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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,009,005 | 0 | A | C | 5.2% | 526.3 / 17.1 | 148 | S19A (TCG→GCG) | rhtB | homoserine, homoserine lactone and S‑methyl‑methionine efflux pump |
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Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CGGGAAAATAGCGTCCCCAACCCCACGCCAACCAGCACAATATGAATCGCCAGTCCGGTCTGAAGCCCAGCAATAGACGCCACCGCGCCGCGATAACCGTGGTTGAGCGAGGTGGTCATAGTGTTGATTGCACCAGAGCCTGGCGACAGGCTTAAAATGATCGATGTCAGCAGGTAGGCAAACCACCATTCTAAGGTCATGATGAACTCCCGGTGTGTCTATTTTTGTGCCACAATACGCTACTGTCGCAGCGTTGTGTCAGGCACGCTAAAAAAAACGATTTTACGTGGTTT > NC_000913/4008860‑4009152 | cGGGAAAATAGCGTCCCCAACCCCACGCCAACCAGCACAATATGAATCGCCAGTCCGGTCTGAAGCCCAGCAATAGACGCCACCGCGCCGCGATAACCGTGGTTGAGCGAGGTGGTCATAGTGTTGATTGCACCAGAGCCTGGCGACAg < 2:623449/149‑1 (MQ=255) gggAAAATAGCGTCCCCAACCCCACGCCAACCAGCACAATATGAATCGCCAGTCCGGTCTGAAGCCCAGCAATAGACGCCACCGCGCCGCGATAACCGTGGTTGAGCGAGGTGGTCATAGTGTTGATTGCACCAGAGCCTGGCGACAgg > 3:1134598/1‑149 (MQ=255) aaaTAGCGTCCCCAACCCCACGCCAACCAGCACAATATGAATCGCCAGTCCGGTCTGAAGCCCAGCAATAGACGCCACCGCGCCGCGATAACCGTGGTTGAGCGAGGTGGTCATAGTGTTGATTGCACCAGAGCCTGGCGACAg > 4:890691/1‑144 (MQ=255) aaaTAGCGTCCCCAACCCCACGCCAACCAGCACAATATGAATCGCCAGTCCGGTCTGAAGCCCAGCAATAGACGCCACCGCGCCGCGATAACCGTGGTTGAGCGAGGTGGTCATAGTGTTGATTGCACCAGAGCCTGGCGACAg < 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gTCCCCAACCCCACGCCAACCAGCACAATATGAATCGCCAGTCCGGTCTGAAGCCCAGCAATAGACGCCACCGCGCCGCGATAACCGTGGTTGAGCGAGGTGGTCATAGTGTTGATTGCACCAGAGCCTGGCGACAGGCTTAAAATGAt > 1:519913/1‑149 (MQ=255) gTCCCCAACCCCACGCCAACCAGCACAATATGAATCGCCAGTCCGGTCTGAAGCCCAGCAATAGACGCCACCGCGCCGCGATAACCGTGGTTGAGCGAGGTGGTCATAGTGTTGATTGCACCAGAGCCTGGCGACAGGCTTAAAATGAt < 4:811120/149‑1 (MQ=255) tCCCCAACCCCACGCCAACCAGCACAATATGAATCGCCAGTCCGGTCTGAAGCCCAGCAATAGACGCCACCGCGCCGCGATAACCGTGGTTGAGCGAGGTGGTCATAGTGTTGATTGCACCAGAGCCTGGCGACAGGCTTAAAATGATc < 4:365987/149‑1 (MQ=255) cccAACCCCACGCCAACCAGCACAATATGAATCGCCAGTCCGGTCTGAAGCCCAGCAATAGACGCCACCGCGCCGCGATAACCGTGGTTGAGCGAGGTGGTCATAGTGTTGATTGCACCAGAGCCTGGCGACAGGCTTAAAATGATCGa > 2:818950/1‑149 (MQ=255) ccAACCCCACGCCAACCAGCACAATATGAATCGCCAGTCCGGTCTGAAGCCCAGCAATAGACGCCACCGCGCCGCGATAACCGTGGTTGAGCGAGGTGGTCATAGTGTTGATTGCACCAGAGCCTGGCGACAGGCTTAAAATGATCGAt > 4:699434/1‑149 (MQ=255) 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ttaagCCTGTCGCCAGGCTTAAAATGATCGATGTCAGCAGGTAGGCAAACCACCATTCTAAGGTCATGATGAACTCCCGGTGTGTCTATTTTtg < 4:731327/91‑1 (MQ=255) cAGAGCCTGGCGACAGGCTTAAAATGATCGATGTCAGCAGGTAGGCAAACCACCATTCTAAGGTCATGATGAACTCCCGGTGTGTCTATTTTTGTGCCACAATACGCTACTGTCGCAGCGTTGTGTCAGGCACGCTAAAAAAAACGAtt > 1:496247/1‑149 (MQ=255) cAGAGCCTGGCGACAGGCTTAAAATGATCGATGTCAGCAGGTAGGCAAACCACCATTCTAAGGTCATGATGAACTCCCGGTGTGTCTATTTTTGTGCCACAATACGCTACTGTCGCAGCGTTGTGTCAGGCACGCTAAAAAAAACGAtt > 1:801961/1‑149 (MQ=255) gagCCTGGCGACAGGCTTAAAATGATCGATGTCAGCAGGTAGGCAAACCACCATTCTAAGGTCATGATGAACTCCCGGTGTGTCTATTTTTGTGCCACAATACGCTACTGTCGCAGCGtt < 1:692353/120‑1 (MQ=255) gagCCTGGCGACAGGCTTAAAATGATCGATGTCAGCAGGTAGGCAAACCACCATTCTAAGGTCATGATGAACTCCCGGTGTGTCTATTTTTGTGCCACAATACGCTACTGTCGCAGCGtt > 2:692353/1‑120 (MQ=255) agCCTGTCGCCAGGCTTAAAATGATCGATGTCAGCAGGTAGGCAAACCACCATTCTAAGGTCATGATGAACTCCCGgtgt < 1:585398/80‑1 (MQ=255) agCCTGTCGCCAGGCTTAAAATGATCGATGTCAGCAGGTAGGCAAACCACCATTCTAAGGTCATGATGAACTCCCGgtgt > 2:585398/1‑80 (MQ=255) tGGCGACAGGCTTAAAATGATCGATGTCAGCAGGTAGGCAAACCACCATTCTAAGGTCATGATGAACTCCCGGTGTGTCTATTTTTGTGCCACAATACGCTACTGTCGCAGCGTTGTGTCAGGCACGCTAAAAAAAACGATTTTACGTg < 4:606149/149‑1 (MQ=255) gACAGGCTTAAAATGATCGATGTCAGCAGGTAGGCAAACCACCATTCTAAGGTCATGATGAACTCCCGGTGTGTCTATTTTTGTGCCACAATACGCTACTGTCGCAGCGTTGTGTCAGGCACGCTAAAAAAAACGATTTTACGTGGttt > 1:496322/1‑149 (MQ=255) gACAGGCTTAAAATGATCGATGTCAGCAGGTAGGCAAACCACCATTCTAAGGTCATGATGAACTCCCGGTGTGTCTATTTTTGTGCCACAATACGCTACTGTCGCAGCGTTGTGTCAGGCACGCTAAAAAAAACGATTTTACGTGGttt < 3:997030/149‑1 (MQ=255) | CGGGAAAATAGCGTCCCCAACCCCACGCCAACCAGCACAATATGAATCGCCAGTCCGGTCTGAAGCCCAGCAATAGACGCCACCGCGCCGCGATAACCGTGGTTGAGCGAGGTGGTCATAGTGTTGATTGCACCAGAGCCTGGCGACAGGCTTAAAATGATCGATGTCAGCAGGTAGGCAAACCACCATTCTAAGGTCATGATGAACTCCCGGTGTGTCTATTTTTGTGCCACAATACGCTACTGTCGCAGCGTTGTGTCAGGCACGCTAAAAAAAACGATTTTACGTGGTTT > NC_000913/4008860‑4009152 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |