| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,290,933 | T→G | L231R (CTT→CGT) | rssB → | PcnB‑degradosome interaction factor; response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,290,933 | 0 | T | G | 98.7% | 524.0 / NA | 152 | L231R (CTT→CGT) | rssB | PcnB‑degradosome interaction factor; response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); new base G (84/64); total (85/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.92e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
GCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCTTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAGTTTCCGCT > NC_000913/1290836‑1291029 | gCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTg > 1:1997799/1‑100 (MQ=255) cATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGc < 1:3174008/100‑1 (MQ=255) cATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGc < 1:525118/100‑1 (MQ=255) aTTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGca > 2:1393613/1‑100 (MQ=255) aTTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGca > 2:3960552/1‑100 (MQ=255) ttttATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGcac < 1:3025036/100‑1 (MQ=255) gttgtttGCGTTGATTGCACCCTTTCTTGACATAATGTCGTACTGGCTTTCTTGGTATTGCGCGCTTTGGTTAACGGATTATTACAGGAACAGCTTGcac < 2:3019882/95‑1 (MQ=255) aTTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCa < 1:2789818/100‑1 (MQ=255) tGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCaaa < 1:999321/100‑1 (MQ=255) gCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCaaaa > 1:792139/1‑100 (MQ=255) gCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCaaaa > 2:2668588/1‑100 (MQ=255) gCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCaaaa < 2:286433/100‑1 (MQ=255) gCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCaaaa > 1:895764/1‑100 (MQ=255) gCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCaaaa < 2:700715/100‑1 (MQ=255) ccTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAAt > 1:3965017/1‑100 (MQ=255) ccTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAAt < 2:741971/100‑1 (MQ=255) ccTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAAt < 1:300032/100‑1 (MQ=255) cTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATc < 1:252057/100‑1 (MQ=255) cTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATc < 2:264129/100‑1 (MQ=255) tGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCaa < 2:1152041/100‑1 (MQ=255) tGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACgg > 2:2978430/1‑100 (MQ=255) gTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGt > 1:1032209/1‑100 (MQ=255) tCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGtt < 1:3224664/100‑1 (MQ=255) cACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTg > 2:1939995/1‑100 (MQ=255) cACCCGAACTGGACATAATAGCGTACTTGGTGCATTGTTATTACACGCATTGTTTAACGGATTCATCCAGGAACAGAGTGCACACCAAAATAAACCGtta > 2:3108533/1‑99 (MQ=255) ccGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCa > 2:2523406/1‑100 (MQ=255) gCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGt > 1:2898116/1‑100 (MQ=255) tGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTg < 1:2358105/100‑1 (MQ=255) tGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCATGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTg > 2:3135628/1‑100 (MQ=255) ggACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTgg > 1:831988/1‑100 (MQ=255) cATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGgcg > 1:2456847/1‑100 (MQ=255) aTAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCAGTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCTTGCACACCAAACTCAACGGTTGCCAGAGTTGGgcgc < 2:3268341/100‑1 (MQ=255) tAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGcgcg > 2:1655331/1‑100 (MQ=255) aaTGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATGATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCTCGt > 2:815828/1‑100 (MQ=255) aTGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGtt < 2:521499/100‑1 (MQ=255) aTGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGtt > 1:3897296/1‑100 (MQ=255) ggCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTAt > 2:1884882/1‑100 (MQ=255) cGTATTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACGAAAATCAACGGTTGCCATAGTTGGGCGCGTTCTTg > 2:3376125/1‑100 (MQ=255) cGTACTTGCTGCCTTGTTAGTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGGTGGGCGCGTTATTg > 2:3654324/1‑100 (MQ=255) gTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGa < 1:286300/100‑1 (MQ=255) gTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGa > 1:1585932/1‑100 (MQ=255) gTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGa < 1:2822211/100‑1 (MQ=255) tACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGaa > 2:1220886/1‑100 (MQ=255) tACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGaa > 2:2055363/1‑100 (MQ=255) aCTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTAtagatc > 1:879846/1‑95 (MQ=255) aCTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAg < 2:628377/100‑1 (MQ=255) ttGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGcn < 1:3234318/100‑2 (MQ=255) ttGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCa < 1:2362919/100‑1 (MQ=255) ttGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCa < 2:1844747/100‑1 (MQ=255) tgctgcCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATGATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTCCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAg > 2:2191264/1‑100 (MQ=255) tctgcCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAgg < 2:1491702/99‑1 (MQ=255) gcCTTGTTATTCCTCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCTTACCAAAATCAACGGTTGCCAGCGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTaa > 2:203876/1‑100 (MQ=255) gcCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTTCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTaa < 2:3613120/100‑1 (MQ=255) ccTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTaaa > 2:650149/1‑100 (MQ=255) cTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAAc > 2:3263759/1‑100 (MQ=255) cTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAAc > 1:1505654/1‑100 (MQ=255) cTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACAGTTGCCAGAGTGGGGAGCGTTATTGAAGCAGGTAAAc > 1:3798698/1‑100 (MQ=255) tGTTATTACGCGCATTGTTTAACTTATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAATGTCAACGTTTGCCATAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGTTAAACCa < 2:2401157/100‑1 (MQ=255) tGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCa > 1:3447199/1‑100 (MQ=255) tGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCa < 2:1729315/100‑1 (MQ=255) ttattaCGCGCATTGTTGAACGGATTATTACAGGAGCAGCGTGCACACCGGAATCAACGGTTGCGAGAGGTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCAtt < 2:2521798/100‑1 (MQ=255) tattaCGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCAtta > 1:2508592/1‑99 (MQ=255) attaCGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTa < 2:876899/100‑1 (MQ=255) attaCGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTa > 1:3637103/1‑100 (MQ=255) ttaCGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTAc < 2:1735510/100‑1 (MQ=255) taCGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACt > 1:48579/1‑100 (MQ=255) aCGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACtt < 2:494681/100‑1 (MQ=255) aCGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACtt < 1:3492030/100‑1 (MQ=255) cgcgCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTTGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACttt > 2:2940873/1‑99 (MQ=255) cgcgCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTGTTGGAGCAGGTAAACCATTTACTTc > 2:3787619/1‑100 (MQ=255) cgcgCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTc > 1:3898409/1‑100 (MQ=255) cgcgCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTc > 1:2442771/1‑100 (MQ=255) cgcgCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTc > 1:1836974/1‑100 (MQ=255) gcgcATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGTGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCg < 1:3160898/100‑1 (MQ=255) gcgcATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCg < 2:1780985/100‑1 (MQ=255) gcgcATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCg < 1:577593/100‑1 (MQ=255) cgcATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGt > 2:1803270/1‑100 (MQ=255) cgcATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGt > 1:1497090/1‑100 (MQ=255) aTTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAg > 2:1173336/1‑100 (MQ=255) aTTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTACACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAg > 1:1790788/1‑100 (MQ=255) ttGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAgg > 2:1829769/1‑100 (MQ=255) tGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGc < 1:1047565/100‑1 (MQ=255) tttAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTACACCATTTACTTCGTCAGGCCa > 2:3424694/1‑100 (MQ=255) ttAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCaa > 1:1632472/1‑100 (MQ=255) tAACGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAAt < 1:1797439/100‑1 (MQ=255) cGGATTATTACAGGAACCGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGCGCTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAGACCATTCCCTTCGTCAGGCCAATATg > 2:834968/1‑100 (MQ=255) cGGATTATTACAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTg > 1:942440/1‑100 (MQ=255) ttattaCAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAGCGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGccag < 2:1605139/100‑3 (MQ=255) tattaCAGGAACAGCGTGCACACCAAGATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCggg < 2:2447991/100‑1 (MQ=255) ttaCAGGAACAGCGTGCACACCGAAATCTACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGc < 1:3710843/100‑1 (MQ=255) ttaCAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGc < 2:2257948/100‑1 (MQ=255) ttaCAGGAACAGCGTGCACACCAAAAGCAACGGTTGCCAGAGTTGCGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCCTTTAGTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGc < 1:3811425/100‑1 (MQ=255) ttaCAGGAACAGCCTGCACACCAAAATCAACTGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGc < 2:3134116/100‑1 (MQ=255) taCAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCa > 1:3091415/1‑100 (MQ=255) taCAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCa > 1:2115662/1‑100 (MQ=255) aCAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAg < 1:3964996/100‑1 (MQ=255) cAGGAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGTGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAGt > 2:3863531/1‑100 (MQ=255) gAACAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAGTTTc > 1:605621/1‑100 (MQ=255) aaCAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAGTTTcc < 1:2222929/100‑1 (MQ=255) aaCAGCGTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAGTTTcc < 2:3613401/100‑1 (MQ=255) | GCATTTTATTGCCTTGATGTCACCCGAGCTGGACATAATGGCGTACTTGCTGCCTTGTTATTACGCGCATTGTTTAACGGATTATTACAGGAACAGCTTGCACACCAAAATCAACGGTTGCCAGAGTTGGGCGCGTTATTGAAGCAGGTAAACCATTTACTTCGTCAGGCCAATCTGCCGGGGCAGTTTCCGCT > NC_000913/1290836‑1291029 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |