New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 4389174 = | 124 (1.010) | 4 (0.030) | 4/238 | NT | 3.3% | coding (197/3324 nt) | mscM | mechanosensitive channel protein, miniconductance |
? | NC_000913 | 4389211 = | 119 (1.030) | coding (160/3324 nt) | mscM | mechanosensitive channel protein, miniconductance | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
GCTGCTGACCTGGAGAATTTCCTGATTCAGCGCGTCGGTAGACATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATCGGGGGCCGTCGCGGCGT > NC_000913/4389026‑4389318 | atcacttttctgatggcctggtgcctcagttggggggcgtacgccgcgacggcccccgatagcaaacaaatcactcaggaactggagcaggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaa < 2:611406‑M1/1‑1 (MQ=255) atcacttttctgatggcctggtgcctcagttggggggcgtacgccgcgacggcccccgatagcaaacaaatcactcaggaactggagcaggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaa > 1:774794‑M1/149‑149 (MQ=255) atcacttttctgatggcctggtgcctcagttggggggcgtacgccgcgacggcccccgatagcaaacaaatcactcaggaactggagcaggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaa > 1:456471‑M1/149‑149 (MQ=255) tcacttttctgatggcctggtgcctcagttggggggcgtacgccgcgacggcccccgatagcaaacaaatcactcaggaactggagcaggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaAt < 1:226614‑M1/2‑1 (MQ=255) cacttttctgatggcctggtgcctcagttggggggcgtacgccgcgacggcccccgatagcaaacaaatcactcaggaactggagcaggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATg < 1:378890‑M1/3‑1 (MQ=255) acttttctgatggcctggtgcctcagttggggggcgtacgccgcgacggcccccgatagcaaacaaatcactcaggaactggagcaggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATgc < 2:461496‑M1/4‑1 (MQ=255) ttttctgatggcctggtgcctcagttggggggcgtacgccgcgacggcccccgatagcaaacaaatcactcaggaactggagcaggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATgcgc < 1:852895‑M1/6‑1 (MQ=255) ttttctgatggcctggtgcctcagttggggggcgtacgccgcgacggcccccgatagcaaacaaatcactcaggaactggagcaggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATgcgc < 4:59546‑M1/6‑1 (MQ=255) ccTGGAGAATTTCCTGATTCAGCGCGTCGGTAGACATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCa > 4:1045325/1‑149 (MQ=255) cTGGAGAATTTCCTGATTCAGCGCGTCGGTAGACATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGTAGAGTAGCGGTGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCaa > 4:706515/1‑149 (MQ=255) tGGAGAATTTCCTGATTCAGCGCGTCGGTAGACATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAg < 4:575645/149‑1 (MQ=255) tGGAGAATTTCCTGATTCAGCGCGTCGGTAGACATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAg > 1:764539/1‑149 (MQ=255) tGGAGAATTTCCTGATTCAGCGCGTCGGTAGACATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAg < 4:830299/149‑1 (MQ=255) tGGAGAATTTCCTGATTCAGCGCGTCGGTAGACATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACACATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGCTATTGTTTGATGCGCTCAAg > 3:811586/1‑149 (MQ=255) aTTTCCTGATTCAGCGCGTCGGTAGACATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAAcc < 3:593956/149‑1 (MQ=255) cTGATTCAGCGCGTCGGTAGACATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTc < 3:23791/149‑1 (MQ=255) cTGATTCAGCGCGTCGGTAGACATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTc < 2:519202/149‑1 (MQ=255) gATTCAGCGCGTCGGTAGACATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGt > 3:750250/1‑149 (MQ=255) 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ggggcgtacgccgcgacggcccccgatagcaaacaaatcactcaggaactggagcaggcaaaagcggcgaaacccgcacagccggaagtcgtagaggcgctccagtctgccttaaATgcgc < 3:738209‑M1/6‑1 (MQ=255) tAGACATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCAttt > 4:1015253/1‑149 (MQ=255) gACATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTaa < 1:15178/149‑1 (MQ=255) aCATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAg > 1:220683/1‑149 (MQ=255) aTTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGc > 3:871430/1‑149 (MQ=255) 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aTTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTACCTGAGTGAtttgtt < 4:750250/149‑1 (MQ=255) tATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGAtttgtttg < 4:1054146/149‑1 (MQ=255) tATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGAtttgtttg < 2:159051/149‑1 (MQ=255) tATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGAtttgtttg < 3:154901/149‑1 (MQ=255) tCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGcc < 2:150252/120‑1 (MQ=255) tCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGcc > 1:150252/1‑120 (MQ=255) gATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTAt > 1:929840/1‑149 (MQ=255) aTAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATc > 3:549708/1‑149 (MQ=255) aCTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATCggg < 4:647058/149‑1 (MQ=255) aCTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATCggg < 1:161728/149‑1 (MQ=255) gCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATCGGGGGcc < 1:543241/149‑1 (MQ=255) tGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATCGGGGGCCGt > 3:1128556/1‑149 (MQ=255) tGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATCGGGGGCCGt > 3:777977/1‑149 (MQ=255) tGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATCGGGGGCCGt > 2:852895/1‑149 (MQ=255) atatTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATCGGGGGCCGTcg > 3:963344/1‑149 (MQ=255) atatTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATCGGGGGCCGTcg > 2:212011/1‑149 (MQ=255) atTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATCGGGGGCCGTcgcg > 2:1023824/1‑149 (MQ=255) atTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATCGGGGGCCGTcgcg > 1:73401/1‑149 (MQ=255) gTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATCGGGGGCCGTCgcggcg > 1:855182/1‑149 (MQ=255) tttGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGGTTTGTTTGCTATCGGGGGCCGTCGCGGCGt > 1:611406/1‑149 (MQ=255) tttGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGAtttgttt > 2:929751/1‑126 (MQ=255) tttGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATCGGGGGCCGTCGCGGCGt > 3:1078829/1‑149 (MQ=255) | GCTGCTGACCTGGAGAATTTCCTGATTCAGCGCGTCGGTAGACATTCCCGGCGACACGCTGCGCGGCTCGTCACGCATGTTGTTTAATTGTGCGCGCAGAGTAGCGGAGAGTTTCGGATAATTATCGATAACTTGCTGATATTGTTTGATGCGCTCAAGGGAACCTTTTCGTTCCTCAAGCGCATTTAAGGCAGACTGGAGCGCCTCTACGACTTCCGGCTGTGCGGGTTTCGCCGCTTTTGCCTGCTCCAGTTCCTGAGTGATTTGTTTGCTATCGGGGGCCGTCGCGGCGT > NC_000913/4389026‑4389318 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |