Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,116,703 | T→G | 100% | K173N (AAA→AAC) | glpK ← | glycerol kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,116,703 | 0 | T | G | 100.0% | 232.1 / ‑6.7 | 69 | K173N (AAA→AAC) | glpK | glycerol kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base G (40/28); minor base C (0/1); total (40/29) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
AACGACGCACTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATTTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGTCAATCACCAGACCGGTATTGCTGCGG > NC_000913/4116561‑4116847 | cacgacgCACTTCTGGCAGCTTCCCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCCTTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAg < 2:739393/148‑1 (MQ=255) aaCGACGCACTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAg < 1:27894/149‑1 (MQ=255) acgacgCACTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGa > 1:110087/1‑149 (MQ=255) aCTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTAATGCATGTTCCAGATAAGcaa > 1:7059/1‑147 (MQ=255) ttCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTTGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACg < 2:671606/149‑1 (MQ=255) tCTGGCAGCATCCCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGGCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACACGGCACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGt < 1:682647/149‑1 (MQ=255) agcaTCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGTTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAAc < 1:559840/149‑1 (MQ=255) taTCTCGCGCGGAAGATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTGCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCg < 1:340797/148‑1 (MQ=255) tctcGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCTGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTa > 1:504867/1‑149 (MQ=255) tctcGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCCGGGTATGGATGTTCAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTa < 2:552055/149‑1 (MQ=255) tctcGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTa < 1:221576/149‑1 (MQ=255) tctcGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTa < 1:328008/149‑1 (MQ=255) ctcGGGCGGAATATCCAGCACTTCCCGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACCTGGGCACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTAc < 1:154879/149‑1 (MQ=255) tcGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTAcc > 2:327561/1‑149 (MQ=255) tcGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGCCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTAca > 1:639139/1‑148 (MQ=255) cgcgGAATATCCCGCACTTCCGGGACTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCACGCGTACCaaa < 2:718641/149‑1 (MQ=255) gAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGCACAACATGGTACGCGAGGCGTTGGTGTAATCGGGCACAGGGACAGGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAGCCCAGGTATCACCCATACCaacaagc > 2:297491/1‑144 (MQ=255) gAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAGCCGTACCAAACAGc > 2:206358/1‑149 (MQ=255) gAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGc > 1:663548/1‑149 (MQ=255) gAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGc > 1:103725/1‑149 (MQ=255) aaTATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCCGATAAGCCACGTGTCACCCGTACCAAACAGCa > 1:662747/1‑149 (MQ=255) atCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTGAAATGCACACGGCCCTGAGACATGTTCCAGATACGCCACGGATCAACCGTACCAAACAGccaat > 2:710544/1‑145 (MQ=255) cACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTcaccac < 1:57358/149‑1 (MQ=255) cTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCacga > 1:94258/1‑149 (MQ=255) aGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCAAATGAACACAACCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATGAACCGTACCAAACAGCAATTGACGCCGACTTGc > 1:101204/1‑149 (MQ=255) ttGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCTTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGGATCAAGCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTc < 2:519458/149‑1 (MQ=255) tcCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGCACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCgagg > 1:577714/1‑148 (MQ=255) cccAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTGTCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACCTGCAGGCTCGCGagag > 1:484976/1‑149 (MQ=255) gTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGAATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCCCGACGTGCACGCTCACGAGAGCCtt > 1:147507/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACAACGACGTGCACGCTCGCGCGAGCCTTcc > 2:69712/1‑149 (MQ=255) aGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGAACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCcac > 2:509297/1‑149 (MQ=255) gggTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGGCATGTTCCAGATAAGCCCCGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGGGCCTTCcaca > 1:206142/1‑149 (MQ=255) tGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTc > 1:188081/1‑149 (MQ=255) ggATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTcc > 1:422481/1‑148 (MQ=255) aTGTGGGACAACATGGTACGAGAGGCGTTGTTGTAATCGGTCCCATGGACACGGTCCTGAGTCATCTTCCAGATAAGCCACGCATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAg < 2:230536/149‑1 (MQ=255) aTGGTGAACAACAGGGTACGGGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAg < 2:39990/149‑1 (MQ=255) gTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGGCGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGa > 1:145495/1‑149 (MQ=255) gTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGa < 2:548930/149‑1 (MQ=255) gTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGa < 2:587941/149‑1 (MQ=255) gTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGa < 1:635828/149‑1 (MQ=255) gAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATAAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGAGGTGCCCGCTCGCGGGAGCCCTCCACATGGTCGGGGATcc > 2:155058/1‑149 (MQ=255) acaataTGGTACGAGAGGCGTTGGTTTAACCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCACACTAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCcac < 2:557281/149‑1 (MQ=255) acaacaCGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAGTCGGTCACCTGGACACGGCCCTGCGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACGTGGTCGAGTATGcac < 2:329528/149‑1 (MQ=255) caTGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCcacttca < 1:572095/149‑1 (MQ=255) aTGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAAAGCCTGCCACCTGTGCGAGGAGCcacgtcac > 1:748743/1‑149 (MQ=255) ggTACGAGAGGCGTTGGTGTAACCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCcccttcactt > 2:673898/1‑149 (MQ=255) tACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCATCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTg < 2:504867/149‑1 (MQ=255) agagGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATCAGCTACGTATCAACCGTAGAAAACAGCAATTCACCACGCCGTGGACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGCCGAGGATCCACTTCACGTTGGTGc > 2:381830/1‑149 (MQ=255) agagGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTCTCAACCGTACCAAACACCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCCCATGGTCGAGGATCCCCTTCACTCTCGTGc > 2:501570/1‑149 (MQ=255) agagGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTAAAAACCCTATCAACCAACAATTCACCACGACGGGCACGCTCGGGGGAGCCCTCCACCTGGCCGAGGCACCACTTCACTTTGGtcc > 2:359136/1‑147 (MQ=255) gggCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCa < 2:502223/148‑1 (MQ=255) gCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCCCTTCACTTTGGTGCCGGa > 1:253718/1‑149 (MQ=255) gCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATAGACCAGGACCCACCTCACCTTGGTGCCAGa > 2:708378/1‑149 (MQ=255) gCGTTGGTGTAATCGGTCACACGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCTCGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGTGCCTTGCACATGGTCGAGGATCCACTTTACTTTGGTGCCAGa > 1:552997/1‑149 (MQ=255) cGTGGGTGTACCAGGTCACAGGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGaa < 1:130087/149‑1 (MQ=255) ttGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGaaaa < 1:327561/149‑1 (MQ=255) gtgtAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTa < 2:188081/149‑1 (MQ=255) tAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCTAGTATCCACTTCACTTTGGTGCCAGCAAAGTACgg > 2:436170/1‑149 (MQ=255) aTCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGCAAAGTACgggc > 1:192427/1‑148 (MQ=255) tCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGTc > 2:643582/1‑149 (MQ=255) gTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGACCAGTACGGGTCGAt > 1:71276/1‑149 (MQ=255) gTCACATGGACACGGCCCCGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGTCGAt > 2:1695/1‑149 (MQ=255) acaTGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGTCAATCAc < 1:84647/149‑1 (MQ=255) aTGGACACGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAGAAGCACGGGTCAATCACCa > 1:579890/1‑149 (MQ=255) acGGCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGGGCCAGAAAAGTACGGGTCAATCACCaaccccg > 2:161204/1‑143 (MQ=255) ggCCCTGAGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCACCCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCACGCGCGCGCCTTCCACATGTACGAGCGTCCACTTCACGATGGTGCAAGAAACGTACGGGTCAATCACAACACCGGTa > 2:669031/1‑149 (MQ=255) aGTCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGTCAATCACCAGACCGGTATtgctgc < 2:663548/149‑1 (MQ=255) aGTAATGTTCCAGTTAAGCCACTTAGCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGTCAATCACCAGACCGGTATtgctgc < 1:297491/149‑1 (MQ=255) tCATGTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGGCAATCACCCGACCGGTATTGCTGCgg > 2:412166/1‑149 (MQ=255) | AACGACGCACTTCTGGCAGCATCTCGCGCGGAATATCCAGCACTTCCAGCATTTTGTCGTCCCAGTCCAGGGTATGGATGTTGAACAACATGGTACGAGAGGCGTTGGTGTAATCGGTCACATGGACACGGCCCTGAGTCATTTTCCAGATAAGCCACGTATCAACCGTACCAAACAGCAATTCACCACGACGTGCACGCTCGCGAGAGCCTTCCACATGGTCGAGGATCCACTTCACTTTGGTGCCAGAAAAGTACGGGTCAATCACCAGACCGGTATTGCTGCGG > NC_000913/4116561‑4116847 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |