| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3584192 | NA (NA) | 336 (1.890) | 164/288 | 0.0 | 67.8% | intergenic (+13/‑3) | insB1/yrhA | IS1 transposase B/pseudogene, interrupted by IS1E |
| ? | NC_000913 | = 3836822 | 162 (0.900) | intergenic (+267/‑130) | yicT/setC | pseudogene/putative arabinose efflux transporter | |||||
Only 100 of 508 total aligned reads displayed.
CTGCCATCAAGATTAATTTGTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCA > NC_000913/3836674‑3836970 | cTGCCAGCAAGATTAATTTTGTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGG > 1:2099544‑M2/1‑149 (MQ=255) tGCCATCAAGATTAATTTGTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTCTTTTTACTATCACAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTCTACTAATAATCTCAATTGCTGGt > 2:2077566‑M2/1‑148 (MQ=255) tGCCATCAAGATTAATTTGTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGc < 2:1696220/149‑1 (MQ=255) ccATCAAGATTAATTTGTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGccc > 1:141072/1‑149 (MQ=255) cATCAAGATTAATTTGTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaat > 1:1615622‑M2/1‑145 (MQ=255) cAAGATTAATTTGTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgac > 2:525030‑M2/1‑142 (MQ=255) ttAATTTGTTCATTTAACATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATACATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTAGtaatgattccaa > 2:1856890‑M2/1‑137 (MQ=255) ttGTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgaatccaacttat < 2:1898717‑M2/149‑18 (MQ=255) ttGTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaaggactccaacttat > 1:2075383‑M2/1‑132 (MQ=255) tGTTCATTTAATATGTCAAATCAACGTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAATTTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttatt > 1:1844918‑M2/1‑131 (MQ=255) gTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattg > 2:1960971‑M2/1‑130 (MQ=255) gTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattg > 2:894191‑M2/1‑130 (MQ=255) gTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattg < 2:2161388‑M2/149‑20 (MQ=255) gTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAg > 2:1667323/1‑149 (MQ=255) ttCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattga > 1:17277‑M2/1‑129 (MQ=255) cATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgata < 1:1870520‑M2/149‑23 (MQ=255) agttaaTATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAATAAGATTTAAAAAATATTCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgataa < 2:2888569‑M2/147‑24 (MQ=255) tttAATATATCAACTCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCGTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAAGCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagt < 1:2141054‑M2/149‑25 (MQ=255) tttAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTAACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAAGTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtactgactctaacttattgatagt < 2:2211650‑M2/149‑25 (MQ=255) tttAATAAAAAAAATAAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAAATAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAGTCACAATTCCTGGCCCTATAAGATTCCGCAAGCATTg > 2:365196/1‑149 (MQ=255) ttAATATAACAAATCAACTGGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCAGTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtg > 1:251651‑M2/1‑124 (MQ=255) tAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCt < 2:1272339/149‑1 (MQ=255) aaTATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCtt > 2:2642515/1‑149 (MQ=255) atcaaatcaaCTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatg < 1:382097‑M2/149‑33 (MQ=255) atcaaatcaaCTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGATGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTgg > 1:2036451/1‑149 (MQ=255) tcaaatcaaCTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGt > 1:1214999/1‑149 (MQ=255) caaatcaaCTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt < 1:529051‑M2/149‑35 (MQ=255) aatcaaCTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCCTTTACTAATAATCTCAATTTCTGGtaatgactccaacttattaatactgttttataatca < 2:1078703‑M2/149‑37 (MQ=255) atcaaCTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGATCATTGACTTACGATAATTAATATATAAATTCGGAAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGCtaatgactccaacttattgattgtgttttatgttcag < 2:1325713‑M2/149‑38 (MQ=255) aaCTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagata > 1:988840‑M2/1‑109 (MQ=255) atttgtTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATACAATCGGTCATTAATTCTTAACCTTCTTTTACTACTAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttactgatagtgttttatgttcagataa > 1:718554‑M2/3‑108 (MQ=255) aCTTGTATTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactcaaacttattgatagtgttttatgttcagataa < 2:1040723‑M2/149‑42 (MQ=255) cTTGTTTTACTCTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGc < 1:828918/149‑1 (MQ=255) ttGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatg > 2:2589519‑M2/1‑106 (MQ=255) gTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGAt > 1:1056930/1‑149 (MQ=255) ttATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga > 2:2751032‑M2/1‑101 (MQ=255) ttttACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgac < 2:438175‑M2/149‑53 (MQ=255) ttttACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgac > 2:296845‑M2/1‑97 (MQ=255) ttACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactt < 1:1359037‑M2/149‑55 (MQ=255) tACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgacttt > 1:3001952‑M2/1‑94 (MQ=255) cTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTGATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgatttatgttcagataatccccgatcacttggt < 2:2827587‑M2/149‑58 (MQ=255) tATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc > 2:37748‑M2/1‑91 (MQ=255) tATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATACGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagggttttatgttcagataatgcccgatgactttgta < 1:351931‑M2/149‑59 (MQ=255) aTCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca > 2:1377960‑M2/1‑90 (MQ=255) tCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattggtagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcat < 1:238732‑M2/149‑61 (MQ=255) gagaaatagCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatg > 2:2507354‑M2/4‑88 (MQ=255) aaaaTAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTaata > 1:2306008/1‑149 (MQ=255) aaaaTAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATCCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgca > 1:895663‑M2/1‑86 (MQ=255) cTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatattgttttatgttcagataacgcccgatgactttgtcatgcagctccac > 1:1701400‑M2/1‑79 (MQ=255) tCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgtccgttgactatgtcatggagctccacc > 2:815542‑M2/1‑78 (MQ=255) tCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTc > 1:951780/1‑149 (MQ=255) ttccttACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatt > 1:1675473‑M2/3‑74 (MQ=255) ccTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgata > 2:626594‑M2/1‑72 (MQ=255) cTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttg > 1:778399‑M2/1‑71 (MQ=255) cTATTATTAATAAATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTCTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgccccatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa > 1:419222‑M2/1‑67 (MQ=255) attaatATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgaca > 2:2715232‑M2/1‑62 (MQ=255) taatATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc > 1:842143‑M2/1‑60 (MQ=255) aatATATAAATTCGATAATTAATTCTTAACAGGCTTTTACTAATAATCTCCATTGCGCGCCCTATGATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTAttt < 2:1833138/149‑1 (MQ=255) atataAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgact > 1:2848401‑M2/1‑56 (MQ=255) tataAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTaa < 2:743031/149‑1 (MQ=255) ataAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattaatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgccttc < 1:1826332‑M2/149‑96 (MQ=255) aaaTTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACAAATAATCTCAATTGCTGGtaatgacccaaactgagtgatagtgaattatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccg < 1:2217891‑M2/149‑98 (MQ=255) aaTTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCa < 2:232132/149‑1 (MQ=255) aaTTCGGCAATTCATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttgttgatagtgttttatgttcagagaatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgt > 2:1770143‑M2/1‑51 (MQ=255) ggTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttggggacgacagcgacttccgtcccag < 1:2889284‑M2/149‑104 (MQ=255) gTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagc > 2:791988‑M2/1‑45 (MQ=255) aattaattCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATAtt > 1:1512548/1‑149 (MQ=255) aattCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccgacgtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcc < 2:1532324‑M2/149‑111 (MQ=255) aattCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcc > 1:1105244‑M2/1‑39 (MQ=255) attCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCATAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTc < 2:1632895/149‑1 (MQ=255) tCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAGTACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGc < 1:597295/149‑1 (MQ=255) tCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGCCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGc < 1:1298562/149‑1 (MQ=255) tCTTAACATGCTTTTACTAATAATCGCAATGGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccagg < 1:1569823‑M2/149‑114 (MQ=255) tAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCg < 1:1020042/149‑1 (MQ=255) tAACATGCTTTTACTAATAATCCTCATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCg < 1:55729/149‑1 (MQ=255) aCATGCTTTTACAAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctg < 1:1941339‑M2/149‑119 (MQ=255) cATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgc > 2:2127178‑M2/1‑30 (MQ=255) tGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatt > 2:2463111‑M2/1‑28 (MQ=255) tcgttgaCTAATAATCTTAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGAtt < 2:2256635/143‑1 (MQ=255) ttttACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCa < 1:458920/149‑1 (MQ=255) ttACTAATAATCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagat < 2:1200760‑M2/149‑127 (MQ=255) tACTAATAATCTCATTTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCagaa < 2:141072/149‑1 (MQ=255) cTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCagaaga > 1:25549/1‑149 (MQ=255) taatacTCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcag > 1:2928225‑M2/1‑19 (MQ=255) taataaTCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttctgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcag > 1:1161727‑M2/1‑19 (MQ=255) taataaTCTCAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagctaatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcag > 2:147370‑M2/1‑19 (MQ=255) taataaTCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCACAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTGGCCCGGTACTTCagaagac > 2:1185377/1‑148 (MQ=255) tctcAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttattttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatg > 1:146649‑M2/1‑13 (MQ=255) tctcAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatg > 2:2409133‑M2/1‑13 (MQ=255) tctcAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgaatttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatg < 1:2049260‑M2/149‑137 (MQ=255) tctcAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATGCTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCCGCAGAATGCaaa > 2:681709/1‑149 (MQ=255) ctcAATTGCTGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgc > 2:580506‑M2/1‑12 (MQ=255) cacgtgctgGtaatgaatccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccactgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccg > 2:2037707‑M2/5‑10 (MQ=255) aaTTGCTGGtaatggctccaacttatggatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgc < 2:953536‑M2/149‑141 (MQ=255) ttgGtaatgactccatcttattgacagcgttttatgttcagagtatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgtttttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaat > 2:1599120‑M2/2‑4 (MQ=255) cTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTa > 1:1914810/1‑149 (MQ=255) tGGtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgag > 1:247230‑M2/1‑3 (MQ=255) gtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcg < 1:2698462‑M2/149‑149 (MQ=255) gCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCa > 1:2746569/1‑149 (MQ=255) gCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCa < 1:2642515/149‑1 (MQ=255) | CTGCCATCAAGATTAATTTGTTCATTTAATATATCAAATCAACTTGTTTTATTTTTACTATCAAAAATAGCTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCA > NC_000913/3836674‑3836970 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |