| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4108906 | 160 (1.070) | 4 (0.030) | 4/286 | 12.5 | 2.6% | coding (73/990 nt) | sbp | sulfate transporter subunit |
| ? | NC_000913 | = 4109058 | 154 (1.090) | coding (225/990 nt) | sbp | sulfate transporter subunit | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
TGGACAAAGCGCACTTTGTCAGCAATATGAGGCGGATTTCTTCCGCCTTTTTAATCCCTCAACATATACCCGCAAGTTATAGCCAATCTTTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACGAACAGTACAACAAGGCATTCAGCGCCCACTGGAAACAGCAAACTGGTGATAACGTGGTGATTCGTCAGTCACACGGTGGCTCAGGTAAACAAGCGACGTCGGTAATCAACGGTATTGAAGCTGATGTTGTCACGCTGGCTCTGGCCTATGACGTGGACGCAATTGCGGAACGCGGGCGGATTGATAAAGAGTGGATCAA > NC_000913/4108670‑4109141 | aGCGCACTTTGTCAGCAATATGAGTCGGATTTCTTCCGCCTTTTTAATCCCTCAACATATACCCGCAAGTTATAGCCAATCTTTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGtt > 2:963952/1‑238 (MQ=255) aGCGCACTTTGTCAGCAATATGAGGCGGATTTCTTCCGCCTTTTTAATCCCTCAACATATACCCGCAAGTTATAGCCAATCTTTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGtt > 2:1656568/1‑238 (MQ=255) cAGCAATATGAGGCGGATTTCTTCCGCCTTTTTAATCCCTCAACATATACCCGCAAGTTATAGCCAATCTTTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCa > 1:959271/1‑238 (MQ=255) aaTATGAGGCGGATTTCTTCCGCCTTTTTAATCCCTCAACATATACCCGCAAGTTATAGCCAATCTTTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAAcgc < 1:1656568/238‑1 (MQ=255) ggCGGATTTCTTCCGCCTTTTTAATCCCTCAACATATACCCGCAAGTTATAGCCAATCTTTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGa > 1:1742583/1‑235 (MQ=255) cGGATTTCTTCCGCCTTTTTAATCCCTCAACATATACCCGCAAGTTATAGCCAATCTTTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTGTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTGCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGt < 2:1757429/238‑1 (MQ=255) aTTTCTTCCGCCTTTTTAATCCCTCAACATATACCCGCAAGTTATAGCCAATCTTTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACg < 2:42327/238‑1 (MQ=255) aTTTCTTCCGCCTTTTTAATCCCTCAACATATACCCGCAAGTTATAGCCAATCTTTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACg < 2:1566741/238‑1 (MQ=255) tttCTTCCGCCTTTTTAATCCCTCAACATATACCCGCAAGTTATAGCCAATCTTTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGa < 2:1200440/229‑1 (MQ=255) ttttAATCCCTCAACATATACCCGCAAGTTATAGCCAATCTTTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACGAACAGTACAACAAg < 1:2148586/239‑1 (MQ=255) aCCCGCAAGTTATAGCCAATCTTTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGa < 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tCTTTTTTTATTCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACGAACAGTACAACAAGGCATTCAGCGCCCACTGGAAACAGc < 1:999590/226‑1 (MQ=255) ttCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACGaa < 1:2224784/179‑1 (MQ=255) ttCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACGAACAGTACAACAAGGCATTCAGCGCCCACTGGAAACAGCaaa > 1:1702264/1‑219 (MQ=255) ttCTTTAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACGAACAGTACAACAAGGCATTCAGCGCCCACTGGAAACAGCaaa < 2:1702264/219‑1 (MQ=255) tttAATGTTTGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACGAACAGTACAACAAGGCATTCAGCGCCCACTGGAAACAGCAAACTGGTGATAACGTGGTGATTCgt < 1:1975102/239‑1 (MQ=255) tGGTTAACCTTCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACGAACAGTACAACAAGGCATTCAGCGCCCa > 1:1039204/1‑193 (MQ=255) tCTGGCACGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACGAACAg < 1:436957/160‑1 (MQ=255) cGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAAc < 2:324820/117‑1 (MQ=255) cGCTTTGCTCATCACAACACAACATAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAAc > 1:324820/1‑117 (MQ=255) 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cacaacaTAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACGAACAGTACAACAAGGCATTCAGCGCCCACTGGAAACAGCAAACTGGTGATAACGTGGTGATTCGTCAGTCACACGGTGGCTCAGGTAAACAAGCGACGTCGGTAATCa > 2:2134833/1‑239 (MQ=255) aacaTAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACg < 2:1795159/128‑1 (MQ=255) caTAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACGTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACGAACAGTACAACAAGGCATTCAGCGCCCACTGGAAACAGCAAACTGGTGATAACGTGGTGATTCGTCAGTCACACGGTGGCCCAGGTAAACAAGCGACGTCGGTAATCAACGGt > 2:690978/1‑239 (MQ=255) aTAAGAGAGTCGGGCGATGAACAAGTGGGGCGTAGGGTTAACATTTTTGCTGGCGGCAACCAGCGTTATGGCAAAGGATATTCAGCTTCTTAACTTTTCATATGATCCAACGCGCGAATTGTACGAACAGTACAACAAGGCATTCAGCGCCCACTGGAAACAGCAAACTGGTGATACCGTGGTGATTCGTCAGTCACACGGTGGCTCAGGTAAACAAGCGACGTCGGTAATCAACGGTa < 1:1253552/239‑1 (MQ=255) 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NC_000913/4108670‑4109141 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |