| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 618054 = | 192 (0.970) | 33 (0.190) | 20/170 | 15.4 | 16.3% | intergenic (+16/‑200) | entF/fepE | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent/regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains |
| ? | NC_000913 | 618087 = | 173 (1.000) | intergenic (+49/‑167) | entF/fepE | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent/regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTAAATTCCTTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/618164‑618054‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taattatgggtttTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGATAAT > NC_000913/618087‑618184 GTAAATTCCTTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGT > 1:531461/1‑99 TAAATTCCTTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAGATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTA > 1:122045/1‑99 TAAATTCCTTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTA > 2:3376340/1‑99 AAATTCCTTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAA < 1:2771730/99‑1 TCCTTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTAT < 1:1309139/99‑1 TCCTTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTAT < 2:257966/99‑1 aTTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAAAAAAATATTCATCAAATCTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGG < 2:900400/98‑1 CTTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGG < 2:3886289/99‑1 ttaCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGG < 2:1886989/96‑1 TTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGG > 1:3217520/1‑99 TTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGG > 2:1426993/1‑99 TTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGG > 1:4999671/1‑99 TTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGG > 1:2838008/1‑99 TTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATAATGGG > 1:2053589/1‑99 TTCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCATTATTTATTTTCTTTAATTATGGG > 2:2333815/1‑99 TCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGT > 2:670683/1‑99 TCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGT > 1:5163268/1‑99 TCCACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGT > 1:5165101/1‑99 CACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTT > 2:916568/1‑99 CACTGAATGCAACATTCACTCTATTTAAGAGAAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTACTGTAATTATGGGTTT > 1:4264961/1‑99 AAATATTCATCAAACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAAT > 2:3143389/1‑99 AACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAA > 1:2707672/1‑99 AACCTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAA > 1:2705535/1‑99 CTATAAATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAG > 2:2668856/1‑99 AATCAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGA > 2:920427/1‑99 CAAACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATG > 1:2744727/1‑99 AACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTT < 2:2661780/99‑1 AACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTT < 2:2659664/99‑1 ACAAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTG > 1:157739/1‑99 AAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCA > 2:4933610/1‑99 AAATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCA > 1:2414691/1‑99 AATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCAT > 1:1563170/1‑99 AATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCAT > 1:1539643/1‑99 ATAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATT > 1:308574/1‑99 TAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTC > 1:4816636/1‑99 TAAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTC > 1:4205166/1‑99 AAAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTAGCATTCA > 1:3105331/1‑99 AAAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATATGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATGTTTCTCTTAAATCGAGTGTTTGTTGCATTCAG > 2:4398671/1‑99 AAAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGTATTCAGT > 2:1111563/1‑99 AAACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTG > 1:984071/1‑99 ACCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATGTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGA > 1:1732896/1‑99 CCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTTTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTTTATGTTGCATTCAGTGGAA > 2:301788/1‑99 CCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGTAA > 2:82406/1‑99 CCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAA > 2:995373/1‑99 CCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAA > 1:2222662/1‑99 CCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAA > 1:1845021/1‑99 CCCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAA > 1:672746/1‑99 CCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAG > 2:4109036/1‑99 CCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAG > 2:2884606/1‑99 CCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAG > 1:2087799/1‑99 CCATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAG > 1:2351617/1‑99 CATAATTATTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGG > 2:4817823/1‑99 TTTTCTGTAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGCATTTACA > 2:2841758/1‑99 TAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCA < 1:4382035/99‑1 TAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCA < 1:7845/99‑1 TAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCA < 2:3730986/99‑1 TAATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCA < 1:2571777/99‑1 AATTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAG < 2:3513950/99‑1 TTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCT < 2:3888897/99‑1 TTATGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCT > 1:2365652/1‑99 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TGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCG > 2:4775284/1‑99 TGGGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCG < 1:4418199/99‑1 GGTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGA > 2:2957391/1‑99 GTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGAT > 1:3783419/1‑99 GTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGAT > 1:2676291/1‑99 GTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGAT > 1:2768509/1‑99 GTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGAT > 1:863406/1‑99 GTTTTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATAGTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGAT < 1:4887842/99‑1 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NC_000913/618164‑618054‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taattatgggtttTTTATTTGTTTGATTTATAGGTTTGATGAATATTTCTCTTAAATAGAGTGAATGTTGCATTCAGTGGAAGGAATTTACAAACTTCAGCTTCGGATAAT > NC_000913/618087‑618184 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |