New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4240156 = | NA (NA) | 4 (0.050) | 4/280 | 12.6 | NA | noncoding (1/37 nt) | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
? | NC_000913 | 4240189 = | NA (NA) | noncoding (34/37 nt) | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
CAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACAC‑AAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGC > NC_000913/4240009‑4240302 | caAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGGTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGc > 2:1013025/1‑149 (MQ=255) caAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGc > 1:506457/1‑149 (MQ=255) aaTAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCgg > 2:859834/1‑149 (MQ=255) taaagattCATTTTTACCTCCTTTATCAGGTTACTTGTCATTTGGTCCAGAGGAACATTGTCTATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGAt < 2:936107/143‑1 (MQ=255) tAAGGCTTCATTTTTACCACCTGTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGAt < 2:1169307/149‑1 (MQ=255) aaGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATg < 1:70280/149‑1 (MQ=255) gttCATTTTTACCTCCTGTTTCAGGTTGCGTGTCATTTGGTCCAGAGGAACGTTGGCGATTTTTCGCGCATTGCTGGGGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGGATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGcgcc < 1:1111857/148‑1 (MQ=255) cTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGGATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGcgcc > 2:172444/1‑149 (MQ=255) cTTCATTCTTACCACCTTTCTCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGAGCATTGCTGGTGGCGGGGAATCACCAGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCCGATGcccc > 2:164462/1‑149 (MQ=255) ttCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTTTCTTGCCGGATGcgccg > 1:198710/1‑149 (MQ=255) ttCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGcgccg > 1:8571/1‑149 (MQ=255) cATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCgccgcc < 1:807821/149‑1 (MQ=255) aTTTTTACCACCTTAATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTACTGGTGGCTGGGAATCAACTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTATTGCCGGATGGCCCGCCa > 2:1156965/1‑149 (MQ=255) tttttGCCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAg > 2:869799/1‑149 (MQ=255) tttttACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAg < 1:1032089/149‑1 (MQ=255) ttttACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGGTGCGCCGCCAgg > 2:525699/1‑149 (MQ=255) tttACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGGACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATATGGTACGTGGGGGATCTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGgc > 1:989871/1‑149 (MQ=255) acctccTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTTCAGAGGAGCATTGTCGTTTTTTCGCGCATTGCTGGTGGATGGGATTTATCTGGATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGcgcg < 2:352/149‑1 (MQ=255) 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caccTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATCACCTGCCGTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGc > 1:105408/1‑149 (MQ=255) cTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTa > 1:1312695/1‑149 (MQ=255) cAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTGGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCCGGCGCGGCTTATCCGGc > 1:569871/1‑149 (MQ=255) aGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGcc < 1:843349/149‑1 (MQ=255) ttCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtag < 2:332747/149‑1 (MQ=255) tCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtggg > 2:1085514/1‑149 (MQ=255) tCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtagg < 2:873806/149‑1 (MQ=255) cctttGTGCCAGAGGAACAGTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtaggt < 2:1290752/147‑1 (MQ=255) cATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtaggt < 1:297586/149‑1 (MQ=255) aTTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtaggta > 1:1326987/1‑149 (MQ=255) tttGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtaggtct > 1:1104594/1‑147 (MQ=255) ccAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGGGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCCTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCgg < 2:1028067/149‑1 (MQ=255) agagGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCt > 1:281063/1‑149 (MQ=255) agagGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCt < 1:571857/149‑1 (MQ=255) agGAACTTTCTCTATTTTTCGCGCATTGCTGTTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCAGGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCttt < 1:267577/149‑1 (MQ=255) 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ttttCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTc < 1:187126/149‑1 (MQ=255) gcgcATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCCGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGGAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAAt > 1:1045354/1‑149 (MQ=255) cgcATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTCATTTCATATCTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATc < 1:319340/149‑1 (MQ=255) ggaTTGCGGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCGTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATcc < 2:1348744/147‑1 (MQ=255) aTTGCTGGGGGCTGGGAAGCACCTGAATGGGTGATTTGTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAg < 2:105408/149‑1 (MQ=255) 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cGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTGGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACAC‑AAAAAATATAGATCTCCGTCACAttttt < 2:989871/149‑1 (MQ=255) cGGCTTGGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTGATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACAC‑AAAAAATATAGATCTCCGTCACAttttt < 1:171905/149‑1 (MQ=255) tGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACAC‑AAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTta < 1:493409/149‑1 (MQ=255) tGGTGCGGTGTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACAC‑AAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTta < 2:1075623/149‑1 (MQ=255) gCGGATTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACAC‑AAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACa > 2:433732/1‑149 (MQ=255) cGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACAC‑AAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAg < 1:1093778/149‑1 (MQ=255) tgttGGCGGATGGGCCGCGAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTTCAAATCCAGGTTGAACAAAAAATAAAA‑AAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTc < 2:790107/147‑1 (MQ=255) tCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACAC‑AAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTc < 2:18237/149‑1 (MQ=255) tCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACAC‑AAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTc > 1:570645/1‑149 (MQ=255) gtggCCGGATGCGCCGCCAGGTGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGCGGAGGCGCGCTCCAAAGCCAGGTTGAACAAAACATACAC‑AAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCg < 2:64270/146‑1 (MQ=255) ttGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTATGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCg > 1:348595/1‑149 (MQ=255) ttGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTCAACAAAACATACAC‑AAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTCTACAGGAAGCTCGc > 1:918165/1‑149 (MQ=255) | CAAAATAAGGCTTCATTTTTACCACCTTTATCAGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACAC‑AAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGC > NC_000913/4240009‑4240302 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |