| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,294,845 | A→C | pseudogene (148/567 nt) | insZ ← | pseudogene, transposase homolog |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,294,845 | 0 | A | C | 95.6% | 447.3 / 4.3 | 135 | pseudogene (148/567 nt) | insZ | pseudogene, transposase homolog |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/3); new base C (77/52); total (80/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CCAGCACAGTTTCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTAGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCAATGGCAAA > NC_000913/1294749‑1294941 | ccAGCACAGTTTCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGc < 1:2793712/100‑1 (MQ=255)ccAGCACAGTTTCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGc < 1:4042352/100‑1 (MQ=255)ccAGCACAGTTTCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGc > 1:2924882/1‑100 (MQ=255) aGCACAGTTTCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGt < 1:3900632/100‑1 (MQ=255) aGCACAGTTTCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGt < 2:3592288/100‑1 (MQ=255) cacaGTTTCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTc < 2:2485716/100‑1 (MQ=255) cacaGTTTCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTc < 1:2366139/100‑1 (MQ=255) acaGTTTCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCt < 1:1301867/100‑1 (MQ=255) caGTTTCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTg > 1:2132881/1‑100 (MQ=255) caGTATGGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGGCTTCACAGGTTCATTAAGGACACCAGACGCATAACCGGGTCGGAGTTCTg > 2:3765871/1‑100 (MQ=255) gTTTCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGcc > 1:1069635/1‑100 (MQ=255) gTTTCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGcc > 1:138200/1‑100 (MQ=255) gTTTCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGcc < 2:3929425/100‑1 (MQ=255) tttCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTGACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGCTTCATCAAGGCCACCAGCCGCATAACCGGGTCGGCGTTCGGCCg > 2:3961210/1‑100 (MQ=255) ttCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCA‑TAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCt < 2:2155220/100‑1 (MQ=255) tCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCt < 1:3951/100‑1 (MQ=255) ctctGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAg > 1:1935687/1‑100 (MQ=255) ctctGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAg < 1:3433552/100‑1 (MQ=255) tctGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGt < 2:446574/100‑1 (MQ=255) tctGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGt < 2:44217/100‑1 (MQ=255) tctGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGt < 1:1175672/100‑1 (MQ=255) tGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTgg < 1:2852133/100‑1 (MQ=255) tGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTgg < 2:1521455/100‑1 (MQ=255) gCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGa > 1:2865478/1‑100 (MQ=255) gCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGa > 2:3282494/1‑100 (MQ=255) ccGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGAt < 1:87494/100‑1 (MQ=255) cGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCATCAGAATGTGCCTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGAtg < 2:1107966/100‑1 (MQ=255) cGGTAACGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGAtg < 1:3995491/100‑1 (MQ=255) ggTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGAtgt > 1:2479860/1‑100 (MQ=255) ggTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGAtgt < 2:1369028/100‑1 (MQ=255) ggTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGAtgt > 2:3451223/1‑100 (MQ=255) aGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTg < 1:325131/100‑1 (MQ=255) ggTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTgg > 1:2836864/1‑100 (MQ=255) ggTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTgg > 1:1561858/1‑100 (MQ=255) ggTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTgg > 2:1955001/1‑100 (MQ=255) gTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGAAGCCTAACCGGGTAGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGACGTGTTGGc > 1:2031919/1‑100 (MQ=255) tGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCa < 1:92731/100‑1 (MQ=255) ntCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGAcc > 1:3076952/2‑100 (MQ=255) gTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCATTCTGCCGCTTAGTGGAGGTGTTGGCAGAcc > 2:3141496/1‑100 (MQ=255) cACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCa > 1:2539091/1‑100 (MQ=255) aTTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAatat > 1:138218/1‑100 (MQ=255) aTTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAatat > 1:3419628/1‑100 (MQ=255) cagcagAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCa > 2:1759781/1‑100 (MQ=255) cagcagAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCa > 1:1844097/1‑100 (MQ=255) gcagAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACg > 1:2567423/1‑100 (MQ=255) gcagAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTAGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACg > 1:1368702/1‑100 (MQ=255) cagAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGCCGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGc < 1:3845088/100‑1 (MQ=255) agAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCa > 1:497260/1‑100 (MQ=255) gAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAg > 1:896755/1‑100 (MQ=255) aaTGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGc < 1:4036353/100‑1 (MQ=255) tgtgACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTc < 1:1099071/100‑1 (MQ=255) gtgACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCGGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCAGAATATTCACACAGATCg > 1:3746624/1‑100 (MQ=255) gtgACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCg > 1:2812263/1‑100 (MQ=255) tgACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACGGGGTAGGCG‑TCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCggg < 2:2539032/100‑1 (MQ=255) tgACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCgg < 1:321966/100‑1 (MQ=255) tgACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCgg > 2:3218294/1‑100 (MQ=255) gACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCggg < 1:421844/100‑1 (MQ=255) aCTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGt < 1:1462124/100‑1 (MQ=255) cTTCCCAGTTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGtt < 1:3436516/100‑1 (MQ=255) tctcAGGTTCATTATGGCGACCCGACGCCTAACCGGGTCGGCCTTCTGCCGCTTAGTGGAGGTGTTGGCAGACCCATAATATTCATGCAGCTAGGGttca > 2:846179/4‑98 (MQ=255) tCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTa > 1:1542648/1‑100 (MQ=255) cAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCa > 1:3351487/1‑100 (MQ=255) ggTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAgg < 1:3925609/100‑1 (MQ=255) aTTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTcc < 1:2071031/100‑1 (MQ=255) aTTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTcc > 2:758813/1‑100 (MQ=255) aTTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTcc > 1:2992523/1‑100 (MQ=255) aTTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTcc > 1:610383/1‑100 (MQ=255) aGGCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGaa > 1:2219346/1‑100 (MQ=255) ggCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAAc < 1:1850320/100‑1 (MQ=255) ggCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAAc > 2:3886928/1‑100 (MQ=255) ggCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCACCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAAc > 2:2177595/1‑100 (MQ=255) gCCACCAGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGCTGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACt > 2:3901272/1‑100 (MQ=255) gCCACCAGACGCATAACCGGGTAGGCGTTCTGCCGATTAGTGGATGTGTTGGCAGAACCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACt < 2:389783/100‑1 (MQ=255) ccaccaGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACtg > 2:956760/1‑100 (MQ=255) ccaccaGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACtg > 1:28305/1‑100 (MQ=255) caccaGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAAcacg > 2:2777073/1‑97 (MQ=255) accaGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACtgtg > 1:1219152/1‑100 (MQ=255) accaGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACtgtg < 2:1815078/100‑1 (MQ=255) ccaGGCGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTgc > 2:2380012/1‑100 (MQ=255) caGACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTgcg > 1:234257/1‑100 (MQ=255) gACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGcc > 2:1476976/1‑100 (MQ=255) gACGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGcc > 1:3716359/1‑100 (MQ=255) cGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCAt > 1:1132686/1‑100 (MQ=255) cGCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCAt > 1:3347544/1‑100 (MQ=255) gCATAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGGGTCCTGAACTGTGCGCCATc < 1:3100628/100‑1 (MQ=255) aTAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCaa > 1:3715657/1‑100 (MQ=255) aTAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCaa > 1:2807336/1‑100 (MQ=255) aTAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCaa > 2:2931826/1‑100 (MQ=255) tAACCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCAAt > 1:2252107/1‑100 (MQ=255) aaCCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTTGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCAATg < 1:3846763/100‑1 (MQ=255) aaCCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCAATg < 1:1740524/100‑1 (MQ=255) aCCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCAATgg > 1:2916585/1‑100 (MQ=255) aCCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCAATgg > 2:775008/1‑100 (MQ=255) aCCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCAATgg > 2:886379/1‑100 (MQ=255) aCCGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTCGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCAATgg < 1:331929/100‑1 (MQ=255) ccGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGGCCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCAATGGc < 2:557763/100‑1 (MQ=255) ccGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCAATGGc < 2:1110312/100‑1 (MQ=255) ccGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGAGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCAATGGc < 2:2071795/100‑1 (MQ=255) cGGGTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCAATGGCa > 2:3452714/1‑100 (MQ=255) ggTCGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCAATGGCaaa > 2:2118645/1‑100 (MQ=255) | CCAGCACAGTTTCGCTCTGCCGGTAAGGTGCGGTCACGGCATTCAGCAGAATGTGACTTCCCAGGTTCATTAAGGCCACCAGACGCATAACCGGGTAGGCGTTCTGCCGCTTAGTGGATGTGTTGGCAGACCCATAATATTCACGCAGCTCGGGTTTATCAGGTGTCCTGAACTGTGCGCCATCAATGGCAAA > NC_000913/1294749‑1294941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |