| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,757,668 | 0 | C | T | 27.6% | 115.3 / 14.4 | 59 | A54T (GCA→ACA) | yiaY | L‑threonine dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/4); new base T (0/16); total (39/20) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.06e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTGCGGTTTTGCAGAGCGGTCAACGCCTTCGTAATCGCGAATATCGCCGCCATTGGCTGCCACCAGCGCAATACCTTTTGCGCAGTCGTGTGGAGAACCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGAT > NC_000913/3757438‑3757893 | cTGCGGTTTTGCAGAGCGGTCAACGCCTTCGTAATCGCGAATATCGCCGCCATTGGCTGCCACCAGCGCAATACCTTTTGCGCAGTCGTGTGGAGAACCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGc > 1:599059/1‑238 (MQ=255) gggccAACGCCTTCGCAATCGCGAATATCGCCGCAATTGGCTGCCACCAGAGCAATACCCTTTGCGCAGGCGTGGGGGGAACCTCCTCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTTTTCTATTTAAGTAATTTCACA‑CCTGCGGCGCCGTTTTCCATGGTGGGGTTAGGTTGGGGGCCATCATAGATACCGCTAAAAATC‑ATGCGTTGTTCCAGGGGTTGTGGCACAT‑CGTCCGCGATAca > 2:199778/5‑238 (MQ=255) gTCAACGCCTTCGTAATCGCGAATATCGCCGCCATTGGCTGCCACCAGCGCAATACCTTTTGCGCAGTCGTGTGGAGAACCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGACCAT‑CGCCCGCCATACCTa > 2:814632/1‑239 (MQ=255) cTTCGTAATCGCGAATATCGCCGCCATTGGCTGCCACCAGCGCAATACCTTTTGCGCAGTCGTGTGGAGAACCACCGCC‑TAAGGGGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGAACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGtt > 1:800445/1‑239 (MQ=255) cGTAATCGCGAATATCGCCGCCATTGGCTGCCACCAGCGCAATACCTTTTGCGCAGTCGTGTGGAGAACCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAAc > 1:1087878/1‑239 (MQ=255) gccgccATTGGCTGCCACCAGCGCAATACCTTTTGCGCAGTCGTGTGGAGAACCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACaa > 1:1233047/1‑239 (MQ=255) ccgccATTGGCTGCCACCAGCGCAATACCTTTTGCGCAGTCGTGTGGAGAACCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGAAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGAGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTTTTCCAGTGCTTTTTGCCCAT‑CCCCCGCCAAACCTAATTTCGTTAACATATTTTCAGTGACAAt > 1:1171432/1‑239 (MQ=255) acacccaGCGTAATACATTTGTCGTGGTGTTGTGGAAACCCACCGCG‑TAAGGAGAACCAGCTTTCGAAATTATTCTCTTTAAGTATTTACAAC‑CCTGCGGCGACTTTTTCCGTGGTGGTGTTAGTTTGGGTCCCACAAAAAATAACGCTAAAAATT‑TTGCGTTCTTCCAGTTTTTTTTCCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGt < 2:1171432/235‑1 (MQ=255) tACCTTTTGCGCAGTCGTGTGGAGAACCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATaa > 1:361346/1‑236 (MQ=255) cTTTTGCGCAGTCGTGTGGAGAACCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGcc > 1:268198/1‑239 (MQ=255) cAGTCGTGTGGAGAACCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCatat > 1:378075/1‑238 (MQ=255) aGTCGTGTGGAGAACCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCatat > 1:209789/1‑237 (MQ=255) ggcgacagcaaCCACCGCCGTAAGGGCCGCACACTATCACAATTTTTCTCTTTAAGTAATTTCAGA‑CCTTGGGCGAGTTTTACTGGGGGGGGGTTAGGGGGGTTGCAATAAAAAATACCCCAAAAAATA‑TTCGTTTCTCCCGTTTTTTTTTGCCCTT‑CTCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCa < 2:29221/229‑1 (MQ=255) aaCCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGca > 2:1296987/1‑144 (MQ=255) aaCCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGca < 1:1296987/144‑1 (MQ=255) aaCCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAAtt > 1:1380528/1‑165 (MQ=255) aaCCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTc > 1:1352017/1‑239 (MQ=255) aaCCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTc > 1:1323028/1‑239 (MQ=255) aaCCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTc > 1:1410501/1‑239 (MQ=255) tcc‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTAAAGTATTTTCAAC‑CCTGCGGCGTCGTTTCCCTGGGTGGGTTTGGGTTGGGTCCCATCAAAAATAACCCAAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGTTTTTTCCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATa < 2:793674/203‑1 (MQ=255) gaTCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATTAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGa > 1:856927/1‑239 (MQ=255) aTCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCcatc > 1:793674/1‑204 (MQ=255) cGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATAc > 1:946672/1‑132 (MQ=255) attttttattttAAAGAATTTTAAAGCCGGCGGCGACGTTTTCGGTGGGGGGTTTAGGTGGGGTGCCATCA‑AAAAAACCCAAAAAAAATTTGCGTTCTCCCATTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGa < 2:599059/229‑1 (MQ=255) tctTTAAGTTATTTCAAA‑CCGGGGGCGACTTTTCCCGTGGTGGGGTTGTGTTGTGTGCCATCAAAAATAACTCTAAAAATA‑TTGCTTTCTTCCAGTGTTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGAAGGAATaaa < 2:1323028/239‑1 (MQ=255) tggGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAAt > 1:1135448/1‑135 (MQ=255) ggTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACCCAAAAAATT‑TTGCGTTCTTCCATTGTTTTTTCCACTT‑CCCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAAt < 1:232901/109‑1 (MQ=255) ggttggttCCCATCATAAATACCGCTAAAAATT‑TTGCTTTCTCCCATTTTTTTTTCCACAC‑CCCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACata < 2:255738/90‑1 (MQ=255) ggTTGGGCGCCATAATAAACAACGAAAAAAATG‑TTGTTTTGCTCCAGTTTTTTTGACACGC‑TGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACAGATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAgggc < 2:1304695/238‑1 (MQ=255) gtGGGTACTATCAAAAATAACGAAAAAAAGT‑TGGCGTTCTCCGTGTTTTTTTGACAATG‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAgggcgg < 2:268198/237‑1 (MQ=255) ggTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACgg > 2:232901/1‑109 (MQ=255) ggTGCCATCAAAAATAACCCTAAAATTA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTCCACAC‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTg < 2:1098701/125‑1 (MQ=255) tcccATTAAAAATAACGCTAAAAATA‑TTGTGTTCTTCCAGTTTTTTTTGCACCT‑CCCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGa < 2:564491/173‑1 (MQ=255) catcatAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGa > 1:255738/1‑90 (MQ=255) tcaaAAATAACGATAAAAATA‑TTGCTTTCTCCCAGTGTTTTTGGCACAC‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAg < 2:949558/169‑1 (MQ=255) tcaaAAATAACAATAAAAATT‑TTGCTTTCTTCAGTTTTTTTTTCCCCAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGAGGACATTCACAGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAacac < 2:1215068/202‑1 (MQ=255) ccaaaaatacCGCAAAAAATA‑TTGCGTCCTACCAGTGTTTTTGGCAAAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATc < 2:944916/112‑1 (MQ=255) taaataaCGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATAtt > 1:1098701/1‑125 (MQ=255) aataaCGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGAAGGAATAAAg > 1:564491/1‑175 (MQ=255) aaaCGCAAAAAAGT‑TTGTGTTTTTCCGGTCTTTTTTGCACAT‑CCCCCGCCATACCTAATTTCGtt < 1:262566/64‑1 (MQ=255) cGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATAtt > 1:1327023/1‑70 (MQ=255) cGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGt > 1:1135809/1‑72 (MQ=255) cGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGt > 1:957277/1‑72 (MQ=255) cGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCata > 1:944916/1‑116 (MQ=255) cGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGAAGGAATaaa > 1:949558/1‑169 (MQ=255) cGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGaaa > 1:1215068/1‑202 (MQ=255) cGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGaa > 1:752452/1‑201 (MQ=255) cGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTaaaa > 1:860198/1‑210 (MQ=255) 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ta‑tTGCGTTCTCCAGGTGTTTTTGACACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAat < 2:361346/239‑1 (MQ=255) ttGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATc > 1:696156/1‑88 (MQ=255) ttGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGAAGGAATaaa > 1:765247/1‑158 (MQ=255) tttcttcCCGTGTTTTTTAC‑CATCCGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCATTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGAt < 1:814632/237‑1 (MQ=255) ttcCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAAtt > 2:1172805/1‑38 (MQ=255) | CTGCGGTTTTGCAGAGCGGTCAACGCCTTCGTAATCGCGAATATCGCCGCCATTGGCTGCCACCAGCGCAATACCTTTTGCGCAGTCGTGTGGAGAACCACCGCC‑TAAGGAGATCACGCTATCGCAATTATTCTCTTTAAGTAATTTCAAA‑CCTGCGGCGACGTTTTCCGTGGTGGGGTTAGGTTGGGTGCCATCATAAATAACGCTAAAAATA‑TTGCGTTCTTCCAGTGCTTTTTGCACAT‑CGCCCGCCATACCTAATTTCGTTAACATATTGTCAGTGACAATTAAGGTACGGGTAAATCCATAATCTGCCATCATATTCATTGCATCAGTCAATGAATCAGCGCCGATGACATTCACAGAAGGAATAAAGAACGTTGAAGCTGCCATAACACACTCCTGAAAGTGTAAAAAAGGGCGGGCAGCTTACTGAGGATTTTCATTCGAAAATATGAT > NC_000913/3757438‑3757893 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |