| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,187,597 | C→T | 100% | P750L (CCG→CTG) | rpoC → | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,187,597 | 0 | C | T | 100.0% | 480.8 / NA | 142 | P750L (CCG→CTG) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (84/58); total (84/58) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
CAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGT > NC_000913/4187452‑4187742 | cAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGa > 2:870757/1‑149 (MQ=255) aaaCTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCGTAACGCAGCATCTACATGATGGCCGTCTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGAt < 1:1698747/149‑1 (MQ=255) aaaCTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGGATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGAt > 1:876621/1‑149 (MQ=255) aCTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATgg > 1:1265055/1‑149 (MQ=255) tGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCt > 1:1086955/1‑149 (MQ=255) aaCCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCca > 1:633645/1‑149 (MQ=255) aCCGTGATTACCCGGGACGGGCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTTGACAGCATCTACATGATGTCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCcat < 2:102428/149‑1 (MQ=255) ccGTGATTAACCGGGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCcatc < 2:927605/149‑1 (MQ=255) tAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCGGATGGCGAAGCTGGATGGCCCCATCATCGaaa > 2:489470/1‑149 (MQ=255) tAACCGTGACGGGTAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCGTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGGCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGaaa < 2:1495824/149‑1 (MQ=255) ccaggggcGGTCAGGAAGAGACTTTTGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACg < 2:1815834/142‑1 (MQ=255) aCCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACg < 2:651816/149‑1 (MQ=255) ccGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGc > 1:564456/1‑149 (MQ=255) cGTGACGGTCAGGAAGAGAAACAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGGTGGCATAGCTGGGTGGCTCCAGCATCGAAACGcc > 2:1272948/1‑149 (MQ=255) tGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACGTGATTGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCaa < 1:785415/149‑1 (MQ=255) cGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGACACGCCAATCa > 2:1490073/1‑149 (MQ=255) ggTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGGACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGGCTGATGTCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCAc > 2:555967/1‑149 (MQ=255) ggTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCCCCATCATCGAAACGCCAATCAc > 1:301419/1‑149 (MQ=255) tCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAGGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACcg > 2:1545511/1‑149 (MQ=255) cAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCGTGATCGAAACGCCAATCACcgc > 1:589587/1‑149 (MQ=255) agagAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACt > 2:1423189/1‑149 (MQ=255) aaGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTGCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGTTCCATCAGCGGAACGCGAATCACCGCGAACTTcgg > 2:1404005/1‑147 (MQ=255) aGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGt < 1:1564646/149‑1 (MQ=255) aGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCCCGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGt < 1:459781/149‑1 (MQ=255) gCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCGACGCGAACTTCCggt > 2:542053/1‑147 (MQ=255) gCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTACGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTg > 2:1157400/1‑149 (MQ=255) aGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGaa < 2:445251/149‑1 (MQ=255) aGGTTGCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGaa < 2:1157294/149‑1 (MQ=255) ggTTTCCTTCAACAGCATCTACCACATGGCCGTGTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAg < 1:1123831/149‑1 (MQ=255) ggTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGCGGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAg > 1:504623/1‑149 (MQ=255) ttCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTc > 1:1448699/1‑149 (MQ=255) cTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTAGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGGACTTCCGTGACGGTCTGa > 1:1619608/1‑149 (MQ=255) ttCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGaa < 1:1395629/149‑1 (MQ=255) ttCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGACAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGaa > 2:896978/1‑149 (MQ=255) tCAACAGCATCTACGTGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAAc < 2:1666272/149‑1 (MQ=255) tCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGGCTGCAc > 1:693505/1‑149 (MQ=255) cAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCCTCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCGGAACg > 2:110310/1‑149 (MQ=255) cAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGGTACGCGAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCCGAACg > 2:375831/1‑149 (MQ=255) cAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACg > 2:1330379/1‑149 (MQ=255) aaCAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCCCCGCGGACTTCCGTGAAGGTCCGCACGt > 2:49094/1‑149 (MQ=255) aCAGCATCGACAGGATGGCCGCCTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTa < 2:1086955/149‑1 (MQ=255) caccATCTACCTGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTAc < 2:483450/146‑1 (MQ=255) aGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACt > 2:89508/1‑149 (MQ=255) 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gatgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCa > 1:91009/1‑149 (MQ=255) tgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGAACTCCAtc > 2:811952/1‑149 (MQ=255) tgGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCGGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGGACTGCCGGGAAGGTCTGAACGTACGCCAGTACTTCAtc < 2:835875/149‑1 (MQ=255) ggCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCAtct < 1:870757/149‑1 (MQ=255) ggCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCAtct > 1:1751645/1‑149 (MQ=255) 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gcgcGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGc < 1:1651766/149‑1 (MQ=255) gcgcGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGc < 1:382791/149‑1 (MQ=255) gcgaGTGGTTCTGCGGCACGGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGACGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGc < 1:1418801/149‑1 (MQ=255) cgcgTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTGTGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCt < 1:797934/149‑1 (MQ=255) gcgTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCTGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTc < 1:687483/149‑1 (MQ=255) 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ttCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAg > 2:1021340/1‑149 (MQ=255) ttCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAg > 2:1440432/1‑149 (MQ=255) cTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGt < 1:1540188/149‑1 (MQ=255) gCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGACGGACTGAACGTACTCCAGTACTTCCTCTCCACCCACGGTGCTCGGCAAGGCCGGGc > 2:1356806/1‑149 (MQ=255) gCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTACATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGc < 1:1157400/149‑1 (MQ=255) gCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCCACATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGc < 1:606879/149‑1 (MQ=255) gTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATAGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTGCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCa > 1:1181703/1‑149 (MQ=255) gTCAGCTGGCTGGTATGCGGGGTCGGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCa < 2:219337/149‑1 (MQ=255) tCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGACACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCAc > 2:589565/1‑149 (MQ=255) tCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑Gccc > 1:466434/1‑147 (MQ=255) cTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCGTCATCGAAACGCCAATGCCCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTCCTTGATCCGCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑ACCCTGaa > 1:1373292/1‑149 (MQ=255) tGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCACTGaaaa > 1:246975/1‑149 (MQ=255) tATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACGTCCGCGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCACTGAAAACTGCGa < 1:867652/149‑1 (MQ=255) tGCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCGCCATCAGCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCACTGAAAACTGCGAAc > 2:616836/1‑149 (MQ=255) gCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCACTGAAAACTGCGAACt > 1:39414/1‑149 (MQ=255) gCGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATAGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGGGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGGCTGGCGGGTACC‑GCACTGACACCTGCGACCt > 2:767391/1‑149 (MQ=255) cGTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAGTCGCCGCGAGCTTCCGTGAAGGTCTGAAAGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTGGTCAAGGACTGGCGAATAAC‑GCACTGAACAGTGCGacatc > 2:807008/1‑145 (MQ=255) gTGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGCTACC‑GCACTGACAACTGCGAACTcc > 1:1674544/1‑149 (MQ=255) tGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCACTGAAAACTGCGAACTCCg < 1:1365643/149‑1 (MQ=255) tGGTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCCCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCACTGAAAACTGCGAACCCCg > 2:1378894/1‑149 (MQ=255) gTCTGATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCACTGAAAACTGCGAACTCCGGt > 2:861361/1‑149 (MQ=255) tCTGATGGCGCAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGACACC‑GCACTGAAAACTGCGAACTCCGGtt < 2:914618/149‑1 (MQ=255) gATGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTAcc > 1:898007/1‑149 (MQ=255) aTGGCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGCGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCCCGGTGCTCGTAAAGGGCTGACGGAGCCCAGCA‑TGACAACTTGGAACGCCGGTTACCt > 2:123179/1‑149 (MQ=255) gCGAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGAc > 2:1007614/1‑149 (MQ=255) gAAGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCACTGAAAACTGCGAGCTCCGGTTACCTGACtc > 2:402668/1‑149 (MQ=255) aGCTGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACtcgt > 1:936913/1‑149 (MQ=255) | CAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACC‑GCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGT > NC_000913/4187452‑4187742 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |