Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,876,015 | 0 | A | G | 32.1% | 91.5 / 12.4 | 56 | I115V (ATT→GTT) | yeaN | putative MFS transporter, inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (13/25); new base G (18/0); total (31/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.13e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
CGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGG‑CTTTGAACGGTTTTGGCTGGCA‑AGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGCCACAGTGGCG‑AAGTCAACAA > NC_000913/1875788‑1876248 | cGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGCATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGGAttttgg > 1:875231/1‑235 (MQ=255) gATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACCGCGCAAACCGGCTTATTGCCCCCCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCTCCTTTGGCTGCCCCGATAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCa < 2:422486/239‑1 (MQ=255) ttCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTTCATTAGGCAAt > 1:515157/1‑239 (MQ=255) cTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCAGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGCTTTGGTATGGAACGTATCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTTCATTATGGCATGGCTTACt > 1:936732/1‑238 (MQ=255) ttACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAGTGTCTTACTGc < 1:988645/239‑1 (MQ=255) cTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTAAGCAATGTCTTTCTGCCAGGatt > 2:988645/1‑239 (MQ=255) gacAGCGCAAACCGGCTTATTGACCCCCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCGCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTc < 1:1031947/220‑1 (MQ=255) cTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTc > 1:267860/1‑239 (MQ=255) cccTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCg < 1:495383/237‑1 (MQ=255) attGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTTCCTTAGGCAAGGTGCTTCTGCCAGAGTTAATTAAATG‑CGTTTTCCCCCCTTTCCTCGCCAGagcttcc > 2:495383/1‑232 (MQ=255) ttGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCCGACTTACCg > 1:119873/1‑238 (MQ=255) ggCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGCGGGATTGCATTAAGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTTGCCAGACTTACCGgc > 1:316116/1‑238 (MQ=255) cTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCa < 1:501533/238‑1 (MQ=255) tGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGGATTAAGCCATGTCTTTCTGCCAGGGTTAATTAAACGCCGATTT‑CCTCCTTTCCTCGCCCGACCTAACGGCGCatat > 2:1033282/1‑238 (MQ=255) tGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTTATTAAACG‑CGGTTTCCCTCCTTCCTGTGCCACACTTAACGGCGCATAtt > 2:53296/1‑239 (MQ=255) tGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGa > 1:640185/1‑187 (MQ=255) tGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGa < 2:640185/187‑1 (MQ=255) tGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTaaa < 2:936995/196‑1 (MQ=255) tGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTaaa > 1:936995/1‑196 (MQ=255) ttGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGc < 1:608471/239‑1 (MQ=255) ttGGCGGCCCGGGTAGCGCGTCGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTGCTTTTGATCTTTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTCCTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGc < 2:96232/239‑1 (MQ=255) cccGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAg < 2:21904/236‑1 (MQ=255) ggTTGCCCGACCTTTTGGTATGGAACGTAGCCTTTTTGGCGCGTTACTTTTGATCTTTGCTGGTAGCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCTGTACAGCGGTCATTGGCGGTGTGATTGCATTAGGCTATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGCCGCCAGACTTACCGTCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCAc < 2:472263/239‑1 (MQ=255) gcgACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGa < 1:571424/238‑1 (MQ=255) cgACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTAGGCAATGTCTTTCTGCCAGGGTTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTTCGTCGCCCGACTTACCCGCGCATATTCCCTGACAATTGGAGCTGCCGCGGCCCTggggat > 2:301309/1‑236 (MQ=255) cgACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAAAG‑CGATTTCCCTCATTTCGTCCCCAGACTTACCCGCGCATATTCCCTGTCAATTGGGGCTGCCGGGGCACTtggggc > 2:571424/1‑236 (MQ=255) aCGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCCTTAAGCAATGTCTTACTGCCCGGTTTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCCTACCATGGGAGCTGAAGCGGCACCTGGATCg > 1:151341/1‑238 (MQ=255) aaCGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTGCCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAg < 1:354872/210‑1 (MQ=255) gTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTAAGCCATGTCTTACTGCCCGGATTAATTAAACG‑CGACTTCCCTCATTCCGTCGCCCGCCTTACCGGCGCCTATTTCCTGACAATGGGGGCTGCAGCGGCACTggg > 2:354872/1‑210 (MQ=255) gcgTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGCGGGGTTGGATTAGGCTATGTCTTTCTTCCAGGAATAATTAAACA‑CGATTTCCCCCTCTTTCTCGCCCGACCTTCCAGCGCCAATTTCCTTAAAATTGGAGCTGCATCCGCCCCTGGATTGGCTTTTGGCCTGCCGCTGGCCTTTGacc > 2:322819/1‑233 (MQ=255) ttACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGGCGTGCCGCTGG‑CTTTGAACGGGTTtgg > 1:812023/1‑239 (MQ=255) cTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGG‑CTTTGAACGGTTTTGGCTGGCA‑AGgcg < 1:301309/239‑1 (MQ=255) gtgCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGG‑CTTTGAACGGTTTTGGCTGGCA‑AGGcgcg < 1:471196/239‑1 (MQ=255) tgCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGG‑CTTTGAACGGTTTTGGCTGGCA‑AGgcgc < 1:331048/237‑1 (MQ=255) tgCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGG‑CTTTGAACGGTTTTGGCTGGCA‑AGGcgcg < 1:774694/238‑1 (MQ=255) tGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGG‑CTTTGAACGGTTTTGGCTGGCA‑AGGCGCGTTGc < 1:398233/239‑1 (MQ=255) gTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTTGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTTCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCata > 1:28862/1‑148 (MQ=255) gTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCata < 2:28862/148‑1 (MQ=255) gCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTTCATTAGGGAATGTCTTTCTGCCAGGGTTAATTAAACG‑GGCTTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCAATTTCCCTGACAATGGGGGCCTCGGCGGCGCCCGGCTCGGCCATGGGCGTGCCGCCGG‑GCTTTTACGGTTTTGGCTGGCT‑ACGCGCGGTGCCCATGc > 2:331048/1‑238 (MQ=255) gCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTTGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGG‑CTTTGAACGGTTTTGGCTGGCA‑AGGCGCGTTGCTCAt > 1:969764/1‑236 (MQ=255) gCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTAGGCAATGTCTTTCTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTTCCTCATTCCGTCGCCCGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCCCTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGG‑CTTTGGACGGGTTTGGCTTGCA‑AGGCGCGGTGCTCAt > 2:949728/1‑236 (MQ=255) gCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGTTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGGTTAATTAAAAG‑CGGTTTTCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCACATTCCCTGACAATGGGGGCTGCCGCGGCCCTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCCCTGG‑CTTTGTACGGGTTTGGCTGGGC‑AGGGGCGTTTGTCAt > 2:398233/1‑236 (MQ=255) gCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAAGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCCCATTCCGTCGCCCCACTTACCGGCGCATATTTCCCGACAATGGGAGCTGCAGCGGCCCTGGGATCGGCTCTGGTCGTGCCCCTCG‑CCTTGAACGGGTTTGGTTGGCC‑AGGGCCGTTTCTCATGc > 2:774694/1‑238 (MQ=255) cGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGGGCTGCAGCGGCACTGTGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGG‑CTTTGAACGGTTTTGGCTGGCA‑AGGCGCGTTGCTCATGCTGAtgtg < 1:1033282/239‑1 (MQ=255) cGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGGCTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCCGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCCTTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCTTATTCCCTTACAATGGGAGCTGCAGCGGGCCTGGGCTCGGCCATGGTCGTGCCCCCTG‑CTTTGTAAGGTTTTTGTTTGCC‑AGGCCCGCTGTCCCTGCTTTTGTGGTTTTCTctgctt > 2:3602/1‑238 (MQ=255) acttaTTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGGGGGGTTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAAAG‑CGATTTCCCCCATTCCGTCGCCAGACTTACCCGCGCATATTCCCTGACTCTGGGGGCTGCGGCGGCACTGGGATCGGCCATGGTCGTTCCGCTGG‑CCTTGTACGGTTTTGGCTGGCA‑AGGCCCGTGTCTCATTCTGCTTTGTTTTCTTCtggtggg > 2:790218/1‑234 (MQ=255) attattTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGGGGGATTGCATTTGGCAATTTCTTTCTGCCCCGGTTTATTTAACG‑CGCTTTTCCTCATTTCGTCGCCCGACTTACCGGCGCATATTTCCTTACAATTGGAGCTGCCGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCCGG‑CTTTTAACGGGTTTTGCTGGCC‑ATGCGCGTTGCTCATGCTGTTGTGTTTTTCTTTTCTTGCTTcttttt > 2:701815/1‑239 (MQ=255) tattTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCCTTAGGCAATTTCTTACTTCCAGGGTTTATTAAACG‑CGATTTTCCTCCTTCCGTCTCCCGAATTTCCGGCGCATATTCCCTGTCCATTGGGGCTGCCGCGGCCCCGGGGTCGGCTCAGGTCCGGCCCCCTG‑GTTTTAACGGTTTTTGCTGGCACAGGC‑CGGTGGTCCTTCTGTTGTGTGTTCTCCTGCTGGGTCtttttttt > 2:503516/1‑238 (MQ=255) attTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGG‑CTTTGAACGGTTTTGGCTGGCA‑AGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTAt < 2:267860/239‑1 (MQ=255) ggCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCCTTAGGCAATGTCTTTCTGCCAGGATTAATTAAAcg > 2:168301/1‑68 (MQ=255) ggCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAAcg < 1:168301/68‑1 (MQ=255) ggTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGG‑CTTTGGACGGTTTTGGCTGGCA‑AGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGc < 1:38506/238‑1 (MQ=255) tACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGG‑CTTTGAACGGTTTTGGCTGGCA‑AGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCttttttt < 1:523001/228‑1 (MQ=255) cATTGGCGGTGGGATTGCCTTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGGTTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGGGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGG‑CTTTGAGCGGTTTTGGCTGGCA‑AGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGCCACAGTGGCG‑aa < 2:936732/239‑1 (MQ=255) aTTGGCGGTGGGGTTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGGTTAATTAAAAG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCCGACTTACCGGCGCATATTTCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCCATGGGCGTGCCGCCGG‑CTTTTGACGGGTTTGGCTGGCA‑AGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTTTTCTGGGTCTTTTTTTTTTGCTGccc > 2:523001/1‑227 (MQ=255) tGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTTCTGCCAGGAATAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCCGACCTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGGTCTTCAGCCGCACTGGGATCGGCCCTGGTCGTGGCGCCGG‑CTTTGAACGGTTTTTGCTGGCC‑AGGCGCGGGTCTCATTCCGATGTGTTTTCCTCTTCTTGGTCCTTTTTTTTGGCTGCCACACTGGGGCAAGTcaaaac > 2:823105/1‑236 (MQ=255) | CGATTCGTTCCGCTTACTCGCTGACGACAGCGCAAACCGGCTTATTGACCACCCTGCCATTATTGGCCTTTGCGCTAATCTCACCTTTGGCTGCCCCGGTAGCGCGACGTTTTGGTATGGAACGTAGCCTGTTTGCCGCGTTACTTTTGATCTGTGCTGGTATCGCAATTCGCTCTCTCCCTTCGCCTTACTTATTATTTGGCGGTACAGCGGTCATTGGCGGTGGGATTGCATTAGGCAATGTCTTACTGCCAGGATTAATTAAACG‑CGATTTCCCTCATTCCGTCGCCAGACTTACCGGCGCATATTCCCTGACAATGGGAGCTGCAGCGGCACTGGGATCGGCTATGGTCGTGCCGCTGG‑CTTTGAACGGTTTTGGCTGGCA‑AGGCGCGTTGCTCATGCTGATGTGTTTTCCTCTGCTGGCTCTTTTTTTATGGCTGCCACAGTGGCG‑AAGTCAACAA > NC_000913/1875788‑1876248 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |