| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 754,738 | A→C | intergenic (‑270/‑439) | gltA ← / → sdhC | citrate synthase/succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 754,738 | 0 | A | C | 96.3% | 439.0 / 2.8 | 134 | intergenic (‑270/‑439) | gltA/sdhC | citrate synthase/succinate dehydrogenase, membrane subunit, binds cytochrome b556 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/2); new base C (60/69); total (63/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
AATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAAT > NC_000913/754641‑754834 | aaTGGCGAATCAAGTACTTAGCAATGCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCAAATGCATTGGTAAATACTTCCACACTGTTACATacg > 2:22823/1‑98 (MQ=255) aTGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGt > 1:2638757/1‑100 (MQ=255) aTGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGt > 2:2437930/1‑100 (MQ=255) tGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGtt < 2:1451822/100‑1 (MQ=255) tGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAAGTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGtt < 1:1375909/100‑1 (MQ=255) ggCGAATCAAGTACTTAACAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCAGTAGTAACTGTCCCGAATGAATTGGTAAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTa > 2:429749/1‑100 (MQ=255) gCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTaa < 1:146707/100‑1 (MQ=255) cGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAAt < 2:1663727/100‑1 (MQ=255) cGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAAt > 1:3913030/1‑100 (MQ=255) gAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATc > 2:1801709/1‑100 (MQ=255) gAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATc < 2:2584952/100‑1 (MQ=255) gAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATc < 1:339323/100‑1 (MQ=255) gAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATc > 1:3050427/1‑100 (MQ=255) gAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTAGTAATCTTGTCTCTCACTAATAGCTGTCCCGAATGACTTGGTCAATACTGCCACACTTTTACATCAGTTAATc < 2:924673/100‑1 (MQ=255) aaTCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCt < 1:1739006/100‑1 (MQ=255) tCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTa < 2:1402582/100‑1 (MQ=255) cAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAg < 1:1417202/100‑1 (MQ=255) cAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAg < 1:2307735/100‑1 (MQ=255) aaGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAgg < 1:3040656/100‑1 (MQ=255) aGTACTTAGCAATCCGAAGTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGt < 1:1391895/100‑1 (MQ=255) aCTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGaa > 2:681919/1‑100 (MQ=255) cTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCGATAATGACTGTCCAGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACAGCAGTTAATCTTAGGTGaaa > 1:3626437/1‑100 (MQ=255) cTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGaaa > 1:920682/1‑100 (MQ=255) cTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGaaa > 1:475566/1‑100 (MQ=255) ttAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAAt < 2:1005239/100‑1 (MQ=255) gCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATAcc < 2:2875189/100‑1 (MQ=255) gCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATAcc < 2:2648358/100‑1 (MQ=255) gCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATAcc < 1:3512349/100‑1 (MQ=255) cAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCg < 2:3922302/100‑1 (MQ=255) cAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCg > 1:3326486/1‑100 (MQ=255) cAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCg < 2:2772646/100‑1 (MQ=255) aaTCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGa > 2:442535/1‑100 (MQ=255) aaTCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGa > 2:2760566/1‑100 (MQ=255) aTCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGAc > 2:3242975/1‑100 (MQ=255) aTCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGAc > 2:1264962/1‑100 (MQ=255) ccGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACtt < 1:535718/100‑1 (MQ=255) cGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTc > 1:935530/1‑100 (MQ=255) tattaAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAAc < 2:314830/100‑1 (MQ=255) ttaAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACtt < 1:968686/100‑1 (MQ=255) ttaAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACtt > 2:2707923/1‑100 (MQ=255) aaaCTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAACGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACtttt > 1:3271401/1‑100 (MQ=255) aaCTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTa < 2:2854323/100‑1 (MQ=255) aaCTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTa < 1:440766/100‑1 (MQ=255) aaCTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTa < 1:1435941/100‑1 (MQ=255) aaCTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTa < 2:51444/100‑1 (MQ=255) aCTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTAc < 1:2454134/100‑1 (MQ=255) cTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACg < 2:499141/100‑1 (MQ=255) gTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCAt < 2:1146773/100‑1 (MQ=255) gTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCAt < 1:4011920/100‑1 (MQ=255) gTCTACCACTAATAACTGCCTCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCAt < 1:3821353/100‑1 (MQ=255) tCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCAtt < 2:1139548/100‑1 (MQ=255) tCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCAtt > 2:3844383/1‑100 (MQ=255) tACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATtat > 1:2895488/1‑100 (MQ=255) ccACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTatat > 2:2980793/1‑100 (MQ=255) ccACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTatat > 2:1419405/1‑100 (MQ=255) cACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATg < 2:45242/100‑1 (MQ=255) aCTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGc < 1:1288693/100‑1 (MQ=255) aCTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGc > 1:3852086/1‑100 (MQ=255) cTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCt > 1:2891092/1‑100 (MQ=255) cTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCt < 2:2294774/100‑1 (MQ=255) aCTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAGCTTTTACGCATTATATGCTTTTCCt < 1:3642222/100‑1 (MQ=255) aCTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCt < 1:2114993/100‑1 (MQ=255) cTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTg < 1:2147242/100‑1 (MQ=255) cTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTg > 1:2220176/1‑100 (MQ=255) cTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTg > 1:2929439/1‑100 (MQ=255) cTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTg < 2:3771132/100‑1 (MQ=255) tGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTgg < 2:651064/100‑1 (MQ=255) gTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGt < 1:2979377/100‑1 (MQ=255) gTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGt < 1:3211504/100‑1 (MQ=255) cccGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTaa > 1:265022/1‑100 (MQ=255) ccGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAAt > 2:2784988/1‑100 (MQ=255) tgaatTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTg < 2:894339/100‑1 (MQ=255) aatTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTa < 2:2753756/100‑1 (MQ=255) aatTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTa < 2:1210864/100‑1 (MQ=255) aatTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTa < 1:2252008/100‑1 (MQ=255) tctCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTaacaa < 1:1169910/98‑1 (MQ=255) ggTCAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTaacaa > 1:4065853/1‑100 (MQ=255) cAATACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTaacaaaga > 2:1147242/1‑97 (MQ=255) aaTACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACttt > 2:2593542/1‑100 (MQ=255) aaTACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACttt > 1:169336/1‑100 (MQ=255) aTACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTttg > 1:3576905/1‑100 (MQ=255) tACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTttgt < 2:1274278/100‑1 (MQ=255) tACTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTttgt < 2:1611530/100‑1 (MQ=255) aCTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTTGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTttgtt < 2:704313/100‑1 (MQ=255) cTTCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTttgttg > 2:1762775/1‑100 (MQ=255) tCCACCCTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGCTGaa > 1:3661623/1‑100 (MQ=255) tCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGaa < 2:1902286/100‑1 (MQ=255) tCCACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGaa < 2:444899/100‑1 (MQ=255) ccACACTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAAt < 1:2578921/100‑1 (MQ=255) cTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGTATTACCGATTTCATAGCTTTTACGCATTATATGCTTTGCCTGGGAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTg < 2:495945/100‑1 (MQ=255) cTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTg > 2:442571/1‑100 (MQ=255) cTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTg < 1:832823/100‑1 (MQ=255) cTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTg > 2:719408/1‑100 (MQ=255) cTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTg < 2:767489/100‑1 (MQ=255) cTGTTACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAACGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTg < 2:3982158/100‑1 (MQ=255) ttACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCa < 1:2145010/100‑1 (MQ=255) ttACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCa > 1:2233997/1‑100 (MQ=255) ttACATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCa > 2:2585040/1‑100 (MQ=255) cATCAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAAt > 1:976225/1‑100 (MQ=255) cATCAGTTAAGCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGATTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAAt > 2:3685242/1‑100 (MQ=255) | AATGGCGAATCAAGTACTTAGCAATCCGAATTATTAAACTTGTCTACCACTAATAACTGTCCCGAATGAATTGGTCAATACTTCCACACTGTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAAT > NC_000913/754641‑754834 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |