New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3884920 | 44 (0.980) | 5 (0.120) | 4/258 | NT | 9.6% | coding (106/258 nt) | yidD | membrane protein insertion efficiency factor, UPF0161 family inner membrane protein |
? | NC_000913 | = 3884956 | 53 (1.260) | coding (142/258 nt) | yidD | membrane protein insertion efficiency factor, UPF0161 family inner membrane protein |
AAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTAGTCATC > NC_000913/3884808‑3885104 | aaaaaTTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGAACGCGCAACGGAATTGAGGCAATGCCCAGGt > 1:578340/1‑149 (MQ=255) aaaTTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTtt < 1:235702‑M2/149‑3 (MQ=255) ttATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCCTTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttgga > 1:71286‑M2/1‑144 (MQ=255) ttATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttgga > 1:27553‑M2/1‑144 (MQ=255) ttATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCAATGTCGTTGCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttgga > 1:27344‑M2/1‑144 (MQ=255) tGGCGCCGCCACGGCCGCCTGGTCCGCGGGTCCTGATAGCCCTCCTTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTCCTCGGGCCGCATTGTCGCTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggagtg > 1:26872‑M2/1‑141 (MQ=255) gccCCTGTCGGCTGGCTTGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAg < 1:697843/149‑1 (MQ=255) ccccTGTCGTCTGCCTCGCGGGTCTTGATAGCCCTCATTCGGGTATATCCCTGCCTGATTAGGCCGCTACTCGGGCCGCCTTGTCGGTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAgg < 2:245204/146‑1 (MQ=255) tGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTAGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGa < 1:594004/149‑1 (MQ=255) gcgGGTCCTGATAGCCCTCATTCAGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCACGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGGTAAAGGACAGTTGGTTGACGGTGa > 2:51815/1‑149 (MQ=255) gcgGGTCCTGATAGACCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAAACTGTTCAAGCTCGGGAATTGAGGCATGACGCAGGATTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGAGGGtca > 2:476371/1‑147 (MQ=255) cgGGTCCTGATCGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGaa < 1:5712/149‑1 (MQ=255) gggTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGaaa > 1:451765/1‑149 (MQ=255) cTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCACGATTAGTCCCCTACTCGGGCCGCATCGTCGATTCACTCCAACCAGAACAAGCAACGGAATTGAGGCATTACGCACGTGATGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGt > 1:417963/1‑149 (MQ=255) tGATAGCCATCATTCGGGTCCATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTa < 1:339440/149‑1 (MQ=255) gATAGTCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTAt < 1:469210/149‑1 (MQ=255) tAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTa < 1:744364/149‑1 (MQ=255) cTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATg < 1:291697/149‑1 (MQ=255) cTCATTCGGGTCTACCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATg < 1:243881/149‑1 (MQ=255) aTTCGGGTCGATCAACGCCGGATTAGTCCGCTGGTCGGGCCGCATTGGCGGGTCACCCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATCGCGCAGGTTTGGAGTGCTAAAAGGCAGTTGGTTGACCGTGAAACGCGTATTAAAATGCCa < 2:310026/149‑1 (MQ=255) tATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTGTTAAAATGCCCCCCTTTaca > 2:263818/1‑149 (MQ=255) aTCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTacac > 1:355586/1‑149 (MQ=255) tCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACAcc > 1:145749/1‑149 (MQ=255) cTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCtggtgg < 1:519987/149‑1 (MQ=255) aTTAGTCCGCTCCTCGGGCCGCATTGTCGTTTCCCTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACGCTCTCGTGGTGa < 2:613877/149‑1 (MQ=255) aTTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATTCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGa < 1:595171/149‑1 (MQ=255) aTTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGa < 1:295813/149‑1 (MQ=255) tAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACg > 2:456845/1‑149 (MQ=255) aGTCCGCTACTCGGGCCGCATCGTCGATTCACTCCAACCCGTTCAAGATGCGGAATTGAGGTATTGCGTAGGTTTGCAGTGCTGACAGGCATTCGGTTGACGGTGAAATGCGTAGTAAAATGCCACCCGTTACACCCGGGTGGTGACGa > 2:667147/1‑149 (MQ=255) tCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCCCTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGAtc < 2:510690/149‑1 (MQ=255) tCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGACACCCTTTACACGCTGGTGGTGACGAtc > 1:738892/1‑149 (MQ=255) ccGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCTACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGCAGATATTTCATACGGGAAATTTTGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGAtcc < 1:190335/149‑1 (MQ=255) cGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGAtccc > 1:254030/1‑149 (MQ=255) tgctctGGCCGCTTTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTTCGGAATTGATGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGAtcccgtc < 2:387159/147‑1 (MQ=255) cTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGAtcccgtccc < 2:536496/149‑1 (MQ=255) gCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTcccgcccg < 1:733162/149‑1 (MQ=255) tgCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGa < 1:655800/148‑1 (MQ=255) cGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGa < 1:655688/149‑1 (MQ=255) cGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATGGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGa < 1:655914/149‑1 (MQ=255) gTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggagtgaaacgacaatgcggcccgagtagcggactaatcaggcgttgataaacccgaatgagggctatccggacccgcgagccaggcgacagtggc < 1:704184‑M2/149‑99 (MQ=255) gTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggagtgaaacgacaatgcggcccgagtagcggactaatcaggcgttgatagacccgaatgagggctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggc < 2:147694‑M2/149‑102 (MQ=255) cACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCa < 1:225401/149‑1 (MQ=255) aCTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggagtgaaacgacaatgcggcccgagtagcggactcatcaggcgttgatagacccgaatgagggctatcaggacccgcgggcccggcgacagtggcggcgaaac < 2:395192‑M2/149‑107 (MQ=255) aCTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggagtgaaacgacaatgcggcccgagtagcggactaatcaggcgttgatagacccgaatgagggctatcaggacccgcgcgccaggcgacagtggcggcgccag < 1:283351‑M2/149‑107 (MQ=255) cTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAGACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATCTGATACCaga > 2:146283/1‑149 (MQ=255) aaGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCATTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGAt > 2:597144/1‑149 (MQ=255) cTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATAACAGAGAACACTAACGATGGa > 2:474412/1‑149 (MQ=255) tACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTCGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATATCAGAGAACACTAACGATGGAt > 1:556309/1‑149 (MQ=255) cGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTttggagtgaaacgacaatgcggcccgagtagcggactaatcaggcgttgatagacccgaatgagggctatcaggacccgcgagccaggcgacagtggcggcgccataatttttccaacgcttccga > 1:147694‑M2/1‑23 (MQ=255) cGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGCATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTc < 1:542364/149‑1 (MQ=255) gAATTGAGGCGTTTCGCAGGTGTGGAGTGATAAAAGGCAGGGGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGCTACCAGAGAACACTAACGATGGATTcgc > 2:793541/1‑149 (MQ=255) gAATTGAGGCATTGCGTAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTcgc < 1:248932/149‑1 (MQ=255) gAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAACGGCAGTTGGTTGAAGGTGAAACGAGAATTAAAATGCAACCATTTACACCCTGGTGATGACGATCCCGTCCCGCCCGGCCCATTAGCTACCAGAGAGCAGTAAAAATGGATTggc > 2:224432/1‑149 (MQ=255) gAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTggc > 2:797242/1‑149 (MQ=255) gAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGAGAAAAGCGTACTAAAATGCAACCCTTTACACCCTGGTGGTGCCGATCCCGTCCCGCCAGGACCATTTGATACCCGAGCACGCTAACGATGGAGTcgc > 2:224378/1‑149 (MQ=255) aaTTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGGGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTcgca < 2:503224/149‑1 (MQ=255) ggggCATTGCGGGGGTTTGGAGGGATAAAATGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTCCCCCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTcgcaacgc < 1:94809/147‑1 (MQ=255) gAGGCATGGGGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCGGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTcgcaacgc < 1:94767/149‑1 (MQ=255) aTTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAGCGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACCCCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGCTCCCCGAGAACACTAACGATGGATTcgcaacgcaaccc > 1:727367/1‑146 (MQ=255) aTTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGGGAACACTAACGATGGGTTCGCAACGCAATCt > 1:375546/1‑149 (MQ=255) tGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATGAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCttt > 2:771185/1‑149 (MQ=255) cgcAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTa > 1:536504/1‑149 (MQ=255) gcAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTAg > 1:690629/1‑149 (MQ=255) gcAGGTTCGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGGCCCGCCCGGACCATTTGATGCCACAGCTTGCGATCGGTGGATTCGCAACGCAATCTTTTAg < 2:371305/149‑1 (MQ=255) cAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTAGt > 2:407472/1‑149 (MQ=255) cAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTAGt > 2:114368/1‑149 (MQ=255) aGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTAGTc > 2:124368/1‑149 (MQ=255) gTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTAGTCAt > 1:479205/1‑149 (MQ=255) tttGGAGTGATAAAAGGCAGTTCTGTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACTCCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTAGTCATc < 2:397499/149‑1 (MQ=255) | AAAAATTATGGCGCCGCCACTGTCGCCTGGCTCGCGGGTCCTGATAGCCCTCATTCGGGTCTATCAACGCCTGATTAGTCCGCTACTCGGGCCGCATTGTCGTTTCACTCCAACCTGTTCAAGCTACGGAATTGAGGCATTGCGCAGGTTTGGAGTGATAAAAGGCAGTTGGTTGACGGTGAAACGCGTATTAAAATGCCACCCTTTACACCCTGGTGGTGACGATCCCGTCCCGCCCGGACCATTTGATACCAGAGAACACTAACGATGGATTCGCAACGCAATCTTTTAGTCATC > NC_000913/3884808‑3885104 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |