Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,305,011 | A→G | 7.4% | intergenic (+620/+95) | eco → / ← mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,305,011 | 0 | A | G | 7.4% | 276.1 / 6.2 | 107 | intergenic (+620/+95) | eco/mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/57); new base G (5/4); total (46/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.90e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCG > NC_000913/2304868‑2305158 | tAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATc < 2:806819/149‑1 (MQ=32) aGGTCGGATAAGGCGGGTACGCCGCATCCGACCTCCAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCt < 1:1079791/149‑1 (MQ=16) gTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAAc < 2:292194/143‑1 (MQ=32) aaGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGccggg > 1:259338/1‑146 (MQ=37) ggTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCaa < 2:610104/130‑1 (MQ=31) gccgcATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACCCCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTGACGCCGCATCCAACATCTACCGCCCGCGCCGGTTGCCt > 2:1072723/1‑149 (MQ=255) gccgcATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCt > 1:541294/1‑149 (MQ=38) ccgcATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTg > 2:804290/1‑149 (MQ=38) tCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGATGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGATGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTgg > 1:307554/1‑149 (MQ=255) tAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACCTCTACCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGGGCCGCTcgcg > 1:237059/1‑149 (MQ=11) tAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGTTGCGACGCTGgcg > 1:274366/1‑149 (MQ=37) tAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGCTGCGCCGCTGgcg > 2:640339/1‑149 (MQ=255) ccGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGcgcg < 1:405791/148‑1 (MQ=39) aCGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACCCCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCCACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGGCCCTGGcgcg > 2:86825/1‑149 (MQ=255) cGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCTCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGGGACGCTGGCGCGt < 1:884742/149‑1 (MQ=255) cGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:1193959/149‑1 (MQ=39) gtccgaGCCGGTTCCCTGACGCCACGCTGCCGCGCCTTTTCCGGCCCACACCGCTGTGAAGTGCCCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTc < 2:625369/144‑1 (MQ=11) gCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGcc < 2:1141654/116‑1 (MQ=18) gCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGcc < 2:1141842/116‑1 (MQ=21) gCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGcc < 2:1180080/116‑1 (MQ=21) gCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATGCGACATCTAAGGCCCGGGCAGGTTGGCTGTTGCGACGCTGGCGCGtg > 1:202622/1‑148 (MQ=11) aaGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGCTTGCCTGATGCCACGCCGGCGCGTCTTAt > 2:984883/1‑149 (MQ=255) aGCCGGTGGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATc < 1:103473/149‑1 (MQ=37) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGACGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGGTAACGCGGTTACGCCGCCTCCAACCTCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGGCCGTCTTATCAGc > 2:1017295/1‑149 (MQ=11) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCTGGTTGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGc < 1:804266/149‑1 (MQ=255) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGAAGCGACGCTGGCGGGTCTTATCAggc > 2:84116/1‑147 (MQ=2) gCCTGATGCGCCGATGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACg < 1:459968/149‑1 (MQ=255) ccTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCTACGc > 1:588156/1‑149 (MQ=255) ccTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGc < 1:433717/149‑1 (MQ=255) ccTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGc > 2:148103/1‑149 (MQ=255) ccTGATGCGACGCCCCCGCGTCGCATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGc < 1:147410/149‑1 (MQ=11) ccTGATGAGACGCGGCCGCGTCTCATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGc < 2:62432/149‑1 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACGTCTAACGCCCGAGCCGGTTGTCTGATGCGACGCAGGCGCGTCTTATCAGCATACGcc > 1:411437/1‑149 (MQ=255) tGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGGAGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCca > 1:907115/1‑149 (MQ=255) tGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCca < 1:698083/149‑1 (MQ=255) gACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGCTGCGACGCAGACGCGTCTTATCAGCATAAGACACATCCg > 2:1166501/1‑149 (MQ=14) gACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCg > 2:385964/1‑149 (MQ=255) ccgttGGCGCGGCAGATCAGGCCTGCACCGCTGTGATGTGCTCCACC‑CCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCgg < 1:1109763/145‑1 (MQ=14) aCGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCgg > 2:1035524/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGa > 2:48341/1‑106 (MQ=40) cTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGa < 1:48341/106‑1 (MQ=40) cTGGCGCGCCTTATCACGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCAt < 2:199791/149‑1 (MQ=255) tGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATa < 1:543850/149‑1 (MQ=255) tGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATa < 1:104067/149‑1 (MQ=255) cgccgcgTCTTATCAGGCCCACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATa < 1:567175/146‑1 (MQ=255) gcgcGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATAcc > 1:777284/1‑149 (MQ=255) cgcgTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCa < 1:338136/149‑1 (MQ=255) gTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGc < 1:804290/149‑1 (MQ=255) gTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGc < 2:710328/95‑1 (MQ=21) gTCTTACCGGGCCCACAACGCCGTGAAGTGCTCCGCC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGc < 1:352540/149‑1 (MQ=18) tCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCt < 2:605823/76‑1 (MQ=38) ttATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCgg > 1:238538/1‑149 (MQ=255) ttATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCgg > 1:310823/1‑149 (MQ=255) tATCAGGCCTACACCGCTCTGACGTGCTCGACC‑CCGTATGTTCGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGTTTGCCTGATGCGACGCTGCCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGa < 2:362519/149‑1 (MQ=18) aTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGAt < 1:228933/149‑1 (MQ=255) aTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCGCCGTCGT‑GCTCGGGCTTCGCGGAATCGCCGCATCCAACAGCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGAt < 1:297672/149‑1 (MQ=17) tccggCCTACCCCGCTGTGAAGTCCTCCACC‑CCGTACGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGAtg < 1:1016927/146‑1 (MQ=18) tCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCAGTTACGACGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGAtg > 2:845483/1‑149 (MQ=255) tCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTAGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACa < 2:723003/68‑1 (MQ=25) tCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTCCCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGTGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGAtg < 2:699333/149‑1 (MQ=255) gCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGCTGCGACGCTGGCGCGTCCTCTCCGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGCTGTGGc > 2:3248/1‑149 (MQ=18) tACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCTACGCCCCATCCGGCATGCCATGCCGGGTGTGGCgga > 2:41810/1‑147 (MQ=14) ccacCGCTGTCACGTGCCCCCCC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTAt < 2:523949/148‑1 (MQ=255) acCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCa > 1:746483/1‑149 (MQ=255) acCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGAt < 2:504414/84‑1 (MQ=25) cGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCAtt > 2:1122892/1‑149 (MQ=255) gCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTa < 1:1033724/149‑1 (MQ=255) tgtgAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACa > 2:1288904/1‑149 (MQ=255) gtgAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACaa < 1:1232856/149‑1 (MQ=255) gtgAAGGGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACaa < 1:84116/149‑1 (MQ=255) aaGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCTACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGc > 2:582392/1‑149 (MQ=255) gggCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCaa < 1:41810/147‑1 (MQ=255) gTGCTCCCCC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTCACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCACGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCaa < 1:970658/149‑1 (MQ=255) tGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGAGGGGGCGCATCATTACAAAGCAat > 2:349022/1‑149 (MQ=255) cTCCGCC‑CCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCgg < 2:852756/109‑1 (MQ=11) cTCCGCC‑CCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCgg > 1:852756/1‑109 (MQ=11) cTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAt < 2:105695/90‑1 (MQ=255) tCCACC‑CCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATc < 2:1229347/149‑1 (MQ=255) aCC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTAt > 2:132076/1‑129 (MQ=255) aCC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTAt < 1:132076/129‑1 (MQ=255) aCC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGc < 1:311885/149‑1 (MQ=255) aCC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGc < 1:323748/149‑1 (MQ=255) c‑ccGTAGGGTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCa < 1:979187/149‑1 (MQ=255) cGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCGTCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATCTGGCGTATCATTACAACGCAATAACCGCCAct > 2:726531/1‑149 (MQ=255) gTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTCTCATTACAACGCAATATCCGCCActt > 2:447862/1‑149 (MQ=255) ggCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAATggg < 1:1156351/149‑1 (MQ=255) gTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATAAGCATACGCCACATCCGGCATAACATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCACATTCTTTTTGAACGCGTTga > 1:975484/1‑148 (MQ=37) aCGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGt > 2:880924/1‑149 (MQ=255) aCGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAACCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGt < 1:931780/149‑1 (MQ=255) ccgcATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGTTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCACACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGGAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTc > 1:845480/1‑149 (MQ=255) ccgcATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTc > 1:958750/1‑149 (MQ=255) cgcATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTGCAACGCCATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCa > 1:563599/1‑149 (MQ=255) cgcATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCa > 1:545616/1‑149 (MQ=255) gcATCCAACATCTAACGCCCGGGCCGGTGGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCaa < 2:268951/149‑1 (MQ=255) gcATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCaa < 1:159245/149‑1 (MQ=255) gcATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCaa < 2:85485/149‑1 (MQ=255) gcATCCAACACTCAACGCCCGAGCCGGTTGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCaa < 2:1024768/149‑1 (MQ=255) ccgccAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCatc < 2:187207/146‑3 (MQ=255) cATCCAACATCTCACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGGGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAAc < 2:454440/149‑1 (MQ=255) cAACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCg < 2:665270/149‑1 (MQ=255) | TAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACC‑CCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTTCTTTTTGAACGGGTTGCGGTTTCAACTGCG > NC_000913/2304868‑2305158 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |