| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,413,542 | A→T | 100% | Y67N (TAT→AAT) | ydaC ← | DUF1187 family protein, Rac prophage; putative double‑strand break reduction protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,413,542 | 0 | A | T | 100.0% | 261.3 / ‑6.7 | 80 | Y67N (TAT→AAT) | ydaC | DUF1187 family protein, Rac prophage; putative double‑strand break reduction protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (38/41); minor base G (0/1); total (38/42) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
CGAAGCATCAGGCCGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATACAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAATATCTTGTC > NC_000913/1413397‑1413687 | cGAAGCATCAGGCCGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCTCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCaa > 1:1003325/1‑149 (MQ=255) gAAGCATCAGGCCGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTCTTAATAATCAGCTATGAAGTTTTACTTTGAATTCAAt > 1:1298198/1‑149 (MQ=255) tCACGCCGTATTCTACCATCCATTCTTCATTATAGAGTACTTGGTCCATCTCATCTCCTCTTGCATGCGCTAATGTTAGTCGGAAATTGACGCCTGATTTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAAtt < 2:767107/149‑1 (MQ=255) ggCCGTACTCAACCATCCGCTCTTCCGCAAAGATTACTTGTGCCATCCGATCACCTCTGGCATGCGCCAATGTTAGACTGAATTTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATtct‑c < 2:338615/149‑1 (MQ=255) gCCGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑Cg < 1:1275172/149‑1 (MQ=255) ccGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGCGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGa < 1:350057/149‑1 (MQ=255) ccGTATTCAACCATCCACCCCTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGa < 1:8054/149‑1 (MQ=255) tATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGa > 2:224021/1‑149 (MQ=255) ttCAACCATCCACTCTTCATTAAAGCTTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAGTTCAATGCAATTCT‑CGAGGACt > 1:293751/1‑149 (MQ=255) ttCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACt < 1:1182890/149‑1 (MQ=255) aaCCCTCCCCTCTTAATTAAAGATTACTTTGGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCTCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTCATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGaa < 2:394484/149‑1 (MQ=255) aaCCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGaa < 1:644177/149‑1 (MQ=255) aaCCACCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGaa < 1:229706/149‑1 (MQ=255) aCCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCCGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCCATTCT‑AGAGGACTGacg > 1:1303214/1‑147 (MQ=255) cccAGTCTGCAGTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTtc > 2:1104563/2‑149 (MQ=255) aCTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCg > 1:359152/1‑149 (MQ=255) tctTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCa > 2:592533/1‑149 (MQ=255) ctTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCaa < 1:227346/149‑1 (MQ=255) ctTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCaa < 2:1122072/149‑1 (MQ=255) tCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAAtt < 1:93201/149‑1 (MQ=255) aTTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAAGGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATACAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTaa > 2:627255/1‑149 (MQ=255) tAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTaaaa > 2:793770/1‑149 (MQ=255) gATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTa < 1:61293/149‑1 (MQ=255) aTTCCTTGTGCCATCCGATCACCTCTGGCTGGCGTCAATGTTAGACTGAAATTGACCCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTAt < 2:1235869/149‑1 (MQ=255) aTTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTAt < 1:235399/149‑1 (MQ=255) aTTACTTGTGCCAACGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTTAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGATACCTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTAt < 2:740860/149‑1 (MQ=255) aCTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAg > 2:21229/1‑149 (MQ=255) cTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGt > 1:1160692/1‑149 (MQ=255) ttGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGtt > 2:1286974/1‑149 (MQ=255) ttGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCAACTGTTATTCTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCACTTAAGATTTACCAGtt > 2:674831/1‑149 (MQ=255) tgtgCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGttt < 1:1231538/149‑1 (MQ=255) tgCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTa > 1:1174157/1‑149 (MQ=255) gCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTAc < 1:1388171/149‑1 (MQ=255) ccATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGCATTCAATGCACTTCT‑CGCGGAGTGAAGTTTCTGGCAGTTAAANCTTATCAGTTTTAca > 1:1454839/1‑148 (MQ=255) aTCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACttt > 2:161068/1‑149 (MQ=255) aTCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACttt > 2:61551/1‑149 (MQ=255) aTCGCACCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACttt < 1:232120/149‑1 (MQ=255) tCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTc > 1:1267170/1‑149 (MQ=255) cATCACCTCTGGCAGTCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGc > 2:809625/1‑149 (MQ=255) aTCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGct > 1:614499/1‑149 (MQ=255) ccTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAGGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGctctct > 2:1201324/1‑149 (MQ=255) ctctGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAGTTTGAATTCCTTGC‑CTTCTACTAAGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGATTTACTTTCTGCTCTCTg > 1:339465/1‑149 (MQ=255) ctctGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTg < 1:1393201/149‑1 (MQ=255) tctGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTgg > 1:435703/1‑149 (MQ=255) tGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATGGACACCCGCTGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGGATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTATTACTTTCTGCTCTCTCGac > 2:531584/1‑148 (MQ=255) ggCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGgaa < 2:792751/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCGCTCTGGAAACg > 1:881789/1‑149 (MQ=255) gggcCAATGTTAGACTTAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATTAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGAGTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGGTTTACTTTCTGCTATCTGGAAACGCCt < 1:674831/147‑1 (MQ=255) gTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTCTTACTGTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCttt < 1:805623/149‑1 (MQ=255) gTTAGACTAAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCttt < 2:298618/149‑1 (MQ=255) ttAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCtttt > 1:554726/1‑149 (MQ=255) ttAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTAGTAATAATCAGCTATGAAGTTGTAATTTAAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCtttt > 2:1071938/1‑149 (MQ=255) tGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAGTTTATCAGTTGTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCt > 1:634120/1‑149 (MQ=255) aTTGACGCCTGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAACTTTTAATGTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCGCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTgaga < 1:606447/149‑1 (MQ=255) aTTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTgaga < 1:606443/149‑1 (MQ=255) aTTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTgaga > 1:617657/1‑149 (MQ=255) aTTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTAAATGCCATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTATCGCACTTAACATTTATAAGTTTTAATTTCTGCTCTATGGCAAAGCCTGCTTCTTTCTTACCTgaga > 1:1385752/1‑149 (MQ=255) aCGCCCGATGTTGATTATTAATACTCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCAt < 1:1365542/149‑1 (MQ=255) aCGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGTCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCAt < 1:866844/149‑1 (MQ=255) gCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCAttt > 2:1379895/1‑149 (MQ=255) gATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTc < 1:1057223/149‑1 (MQ=255) taataaTCAGCGATGCAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCGGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGACAGCATTTTTTCGCATTCTGAttt < 1:765226/149‑1 (MQ=255) ataatCCGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTATTACTCTCTGCCCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGACTTCg > 2:159064/1‑149 (MQ=255) ataatCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCg > 1:1451786/1‑149 (MQ=255) taatCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGt < 2:1355224/149‑1 (MQ=255) taatCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGt > 2:1122278/1‑149 (MQ=255) aGCTATGAAGTTTTAATTTGAATTAAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGtt > 1:735481/1‑149 (MQ=255) cTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTa < 1:1122278/149‑1 (MQ=255) cTATGAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTa > 1:956081/1‑149 (MQ=255) gAAGTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGTAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGAtt < 1:973024/149‑1 (MQ=255) gTTTTAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTg < 1:879997/149‑1 (MQ=255) tttAATTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGaa < 1:793770/149‑1 (MQ=255) aaTTTGAATGCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTAGCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAatat < 1:224021/149‑1 (MQ=255) aTTTGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAATATc < 2:617657/149‑1 (MQ=255) ttGAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGCAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAATATCtt < 2:435703/149‑1 (MQ=255) tGAATTCAATGCAATTGT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAATATCTTg < 2:1298198/149‑1 (MQ=255) gAATTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAATATCTTGt < 1:809625/149‑1 (MQ=255) aaTTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTTGTTTAGTTTTTGAATATCTTGTc > 2:264640/1‑149 (MQ=255) aaTTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAATATCTTGTc < 1:70908/149‑1 (MQ=255) aaTTCAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTGTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAATATCTTGTc < 1:70899/149‑1 (MQ=255) | CGAAGCATCAGGCCGTATTCAACCATCCACTCTTCATTAAAGATTACTTGTGCCATCGCATCACCTCTGGCAGGCGCCAATGTTAGACTGAAATTGACGCCCGATGTTGATTATTAATAATCAGCTATGAAGTTTTAATTTGAATACAATGCAATTCT‑CGAGGACTGAAGTTTCTCGCAATTAAAATTTATCAGTTTTACTTTCTGCTCTCTGGAAACGCCTGCTTCTTTTTTACCTGAGAGCATTTTTTCGCATTCTGATTTCGTTAGTTTAGATTTTGAATATCTTGTC > NC_000913/1413397‑1413687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |