| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,454,128 | G→A | 6.6% | R182H (CGT→CAT) | yjfF → | putative sugar ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,454,128 | 0 | G | A | 6.6% | 212.6 / 3.9 | 78 | R182H (CGT→CAT) | yjfF | putative sugar ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/36); new base A (2/3); total (38/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 | |||||||||||
CTCGTTTCGGAAGAGTCGATTCCGATAAACCATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACTGGCAACGCTGGCGGGGATTGTCTTCTCGATTT > NC_000913/4453980‑4454274 | cgcGTTTCGGAAGAGTCTATTCCGATCAGCCCTCCCATTTATGACACGCTCTCCAGCCTTGCGTGGAATATCCCTTGCGTCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGCTGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCg < 2:644949/147‑1 (MQ=255) cGTTTCGGAAGAGTCGATTCCGATAAACCATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTa < 1:187448/149‑1 (MQ=255) tttCGGAAGAGTCGATTCCGATAAACCATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGGAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTAACGGCATATTCCTCGCGCATCGTAcc < 1:375450/149‑1 (MQ=255) ttCGGAAGAGTCGATTCCGATAAACCATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGCTGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGGGGGTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGGAccc > 1:346140/1‑149 (MQ=255) ggAAGAGTCGATTCCGATAAACCATCACATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACGGCTGAGGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTACTCGGGCATCGTACCCGtt > 1:19128/1‑149 (MQ=255) gTCGATTCCGATAAACCATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTa > 1:305361/1‑149 (MQ=255) gTCGATTCCGATAAACCATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTAACGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTa > 2:77882/1‑149 (MQ=255) tCGATTCCGATAAACCATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGCTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCCCGCGCATCGTACCCGGTTTGGtca > 2:461875/1‑147 (MQ=255) gATTCCGATTAACCATCCCTTTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGCGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATc < 2:148591/149‑1 (MQ=255) aTTCCGCTAAACCATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAACATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGGCTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGCTGTCGGCCTCTTCCTCCCGCCTCGTACCCGTTTCGGTACTCa > 2:91278/1‑149 (MQ=255) tCCGATAAACCATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGGATCGTACCCGTTTTGGGAATCAgg > 2:728456/1‑149 (MQ=255) cGATCAACCATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGta > 2:631511/1‑149 (MQ=255) gATAAACCATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGtat > 1:138504/1‑149 (MQ=255) gATAAACCATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGtat > 2:547752/1‑149 (MQ=255) aCCATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGcg > 1:625409/1‑148 (MQ=255) ccATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCa < 2:548412/149‑1 (MQ=255) cATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCAt > 1:707735/1‑149 (MQ=255) aTCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCAtt < 1:400936/149‑1 (MQ=255) cATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCATACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTgg > 2:601203/1‑147 (MQ=255) cATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCATACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTgg > 2:601264/1‑147 (MQ=255) cATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCATACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTgg < 1:601264/147‑1 (MQ=255) cATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCATACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTgg < 1:601203/147‑1 (MQ=255) cATTTAGGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTggcg < 1:353639/149‑1 (MQ=255) ctttATGACGCGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTggcgg < 2:637958/148‑1 (MQ=255) tacgACACGCTCTCAAGCCGTGCCTGGAAAGTCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCCTATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGgcaa < 2:496024/146‑1 (MQ=255) tATGACACGCTCTCAAGCCGTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGGCGCTTAAGTGCGATGGGCCTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCCTATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATCCGCCATTGGCGgcaa < 2:495775/149‑1 (MQ=255) aTGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGTATATTACTCGCGCATGGTACCCGTTTGGGTAGTCACGTACACGCCATTgccggtgac > 2:391601/1‑145 (MQ=255) aTGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTGGGTAATCCGGTATAGGCGATTGGCGgcaag > 2:391694/1‑148 (MQ=255) gACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGgcaacgc < 1:448123/149‑1 (MQ=255) cacGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGgcaacgcaa < 1:277899/149‑1 (MQ=255) tctcAAGCCTTGCGTGGAAAATCCTTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGGCTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCATACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCg < 1:212329/149‑1 (MQ=255) cAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCCACGTCGGCg > 1:32924/1‑149 (MQ=255) taGCCTTGCGGGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGa < 1:446931/148‑1 (MQ=255) gCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAAt < 2:183393/149‑1 (MQ=255) gCCGTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAAt < 2:343839/149‑1 (MQ=255) ccTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGTATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATc > 1:486909/1‑149 (MQ=255) cGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATg < 2:534073/149‑1 (MQ=255) gTGGAACATCCCTGGGGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATgg < 2:478608/149‑1 (MQ=255) ggAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATgggg > 1:712502/1‑149 (MQ=255) ggAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATgggg < 2:705580/149‑1 (MQ=255) aaaTCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGAtt > 1:7024/1‑149 (MQ=255) attgctgggcggcGGGCGCTTAGGTGCGCTGGGGCGGCTGATGTGGGCGGTGGTGGTTATAGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGAttt < 2:34139/142‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGGTGGGGATTTCCACt > 1:452872/1‑149 (MQ=255) gcggcgGCCGCTGAAGGGCGATGGGACTGTTGATGTTTGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCATGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCgc < 2:18359/149‑1 (MQ=255) ggcggTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGTAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCgcag < 1:540606/149‑1 (MQ=255) gcggTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCGTATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTCTACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTGGGCGAATCTGATGGGGAGTTCCACTCgcggc > 2:187941/1‑149 (MQ=255) ggTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGcac < 1:118812/149‑1 (MQ=255) tAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTAtt > 1:242194/1‑149 (MQ=255) gTGCGATGGGACTGCGGATGTTGGCAGTGGTGGATATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATCCGCCATTGGCGGCCACGCAACGTCGGCGAATCTGATGTGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGc < 1:458984/149‑1 (MQ=255) tgagATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATAGGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCa < 2:122410/146‑1 (MQ=255) gATGGGACGGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCAttt < 1:278539/149‑1 (MQ=255) aTGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCACCGCCGGCGAATCTGATGGGGGTGTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTta > 1:209565/1‑149 (MQ=255) gggACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGTTGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTtact > 2:385244/1‑147 (MQ=255) cggcggATGTTGTCGGTGTGGTTTATCGGCATATTTCTCGCGCATCCTACCCGTTTTGGTAATCAGGTCTACGCCATTTGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATCGTGATTTCCACCCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGct < 2:467569/144‑1 (MQ=255) gATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGACTCTGTTCATGATGTCCCCTCGCAGCGCCACTGTTCGCATTTATATGCTCTCCa > 1:545311/1‑149 (MQ=255) gATGTTGGCGGTGGTGCGTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCa < 2:680430/149‑1 (MQ=255) aTGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTACTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTCTACACCCTTGGCGGCAACGCAACGTCGGTGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCAc > 1:475592/1‑149 (MQ=255) gTTGGCGGTGTTGGTTTTCGGCACATGCGTGGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGTAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCg < 2:567860/149‑1 (MQ=255) ttGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGACTCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCgg > 1:596086/1‑149 (MQ=255) tGGCGTTGCTGTTTATGCGCATGTTCCTCGTGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCGACGTCGGCTAATCTGATGGGGATTGCCACTCGCAGCACCACTGTTCGTATTGTTATGCTCTCCACCGGa < 2:612012/149‑1 (MQ=255) tGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGa < 1:410086/149‑1 (MQ=255) gCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACt < 2:712502/149‑1 (MQ=255) cGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACTg < 2:595959/149‑1 (MQ=255) aggggtggtTAGCGTCATATTCCCCGCGCAGCGCACCCGGTTTGGTAATCAGGTCTACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACTgg < 1:72094/146‑1 (MQ=255) ggtTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCTTTTCTATGCTCTCCATCGGACTAGCTAcac > 1:256082/1‑147 (MQ=255) ggtTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACTGGCAACGc > 2:598781/1‑149 (MQ=255) gtTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCGGCACCACTATTCGCAGTTATATGCTCTCCACCGGACGGGCACCGCt > 1:373381/1‑149 (MQ=255) tATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACTGGCAACGCTgg < 1:573135/149‑1 (MQ=255) tCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTGTACGCCATTGGCGGCAACGCCACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCCCTCGCAGCACCACTCTTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACTGGCAACGCTGGCg > 2:312449/1‑149 (MQ=255) cATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACTGGCAAAGCTGGCCGGGa > 2:618097/1‑149 (MQ=255) cATATCCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTACACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCACTTATATGCTCTCCACCGGACTGGCAACGCTGGCGGGGa < 1:91278/149‑1 (MQ=255) tatTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACTGGCAACGCTGGCGGGGAtt > 1:284269/1‑149 (MQ=255) ccTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCCACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTCTTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACGGGCAACGCTGGCGGGGTTGGtct > 2:389235/1‑149 (MQ=255) tCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACTGGCAACGCTGGCGGGGAGTGgcttc > 2:497841/1‑149 (MQ=255) cgcgCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGCCTGGCAACGCTGGCGGGGATTTgcttct > 2:275888/1‑149 (MQ=255) gcgcATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACTGGCAACGCTGGCGGGGATTGTCTtctc < 1:424206/149‑1 (MQ=255) gcATCGTCCCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACTGGCAACGCTGGCGGGGATTGTCTTCTCGa < 1:430231/149‑1 (MQ=255) cATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACTGGCAACGCTGGCGGGGATTGTCTTCTCGAt < 1:77882/149‑1 (MQ=255) tCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCGACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGGCTGGCAACGCTGGCGGGGGTTGTCTTCTCggtgt > 2:410306/1‑145 (MQ=255) | CTCGTTTCGGAAGAGTCGATTCCGATAAACCATCCCATTTATGACACGCTCTCAAGCCTTGCGTGGAAAATCCCTGGCGGCGGTCGCTTAAGTGCGATGGGACTGCTGATGTTGGCGGTGGTGGTTATCGGCATATTCCTCGCGCATCGTACCCGTTTTGGTAATCAGGTATACGCCATTGGCGGCAACGCAACGTCGGCGAATCTGATGGGGATTTCCACTCGCAGCACCACTATTCGCATTTATATGCTCTCCACCGGACTGGCAACGCTGGCGGGGATTGTCTTCTCGATTT > NC_000913/4453980‑4454274 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |