| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,552,842:1 | +A | 6.2% | intergenic (+21/‑60) | uxuA → / → uxuB | mannonate hydrolase/D‑mannonate oxidoreductase, NAD‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,552,842 | 1 | . | A | 6.2% | 256.5 / 11.4 | 64 | intergenic (+21/‑60) | uxuA/uxuB | mannonate hydrolase/D‑mannonate oxidoreductase, NAD‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (32/28); new base A (2/2); total (34/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.77e-01 | |||||||||||
GATGCTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCA > NC_000913/4552701‑4552981 | gATGCTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGc > 2:613711/1‑149 (MQ=255)gATGCTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGc < 2:639765/149‑1 (MQ=255) gCTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGATGCGC‑GCCGTGCCgg > 2:638103/1‑149 (MQ=255) gggcgacCCGAAGAATAAAAGCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTc < 1:2495/146‑1 (MQ=255) ggACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCACGGC‑GCGCAGCCATGCCGGtgg < 1:452613/149‑3 (MQ=255) gaccgacCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGCCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTc < 2:517935/146‑1 (MQ=255) gacgacCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATGTCCACCGGCCTGGCTCCGC‑GCCGTGCCGGGTcc > 2:55577/1‑149 (MQ=255) acCTGAAGAAGAAATCCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCGGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCcttct < 2:396356/149‑1 (MQ=255) acCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAAGTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCACGGC‑GCGCAGCCATGCCGGtggatatt < 2:200267/149‑8 (MQ=255) aagaaAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTAAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGcc > 2:430399/1‑149 (MQ=255) agaaAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCg > 2:781209/1‑149 (MQ=255) agaaAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCg > 1:502911/1‑149 (MQ=255) acaaaaCCATCCCAGGTGACTCCGCAAGTGGTCGTCGGAAAGGCCTGGCCGAAGTCCGCGGTGTCTAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGCCATGGCTGCGC‑TCCGTGCCGTTTCCTTCTGCCTTGCCg < 2:354427/147‑1 (MQ=255) aaaCCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCa < 1:560153/149‑1 (MQ=255) cAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTATAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGaa < 2:580539/149‑1 (MQ=255) gTTACTCCGCAATTGGCCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGAc < 2:735245/149‑1 (MQ=255) ccccGCAATGGGTCGTCGGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGAt < 1:171186/147‑1 (MQ=255) tCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGAtt > 2:686143/1‑149 (MQ=255) cGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCt > 2:706568/1‑149 (MQ=255) cGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGAACCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCt > 1:25979/1‑149 (MQ=255) cAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTAGCGTAAGTTCGCGGTGTCGATCTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTACTATCCACCGCCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTGCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTgg < 1:7401/149‑1 (MQ=255) aactGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGa < 1:72919/146‑1 (MQ=255) aaTTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGa < 2:629873/149‑1 (MQ=255) tGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGACGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGtt > 2:472271/1‑149 (MQ=255) tcgtcTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTGGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTAc < 1:558108/149‑1 (MQ=255) tcgtcTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGGGTTTAc > 1:276267/1‑149 (MQ=255) gAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATggc > 2:314245/1‑147 (MQ=255) cTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTAtt < 1:618812/149‑1 (MQ=255) tGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTAttg > 2:60016/1‑149 (MQ=255) ccGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTAttgttg > 2:81683/1‑149 (MQ=255) cGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGCTGCCTACTAttgttgg > 1:444552/1‑148 (MQ=255) cGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGa > 1:663496/1‑149 (MQ=255) aaGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACa < 1:781209/149‑1 (MQ=255) aaGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACa < 2:502911/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCa < 1:602692/149‑1 (MQ=255) gtCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGACGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCg < 1:617540/149‑1 (MQ=255) aTCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGcccgcccg > 2:88827/1‑149 (MQ=255) aTCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGAACGCAATCTCCCGGTTgcccgcccc > 2:693384/1‑148 (MQ=255) aTCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGGTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGaccgcccg > 1:93162/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTc < 1:643162/149‑1 (MQ=255) cAGCGGGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCa < 2:739820/149‑1 (MQ=255) cAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCa < 1:28635/149‑1 (MQ=255) cAGCGCGCTTTCTTGAGCCGTTAACATCCACCGGCATGGCCGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGCCGGCTTCTTGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCa < 2:285121/149‑1 (MQ=255) gcgcgcTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGGAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGCCATg > 1:522736/1‑149 (MQ=255) gcgcgcTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCATTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATg > 1:522835/1‑149 (MQ=255) gcgcgcTGTCTTTGGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATg < 2:236741/149‑1 (MQ=255) gcgcgcATTCTTTAGCCGTTAATACCCACCGGCACGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACTTATCCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCAGTCATg < 1:23372/149‑1 (MQ=255) cgcgcTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATgg < 1:367357/149‑1 (MQ=255) cgcTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGa < 1:81683/149‑1 (MQ=255) ctttctttAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATc > 2:346060/1‑149 (MQ=255) ccGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCt > 2:351187/1‑149 (MQ=255) gTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTgg > 2:176421/1‑149 (MQ=255) gTTAATATCCACCGGCATGGCTGAGC‑GCCGTGCCGGTTACTTCTTCATTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATGCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCGATCTACCGGTTGCCAGACAAACAGGGGATCATTCTCGTCggg > 2:585348/1‑149 (MQ=255) ttAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGa > 1:670109/1‑149 (MQ=255) cACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACTGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGGTCATTCTCGGCTGGAATCCCGCa > 1:520572/1‑149 (MQ=255) cACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCTTTGGGAATcgcggc > 2:415907/1‑147 (MQ=255) cACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCa > 1:655774/1‑149 (MQ=255) cACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCa > 1:45717/1‑149 (MQ=255) cACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCa > 2:156629/1‑149 (MQ=255) cACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACCACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCGTGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCa < 1:472271/149‑1 (MQ=255) aCCGGCACGGC‑GCGCAGCCATGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCAt > 1:348968/1‑149 (MQ=255) aCCGGCACGGC‑GCGCAGCCATGCCGCTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGCACTCACGCAt > 1:391450/1‑149 (MQ=255) ggCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATtgt < 1:60016/149‑1 (MQ=255) aTGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCa > 1:237702/1‑149 (MQ=255) | GATGCTGGACGACCTGAAGAAGAAAACCAACCCAGGTTACTCCGCAATTGGTCGTCTGAAAGGCCTGGCCGAAGTTCGCGGTGTCGAACTGGCGATCCAGCGCGCTTTCTTTAGCCGTTAATATCCACCGGCATGGCTGCGC‑GCCGTGCCGGTTCCTTCTTCCTTGCCGTCACTCTTTGAAGACGGATTCTGGAGTTTACGATGACTACTATTGTTGACAGCAATCTGCCGGTTGCCCGCCCGTCATGGGATCATTCTCGTCTGGAATCACGCATTGTGCA > NC_000913/4552701‑4552981 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |