| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3698975 | 131 (0.970) | 8 (0.060) | 6/330 | 9.0 | 6.2% | coding (762/1680 nt) | bcsG | DUF3260 family cellulose production inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 3699049 | 117 (0.910) | coding (836/1680 nt) | bcsG | DUF3260 family cellulose production inner membrane protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
GGTAACGCAGCGGCAACCGTTGCGGCGACGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGCCACCTCCTACAGTGGCCCGGCGGCGATCCGTTTACTGCGCGCCAGCTGCGGGCAGACTTCGCACACTAATCTGTATCAACCGGCAAATAACGACTGCTATCTGTTTGATAACCTTTCGAAACTGGGCTTTACCCAGCACCTGATGATGGGACATAACGGCCAGTTCGGCGGTT > NC_000913/3698739‑3699207 | ggtAACGCAGCGGCAACCGTTGCGGCGACGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGtt > 1:1316805/1‑239 (MQ=255)ggcaaCGCAGCGGCAACCGTTGCGGCGACGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGtt > 2:1621869/4‑239 (MQ=255) aCGCAGCGGCAACCGTTGCGGCGACGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGAt < 2:840601/238‑1 (MQ=255) gaGCGGCATCCGTTGCGGCGACGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACGGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGt < 2:1381067/236‑1 (MQ=255) gCGGCAACCGTTGCGGCGACGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCa > 1:1230724/1‑239 (MQ=255) cGGCAACCGTTGCGGCGGCGGGTGGCGCCCCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCa < 1:1162193/238‑1 (MQ=255) cGGCAACCGTTGCGGCGACGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACACCGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCa > 1:1823587/1‑238 (MQ=255) cGGCAACCGTTGCGGCGACGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTg < 2:501674/230‑1 (MQ=255) cGGCAACCGTTGCGGCGACGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTg > 1:501674/1‑230 (MQ=255) cGGCAACCGTTGCGGCGACGGGCGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAAATGCACCGCCAACAACGGCGAAACTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACATTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATTTAGCAGCCGCCGGGTTGATTTCGCa > 2:922142/1‑238 (MQ=255) aaCCGTTGCGGCGACGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCa < 2:1820917/238‑1 (MQ=255) cgACGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCa < 1:1258525/238‑1 (MQ=255) aCGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCAtt > 1:866958/1‑238 (MQ=255) 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aGTGGGTGATATGCCCGCACAAACGGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAg < 1:927565/238‑1 (MQ=255) ggTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGGCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGa > 1:1673661/1‑235 (MQ=255) tGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGTACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTa > 2:37469/1‑239 (MQ=255) atatGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTa > 1:1435603/1‑237 (MQ=255) tatGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGt < 2:1369189/185‑1 (MQ=255) tatGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATc < 1:496011/197‑1 (MQ=255) tatGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATc > 2:496011/1‑197 (MQ=255) gCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCg < 1:960532/239‑1 (MQ=255) ccGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGcc < 1:1099315/239‑1 (MQ=255) ccGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGcc > 2:169623/1‑239 (MQ=255) ccGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGcc < 1:104104/239‑1 (MQ=255) cGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGcc > 1:1500995/1‑238 (MQ=255) tGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGCCACCTCCTACa > 2:1179106/1‑239 (MQ=255) 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1:959531/157‑1 (MQ=255) aCATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGt > 2:81737/1‑63 (MQ=255) aCATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGt < 1:81737/63‑1 (MQ=255) aCATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGCCACCTCCTACAGTGGCCCGGCGGCGATCCGTTTACTGCGCGCCAGCTGCGGGCAGACTTCGCACACTAATCTGTATCAACCGGCAAATAACGACTGCTATCTGTTTGATAACCTTTCGAAACTGGGCTTTACCCAGCa > 1:791266/1‑238 (MQ=255) aCATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGCCACCTCCTACAGTGGCCCGGCGGCGATCCGTTTACTGCGCGCCAGCTGCGGGCAGACTTCGCACACTAATCTGTATCAACCGGCAAATAACGACTGCTATCTGTTTGATAACCTTTCGAAACTGGGCTTTACCCAGCAc < 1:1033185/239‑1 (MQ=255) cATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGt < 1:1498070/41‑1 (MQ=255) tCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCg > 1:275508/1‑96 (MQ=255) 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cgccgGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCACCACCTCCTACAGTGGCCCGGCGGCGATCCGTTTACTGCGCGCCAGCTGCGGGCAGAATTCGCACACTAATCTGTATCAACCGGCAAATAACGACTGCTATCTGTTTGATAACCTTTCGAAACTGGGCTTTACCCAGCACCTGATGATGGGACATAAAGGCCAGTTCGGCGGtt > 1:32714/1‑239 (MQ=255) | GGTAACGCAGCGGCAACCGTTGCGGCGACGGGTGGCGCACCGGTAGTGGGTGATATGCCCGCACAAACTGCACCGCCAACAACGGCGAACCTTAACGCCTGGCTGAATAATTTCTATAACGCGGAGGCGAAACGTAAATCGACCTTCCCGTCTTCGCTGCCCGCTGATGCTCAGCCATTTGAACTACTGGTGATTAACATCTGTTCGCTTTCCTGGTCGGATATAGAAGCCGCCGGGTTGATGTCGCATCCACTGTGGTCGCATTTCGATATTGAGTTCAAGAACTTTAACTCCGCCACCTCCTACAGTGGCCCGGCGGCGATCCGTTTACTGCGCGCCAGCTGCGGGCAGACTTCGCACACTAATCTGTATCAACCGGCAAATAACGACTGCTATCTGTTTGATAACCTTTCGAAACTGGGCTTTACCCAGCACCTGATGATGGGACATAACGGCCAGTTCGGCGGTT > NC_000913/3698739‑3699207 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |