Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,745,019 | 0 | C | G | 33.3% | 38.0 / 11.5 | 42 | G72G (GGC→GGG) | yiaN | 2,3‑diketo‑L‑gulonate TRAP transporter large permease protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (7/21); new base G (8/6); total (15/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.54e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.07e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
CACCGCAAGGAGCTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGC‑TATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCC > NC_000913/3744785‑3745246 | cACCGCAAGGAGCTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCt < 2:294740/239‑1 (MQ=255) aGCTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAAc < 2:1668585/238‑1 (MQ=255) gCTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAACg < 1:347839/238‑1 (MQ=255) cTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGAAATCATGAAAGC‑GGGC‑GGCCTTTCAAAAAGCa > 1:375476/1‑239 (MQ=255) ggCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAAc < 1:957869/227‑1 (MQ=255) ttttttgttttttCTGGGTTGTTTGTTGGGTGGTATTGCTTTGGGTTTGCCTTTTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGTGGGACATGTTTGATTTCCAGATCATGGCACAAGCGGTGTTGAAGGGGGCCGATATCTTC‑TCCCTGCTGGCGTTTCCTTTCTTTTTGCTGGGGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGG‑GTTTTGTCAAAACGCATTTTGGCCCTg < 2:353766/230‑1 (MQ=255) tgCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGGAAACATGGATGC‑GGGG‑GGCTTGTTCAAAAGCATTGTTGACCTGCCg > 1:1392344/1‑239 (MQ=255) tgCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCAGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGGAAACATGAATGC‑GGGCGGGCTTGTC‑AAACGCATTGGTGTCCTGCCg > 2:751848/1‑239 (MQ=255) tgtaTTTTTCTGGGCTGTTGGTTGGGGTGTTTGGCTTTCGTTTTGCCTTTTGCCGGGGCAGTGTTGTTGGGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACGTTTTTGATGTCCAGTTCATGGCACAAACGCGGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑CCCCTGCTGGCGATTCCTTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAAGGC‑GGGG‑GGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGa < 2:479658/235‑1 (MQ=255) aTTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGGAAACATGAAATG‑GGGG‑GGGTTGTCTACACGCAttgttgt > 2:957869/1‑226 (MQ=255) tgtgggttttttgtTGGGTGGTATTGCTTTCGTTTTGCCTATGGCCGGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGAGTTATTGTTCGGGCTGGACATGTTTAATGTCCAGATACGGGCACAACCCCTGGTGAGCGG‑GCCTGTTGCCTCATCCCTGCTGGCGGTCCCGTTTTTTGTGCTGGGGGGTAAAGTCGAAAATGC‑GGGC‑GGTTTAGCAAAACACTTTGTTGACCTGCCGATGAAACtgg < 2:813942/228‑1 (MQ=255) tCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAAAAAAGAATGCGGGGG‑GGGCTGCCAAAAC‑CATTTCTGACCTGCGGAGGACACtgg > 2:222374/1‑239 (MQ=255) gtGGGTTTTCTGTTGGGGGGTTTTTTGTTGGGTTTGCCTTTGGCCGGGGCTGTGTTGTTGTGGGGGGGGGCTTTAATTTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCAGGGCACAACCGGTGGTGAAGGGGGCCGATAGCTTC‑CCCCTGCTGGCGTTTCCGTTTTTTGGGTTGGGGGGGAAAATCATGAAGGC‑GGGG‑GGTTTGTCAAAACGCTTTGTTGACCTGCCGATGAAACtggt < 2:782973/238‑1 (MQ=255) ggggCTGTCTTTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCAATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGTTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACtggt‑g < 1:751848/238‑1 (MQ=255) tctgtTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCt < 1:925774/194‑1 (MQ=255) ttggtTTTGCTGTCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCTTTAATGTTTTGGCTGGACATGTTAGATGTCAAGATCATGGCAGAAGCGCTGGTGAACGGAGCAGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGGGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGG‑GGTTTGTAAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAgg < 1:222374/237‑1 (MQ=255) ggtATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGCTGAAATACTGAATGC‑GGGC‑GGGGTGTCTAAACg > 2:925774/1‑194 (MQ=255) tATTGCTATCGGTTGGCCTATTGCCGGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCGGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAGCGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCATTCTTTGTGCTGGGGGGGAAAATCAGGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAACGCATTGTTGCCCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCggg < 1:1288470/238‑1 (MQ=255) ggTTTGCCTATCGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGG‑GGCTTGTCAAAACGCATTGTTTACCTGCCGATGAAACTGGG‑GGGGCATAAACCCGGCgggctgg > 1:1734944/1‑232 (MQ=255) ttGCCTATTGCTTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGGTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGG‑GGGGCATAAACCAGGCGGGCCGGGCTACGTCg > 1:1744173/1‑238 (MQ=255) tATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGGAAACATGAATGC‑GGGG‑GGCTTGTCAAAAAGCAATTTTGACCTGCCGGTGAAACTGGT‑GGGGCATTAACCAGGCGGGGCGGGCTACggtcgtct > 1:1021845/1‑230 (MQ=255) tGCCTGGGCACTGTTGTTGGGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGGGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAACGCATTGTTGCCCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTgg < 1:155762/239‑1 (MQ=255) gCCTGGGCATTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTGGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCAATGAAACtggt < 1:1761921/197‑1 (MQ=255) ttgtggtGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCGGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAAGGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAACCGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCggg < 1:1031377/204‑1 (MQ=255) gggCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGGAATCATGAATGC‑GGGG‑GGCCTGTCAAAACGCCTTGTTGACCTGCCGAAGAAAATGGG‑GGGGCCTAAAACACGGggggtggggcctg > 2:1031377/1‑199 (MQ=255) gggCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGaaaa > 1:1536534/1‑170 (MQ=255) gcgggtttAATGTTCTGGCTGGACATTTTTGATGTCCAGATCAGGGCACAAACGCTGGGAAGCGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGC‑TATGATTATGGCGAGCCttt < 1:205382/232‑1 (MQ=255) tGTTCTGGCGGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGGTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCGGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAACGCATGGTTGCCCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGC‑TATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGcc < 1:438347/239‑1 (MQ=255) gACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTTTTTGTGCGGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATaa < 1:1402100/161‑1 (MQ=255) aTGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGAAAATATGAATTC‑TGGG‑GGCTCGTCAAAACGCATTGGTGGCCTGTCGCTGGAAATGGTGGGGGGATAAA‑CAGGCggg > 2:1402100/1‑161 (MQ=255) tGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAACGCAt < 1:1636847/117‑1 (MQ=255) aTCATGACAAAAACCCTGGTGAAGGGAGCAAATAGCTTC‑ACCCTGCTGACATTTCCGTTTTTTGGGCTGGCGGGTAAATACAAGAAGGC‑GGGG‑GGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACtggt < 1:1407706/134‑1 (MQ=255) tCATGGCAAAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCTTTCTTTGTGCTGGCGGGTAAAATCATGAAGGC‑GGGC‑GGTTTGTCAAAACGCATTTTTGACCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGC‑TATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGct < 1:1598555/236‑1 (MQ=255) tCAGGGCACAAACGCTGGTGACCGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGTTTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGC‑TATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCATTGCCGCTCTa < 1:1777298/239‑1 (MQ=255) cATGGCACAACGGGTGTGGAGGGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTTTTTGTGTTGGGGGGTAAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAACCGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGC‑TATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTAc < 1:165803/239‑1 (MQ=255) ggCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGAAAAAATGAATGC‑GGGG‑GGCCTGGCAAAAAGCATTGTTGACCTGCCGATGGAACTGGG‑GGGGCAAAAACCAGGCGGGGTGGGGCACGTCGGCGGGCGGGGAGCTTATGTTAGTGGGGGGCCTTGTTGGTTTTGCCGTGGCGGAGCCCGCGCCCGGTGCCggcctatgg > 2:1703637/1‑231 (MQ=255) aaaCGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGACATCCTTAATTC‑GGGC‑GGGTTGTCCAAAAGCCATGTTGGCCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCCTaaa > 2:1407706/1‑134 (MQ=255) cggATAGCTTC‑CCCCGGGTGGCTTTTGTGTTCTTTGTGGGGGGGGGTCAAATGATGAGGGG‑GGGG‑GGGTTGACAAAGCGGTTTTTTGCCCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGC‑TATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGAATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCaa < 2:388955/236‑1 (MQ=255) cccTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCCGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCGGGCTTGGCTACGGCGGCGGGCCGGCAGG‑TATGAt > 1:54608/1‑145 (MQ=255) gggttttCCTTTCTTTGTGCTGGGGGGTAAAATTTATATTGG‑GGGC‑GGTTTGTAAAACCGCTTGTTTGCCCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGC‑TATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGggcgg < 1:708149/234‑1 (MQ=255) gTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCgggc < 1:494705/98‑1 (MQ=255) aTGAATGC‑GGGC‑GGCTTGCCAAAACGCATGTTTGACCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGC‑TATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGcc < 1:968237/239‑1 (MQ=255) gggc‑ggCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGC‑TATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGGGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCAt > 1:1508791/1‑222 (MQ=255) | CACCGCAAGGAGCTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTGCCTATTGCCTGGGCACTGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTC‑TCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGTGAAATCATGAATGC‑GGGC‑GGCTTGTCAAAACGCATTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGT‑GGGGCATAAACCAGGCGGGCTGGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGC‑TATGATTATGGCGAGCCTTTCTGGTTCTGCCGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGGTCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCC > NC_000913/3744785‑3745246 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |