| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,608,244 | 0 | T | G | 40.0% | 56.5 / 10.9 | 55 | V443G (GTG→GGG) | hyfF | hydrogenase 4, membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (9/24); new base G (21/1); total (30/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.98e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCACGCGCGATCTCAACGTCGTCTGTGGGATGCTCAAAATCATGCCATTTACCGCC‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTCCACAACCTGTCATCAGGATCCTGGCGGGCGCTTCCACTATAGTCCTCTCAGGGACGCACGATCTGCCTGCACAACGTAGCACCTGGCATGATTTTTTGCCTTCAGGCACCGCATCTGTTTCG > NC_000913/2608013‑2608476 | gCACGCGCGATCTCAACGTCGTCTGTGGGATGCTCAAAATCATGCCATTTACCGCC‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGGACGGATGGCTGCGCGGGGGTTAATg > 1:230330/1‑239 (MQ=255) cgcgATCTCAACGTCGTCTGTGGGATGCTCAAAATCATGCCATTTACCGCC‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCCGGGACGGATGGCTGCGCGGGGGGTAATGGCGaa > 1:552338/1‑239 (MQ=255) gcgATCTCAACGTCGTCTGTGGGATGCTCAAAATCATGCCATTTACCGCC‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGGGTTAATGGCGaaa > 1:505556/1‑239 (MQ=255) cgtcgtCTGTGGGATGCTCAAAATCATGCCATTTACCGCC‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCCGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCCGGGGAGGGCGGCTGCGCGGGGGGTTATGGGGGAAccgcccgcgg > 2:697910/1‑234 (MQ=255) tggttgggggATGGTCAAAATCCTGCCTTTTCCCCCCGGCGGTGTTGGGGGGGGGTGCGCGGGCGTTGGAAGGTGTGCCGCCCTTCAACTTTTTTCTGGCGGATTTTTTGCCCATTCCCG‑CCGGACTGGCATTTAATCCCCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCGGGGGGGCCTGGTCGGGAGGGCGGGGGGGGTTTTAAGGGCGAAACCGCCG‑CAGGcc < 2:404639/232‑1 (MQ=255) ggggatcccaaaatTCATGCCTTTTCCCGCG‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCACCATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAAc < 1:852621/228‑1 (MQ=255) cTCAAAATCATGCCATTTACCGCC‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCGTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGTGCTTGTACGGGGGGCTGCGCGGGGGGTTATGGCGAAACCCCCGCCGGGCGGTTAACGgggggg > 2:393566/1‑237 (MQ=255) cTCAAAATCATGCCATTTACCGCC‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGGGa > 1:927308/1‑239 (MQ=255) cTCAAAATCATGCCATTTACCGCC‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGGACGGAAGGCTGCGGGGGGGTTTATTGGGGAAACGCCG‑CAGGGCGTTAAACggggggg > 1:628509/1‑236 (MQ=255) aaaTCATGCCATTTACCGCC‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGCCCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGAtctc < 1:195053/239‑1 (MQ=255) tGCCATTTACCGCC‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGGGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGGGATCTCGGCTgg > 1:594897/1‑239 (MQ=255) tGCCATTTACCGCC‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGGACGGATGGCTGCGCGGGGGTTAATTGCGAAACCGCCG‑CAGGGCGTTAACCCGGGGGGTCTCGGCTgg > 1:208094/1‑239 (MQ=255) tGCCATTTACCGCC‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCCGGTCCGGGGGGCCGCGCCGGGGGTTATGGGGGAAACGCCC‑CCGGCCGTCAACCCGGGGGAGGTTGGCTgg > 2:829637/1‑239 (MQ=255) tACCGCC‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGATTTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTTTTGCTGTTAACGCTGGGGCTGGCGGGGCGGGGACGGAGGGGTGCGCGGGGGTTCATGGGGAAACCGCCG‑CGGGGCGTGTAACGGGGTGGTCTCGCGTGGtggggcc > 2:417578/1‑233 (MQ=255) cgcc‑gTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGGTGGGGGTGCGGGGGGTAATGGCGAAAACGCCG‑CCGGCCGTTAACCGGGGGGGTCTCGGGTGGTTGgcgacc > 2:605328/1‑238 (MQ=255) ggTGCGCTGGCGAGGGCAGTGCTGCCGCCCTTCAACTTTTTTCTTAGGAAATTTATGCCCTTTCCCC‑GCGGACTGGAACGTAATCCCCGGCTTATTATCGTCCTGCTTTTTTTGCTGTTAACGCTGGTGCGGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGTGTTAAGGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTctgc < 2:628509/238‑1 (MQ=255) gTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGGACGGATGGCTGCGCGGGTGTTAATGGGGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGGGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCCA‑TGGGGATTct > 1:264203/1‑235 (MQ=255) gctggcAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGGGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGCTAACCGGGGGGGTCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCCA‑TGGGGATTCTGCTTGTCatgat > 1:501246/1‑237 (MQ=255) gctggcAGGGATGCCCCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGCCCATTCCCG‑CCGGACTGGCACTTAATCACCTGCTGATTATCGTCCGGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCatgatg < 1:577389/238‑1 (MQ=255) ggggttccccccTTTAATATTTTTTGTTGCGAGATTTTGGCCCTTTCCGCCCGGACGGGAGCGTAATCCCCGGCGGATTAGGGTCCTGTTTTTTTGGCTGTAAACGCGGGTGCTGGCGGGCCTGGTGCGGAGGGCTGCGGGGGTGTAAATGGGGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑g < 2:552338/229‑1 (MQ=255) gggATCCCGCCCTACAACATTTTCTTTACGGATTTTTACCCCTTTCCCG‑CCGGACGGGCCGGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGTTGTTAACGCTGGTGCGGGCGGGCCTGGTCCGGAGGGCTGCGCGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑Ga < 2:230330/238‑1 (MQ=255) ccgccCTTCAACTTTTTTTTTGGCGATTTGAGCACCATCCCCG‑CCGGAGTGGCGTGTACTCCCCGGCTGTTTGTCGTCCTGTTGTTATTGCTGTTACCGGTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGTGTTAAGGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑c < 2:501246/239‑1 (MQ=255) ccgccCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGGCTGGTACGGATGGGTGCGCGGGGGTTAATGGGGGAACCGCCG‑CCGGCCGTTTAACGGGGGGGTCTCGGGTGGGTGGCCACCCCCCCCA‑TGGGGGTTTTGCCGGTCATGCTGCCGGC‑GTTgggga > 2:302465/1‑236 (MQ=255) ccTTCAACTTTTTTTTTGGCGATTTTATACCCATTACCG‑CCGGACGGGCACGTAATCACCTGCTGTTTACCGTCCTGTTGTTATGGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGAGGGCGGCGCGGGTGTTAAGGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCat < 2:1027560/239‑1 (MQ=255) cTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGGGTTAATGGGGCAACCGCCG‑CCGGCCGGTAACCGGGGGGGTTCCGGGTGGGTGACCACCTCCCCAA‑TGGTGAATCTGCTGGGCATTATTCTGGCGGATGGGacgcaga > 2:784181/1‑233 (MQ=255) cTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGGGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGGGATCTCGGCTGGTTGACCCCCTCGCCAA‑TGGGGGTTCTGCTGGGCATTGTTGTGGC‑GGTGGGAA‑CGCata > 1:1027560/1‑239 (MQ=255) ttCAACATTTTTCTGAGCAATTTTAGGCCCATTCCCG‑CCGGACGGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTAAACGCGGGTGCGGGGGGGCCTGGTAGGGAGGGCGGCGGGGGTGTTAAGGGCGAACCCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTc < 2:706299/205‑1 (MQ=255) ttCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGGGATTCTGCTGGTCat > 1:706299/1‑205 (MQ=255) aTTCCCG‑CCGGACTGGCACGTAATCCCCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTCCACAACCTGTCATCAGGATCCTggcggg < 1:652183/239‑1 (MQ=255) ttcccg‑ccgGGCTGGCACGGAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGTTTTTATTGCTGTTAACGGTGGGGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGGGGGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTCCACAACCTGTCATCAGGATCCTggcgggc < 1:544154/236‑1 (MQ=255) ttcccg‑ccgGACTGGCCCGTAATCCCCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCGGGCGGGCCTGGTAGGGATGGCTGCGGGGGTGTTAAGGGGGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGaccac < 1:49518/154‑1 (MQ=255) ttACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGGGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGGTGACCACCTCGCCAA‑TGGGGATTCTGCTGGGCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTCCACAACCTGTCATCAGGATCCTggcgggc > 1:752727/1‑239 (MQ=255) tACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGAAAGTTGCGCGGGGGGTAATGGGGACAGCGGCG‑CAGGGCGGCGACCGGGGTTGTCCCGGGTTGGTGGCCACCTCCCCCA‑TGGGGCGTCTGCGGGGCAAGGTCCCGGC‑GATAGGAACCGCA‑CTTCCACAACCCGTTCTCATGATccctgccggc > 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cACGTAATCCCCGGTTGTTTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTACCGGTGGGCCGGGCGGGCCTGGTACGGTTGGCGGCGGGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTCCACAACCTGTCATCAGGATCCTGGCGGGCGCTTCCACTATAGt < 1:358376/238‑1 (MQ=255) cACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGGTGGCTGCGCGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGGGGTCTCGGCTGGGTGACCACCCCGCCAA‑TGGGGATTCTGCTGGGCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTTCACAACCTGTCATCAGGATCCTGGCGGGCGCTTCCCCcatatt > 2:582966/1‑236 (MQ=255) gattactcccgtgctgTTTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAGCGCTGGTGCGGGCGGGCCTGGTACGGATGGCAGCGCGGGTTTTAATGGCGAACCCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTCCACAACCTGTCATCAGGATCCTGGCGGGCGCTTCCACTATAGTc < 2:469680/227‑1 (MQ=255) tAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGGACGGATGGCTGCGCGGGGGGTAATGGGGAAACCGCCG‑CCGGCCGGTAACCGGGGGGATCTCGGCCTGTTGTCCCCCTCCCCAACGGGGGGTTCT‑CCGGCGATGCTGCCGGC‑GGTGGGTA‑CGCCGATTTCACAACCCGtcct > 2:452050/1‑202 (MQ=255) tgATTATCGTCTTGCTTTTTTTGTGTTTACCGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTCCACAACCTGTCATCAGGATCCTGGCGGGCGCTTCCACTATAGTCCTCTCAGGGACGCa < 1:697910/238‑1 (MQ=255) cGTCCTGCTGTTATTGCTTTTACCGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTCCACAACCTGTCATCAGGATCCTGGCGGGCGCTTCCACTATAGTCCTCTCAGGGACGCACGATctgc < 1:393566/239‑1 (MQ=255) 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tgTTTTGGCTGTTACCGCGGGTGCTGGGGGGCCTGGTAGGGATGGCTGCGCGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTCCACAACCTGTCATCAGGATCCTGGCGGGCGCTTCCACTATAGTCCTCTCAGGGACGCACGATCTGCCTGcaca < 1:784181/238‑1 (MQ=255) ttATTGCTTTGAGCGCGGGTGCTGGCGGGCGTGGAAGGGAAGCAGGGGCGGGTTTGAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCat < 2:70521/159‑1 (MQ=255) acggagcggggTGCTGGCGGGCCTGGTACGGTGGGCTGGGGGGGTGTTAATGGCGAACCCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTCCACAACCTGTCATCAGGATCCTGGCGGGCGCTTCCACTATAGTCCTCTCAGGGACGCACGATCTGCCTGCACAACGTAGCAcc < 1:620380/229‑1 (MQ=255) tAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGGGTTAATGGCGAAACCGCCC‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCCGGTTGACCACCCCGCCAA‑TGGTGATTCCTCTGGTCCTGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTCCACAAc > 1:70521/1‑159 (MQ=255) 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(MQ=255) tGCGCGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGGGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTCCACAACCTGTCATCAGGATCCTGGCGGGCGCTTCCACTATAGTGCTCTCAGGGACGCACGATCTGCCTGCACAACGTAGCACCTGGCATGATTTTTTGCCTTCAGGAACCGCa > 1:894419/1‑232 (MQ=255) cgcgGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTCCACAACCTGTCATCAGGATCCTGGCGGGCGCTTCCACTATAGCCCTCTCAGGGACGCACGATCTGCCTGCACAACGTAGCACCTGGCATGATTTTTTGCCTTCAGGCACCGCATCTGCTTCg > 1:527762/1‑239 (MQ=255) | GCACGCGCGATCTCAACGTCGTCTGTGGGATGCTCAAAATCATGCCATTTACCGCC‑GTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCGCCCTTCAACATTTTTCTTAGCGAATTTATGACCATTACCG‑CCGGACTGGCACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGCTGTTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGATGGCTGCGCGGGTGTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGGCCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAA‑TGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGC‑GATGGGAA‑CGCATATTCCACAACCTGTCATCAGGATCCTGGCGGGCGCTTCCACTATAGTCCTCTCAGGGACGCACGATCTGCCTGCACAACGTAGCACCTGGCATGATTTTTTGCCTTCAGGCACCGCATCTGTTTCG > NC_000913/2608013‑2608476 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |