| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 752,647 | T→C | 7.5% | D50G (GAT→GGT) | ybgD ← | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 752,647 | 0 | T | C | 7.5% | 212.4 / 5.9 | 80 | D50G (GAT→GGT) | ybgD | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (23/50); new base C (3/3); total (27/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.47e-01 | |||||||||||
TACGCCAACTTTGGATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAAC > NC_000913/752499‑752793 | tACGCCAACTTTGGATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCACGCAGATCACAGTTGATCAAGCCAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTAt < 2:760982/149‑1 (MQ=255) cGCCAACTTTGGATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATGACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGGCACGTTATTGCAATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCa < 1:907809/149‑1 (MQ=255) cGCCAACTTTGGATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCa < 1:405849/149‑1 (MQ=255) gCCAACTTTGGATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCaa > 2:318429/1‑149 (MQ=255) gCCAACTTTGGATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCaa > 2:1105186/1‑149 (MQ=255) gCCAACTTTGGATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGCTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGAGCTATGTGTTTATCaa > 1:168737/1‑149 (MQ=255) ccAACTTTGGATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCGCCCGGTTTATATGGCTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTATTCAat > 2:41927/1‑149 (MQ=255) ttGGATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGGAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATAtcttc < 1:180785/149‑1 (MQ=255) tGGATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATAtcttct < 1:535724/149‑1 (MQ=255) ggATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTg < 1:773616/149‑1 (MQ=255) ggATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTg < 1:67559/149‑1 (MQ=255) ggATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTg < 2:486581/149‑1 (MQ=255) ggATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTg < 1:130205/149‑1 (MQ=255) gATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTgg > 2:150922/1‑149 (MQ=255) cGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGaa > 1:206647/1‑149 (MQ=255) cGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGaa > 1:422002/1‑149 (MQ=255) cGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGaa > 1:1181618/1‑149 (MQ=255) ggCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAAt < 1:1290157/149‑1 (MQ=255) ggCATTCCGCTACCGGTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGCTCTATGTGTTTATCAATATCTTCTGGATGAAt < 2:1251766/149‑1 (MQ=255) gCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTAGCAATATCTTCTGGATGAAtt > 2:919731/1‑149 (MQ=255) ttCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTca > 1:1109420/1‑149 (MQ=255) tCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGACGAATGTcac < 2:1122364/149‑1 (MQ=255) ccGCTACCGTTTTCAGAAGCAGGCCGATCACAGTTGATCAAGCTAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGACGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTcaca < 2:823137/149‑1 (MQ=255) cGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACaa > 1:709514/1‑149 (MQ=255) gCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAg < 2:773437/149‑1 (MQ=255) gCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAg < 1:687732/149‑1 (MQ=255) gCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAg < 1:9418/149‑1 (MQ=255) cTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAgg < 2:1218527/149‑1 (MQ=255) cTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAgg < 1:771358/149‑1 (MQ=255) tttgcAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTc < 2:177853/145‑1 (MQ=255) gTCAGAAGCAGGCAGATTACAGTTGATCAAGCGAATTTCGACTGCCACTTGATTGTTATGATGCTCCCGTTTTATATGTGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCaa < 2:577154/149‑1 (MQ=255) gTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCaa < 2:402732/149‑1 (MQ=255) gTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCaa < 1:318429/149‑1 (MQ=255) tCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAGGTTGCTTCatt > 1:925319/1‑147 (MQ=255) tCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAAt < 1:1212117/149‑1 (MQ=255) cAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTAATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTCTCAATATCTTCTGGATGAATTTCACCAGGTGCTTCAATa < 2:793111/149‑1 (MQ=255) gAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAAc < 1:473271/149‑1 (MQ=255) aaGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAAcc > 2:152558/1‑149 (MQ=255) aTCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTACCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTaa > 2:219341/1‑149 (MQ=255) aTCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGGTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTACCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTaa > 2:257553/1‑149 (MQ=255) aTCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTGATTGCTATGATGCTCCCGGGTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTACCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTaa > 2:955145/1‑149 (MQ=255) tCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTaaa > 2:377241/1‑149 (MQ=255) gcacaGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTaaa < 1:706/148‑1 (MQ=255) cacaGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAg < 2:1226525/149‑1 (MQ=255) cacaGTTAATCAAGCGAATGTCGACGGCAACTCTATTGCTACGATGCACCCGGTTTATATGGCTCGTCGTGACTTGCCCAAGATCTATGCTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCCCCCCCTTAAAg < 1:879036/149‑1 (MQ=255) aataGTTGATCACGCTTATCGCGACGGCCACTTGATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAg < 2:1220028/146‑1 (MQ=255) acaGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGt < 2:752162/149‑1 (MQ=255) cgctgatgaATCTAATGTCCACAGCCACTTTATTGCTATGATGCCCCCGGTTTATTTGGGTTGATGTGGCTTTTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATACCCCGCCCCTTATAGtca < 2:968361/146‑3 (MQ=255) aGTTGATCAAGCTAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGCTGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGa < 2:935405/149‑1 (MQ=255) aTCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTc < 2:78156/149‑1 (MQ=255) tCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCg > 2:346144/1‑149 (MQ=255) aaGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGCCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTAGcc > 1:178604/1‑149 (MQ=255) aGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCa < 1:65421/149‑1 (MQ=255) cGAATGTCGACGGCCAATTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAGACTGAATTTCGCCAGa > 1:813462/1‑149 (MQ=255) gAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGaa < 2:883221/149‑1 (MQ=255) gAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTAGGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGaa < 2:626269/149‑1 (MQ=255) aaTGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAAc < 2:918714/149‑1 (MQ=255) tCGGCGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCCATATCCGCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTtc < 1:596951/149‑1 (MQ=255) gCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTtccacacc < 2:665430/149‑7 (MQ=255) aCTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCACCagcagc > 2:317320/1‑149 (MQ=255) tgtttGCTATGATGCCTCCGGGTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATa < 2:3970/146‑1 (MQ=255) cTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAgg < 1:1105186/149‑1 (MQ=255) tatGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGAt < 1:345699/149‑1 (MQ=255) tatGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTGTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACACTTCCAGTGAAGAGAAGAGAt > 1:330529/1‑149 (MQ=255) ggTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACgg > 1:709162/1‑149 (MQ=255) ggTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACgg > 1:432423/1‑149 (MQ=255) ggTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACgg > 2:1040553/1‑149 (MQ=255) ttGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGcc > 1:897635/1‑149 (MQ=255) tGTCCAAGATCTATGTTTTTACCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAATAGATCCAGTGAACAGCAGAGTTACGGCCAGTGCGGCCaa < 1:955145/149‑1 (MQ=255) tGTCCAAGATCTATGTTTTTACCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCaa < 1:257553/149‑1 (MQ=255) tGTCCAAGATCTATGTTTTTACCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCaa < 1:219341/149‑1 (MQ=255) gttCCAAGCTCTAGGTTTTTTTCAATATCTTCTGGATGAATTTCTCACGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGGGAATTTCGCCAGGACCTTCATCAGCAGCATAACCAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCaa < 2:1228165/147‑1 (MQ=255) aTCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGtttttt > 1:104461/1‑149 (MQ=255) cTATGTTTTTATCAATACCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGt < 2:851306/149‑1 (MQ=255) tATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCATAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTc < 1:200735/149‑1 (MQ=255) tATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTc < 2:721424/149‑1 (MQ=255) tGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCt < 1:152558/149‑1 (MQ=255) ttttATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTa < 2:709514/149‑1 (MQ=255) tATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATACCCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCAGCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTTTTCAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAAc < 2:1181618/149‑1 (MQ=255) tATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAAc < 2:422002/149‑1 (MQ=255) tATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAAc < 2:1109420/149‑1 (MQ=255) | TACGCCAACTTTGGATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAATTTCACAAGGTGCTTCAATAACCTCCCCCTTAAAGTGAATTTCGCCAGAACCTTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAAC > NC_000913/752499‑752793 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |