑100 (MQ=255) cacCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgcc > 1:3100082/1‑100 (MQ=255) tccGGCTGCTTCCACAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATTGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGCAGTTGCGACATATTCGCCAGAcgccg < 2:3733870/99‑1 (MQ=255) acCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgccg < 2:1512887/100‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgccgccg > 1:4021088/1‑100 (MQ=255) gCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAgg > 2:3223474/1‑100 (MQ=255) cTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGt > 2:1049459/1‑100 (MQ=255) ccGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGAc > 2:1344927/1‑100 (MQ=255) cGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACa > 2:3861209/1‑100 (MQ=255) cGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACa > 2:2838878/1‑100 (MQ=255) gCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAg < 1:12684/100‑1 (MQ=255) gcgcGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTc < 2:3461053/100‑1 (MQ=255) gcgcGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTc > 1:3502359/1‑100 (MQ=255) gcgcGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTc < 2:2354654/100‑1 (MQ=255) cgcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 1:1472908/100‑1 (MQ=255) cgcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 2:190643/100‑1 (MQ=255) cgcgAGCGGTTTTGGTCTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 2:3347700/100‑1 (MQ=255) cgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACCGCGTCCGa > 2:1849114/1‑100 (MQ=255) cgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGa > 1:452077/1‑100 (MQ=255) gAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGAc < 2:2069784/100‑1 (MQ=255) gAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGAc < 2:1573386/100‑1 (MQ=255) gAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGAc > 1:3730456/1‑100 (MQ=255) gAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGAc > 1:1828426/1‑100 (MQ=255) gCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAg < 1:3279992/100‑1 (MQ=255) gCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAg > 2:2324290/1‑100 (MQ=255) gCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAg < 2:2792552/100‑1 (MQ=255) cGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGt > 2:1801832/1‑100 (MQ=255) ggTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGtt < 2:506540/100‑1 (MQ=255) ggTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGtt > 1:2813657/1‑100 (MQ=255) gTTTTGGTTTGTTGAGTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGATTTGCGACATTTTCGCAAGACGGCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTa < 2:2578650/100‑1 (MQ=255) gTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTa < 2:3533057/100‑1 (MQ=255) tttGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAAt < 1:3341283/100‑1 (MQ=255) ttGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATg < 2:2116894/100‑1 (MQ=255) tGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGc < 1:3282785/100‑1 (MQ=255) tGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGc < 1:264032/100‑1 (MQ=255) | AGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGC > NC_000913/623363‑623553 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |