| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3829478 | 287 (2.980) | 6 (0.060) | 5/254 | NT | 2.0% | coding (534/1392 nt) | xanP | xanthine permease |
| ? | NC_000913 | = 3829513 | 302 (3.240) | coding (569/1392 nt) | xanP | xanthine permease | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 352 total aligned reads displayed.
TGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTACGCGTGGCCTCACTGGTAATTG > NC_000913/3829330‑3829626 | tgGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTA < 1:638289‑M1/149‑1 (MQ=255) gcggcTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAAc < 3:164500/149‑1 (MQ=255) gcTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTc > 4:645754/1‑149 (MQ=255) tttGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAAc > 2:200518/1‑144 (MQ=255) tttGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCa > 1:104448/1‑149 (MQ=255) tCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTggc < 2:254313/149‑1 (MQ=255) gCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTggcggc > 4:582361/1‑149 (MQ=255) cACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGgcggcg < 3:478769/149‑1 (MQ=255) aCGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGcggcgg > 2:185949/1‑149 (MQ=255) aCGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGcggcgg < 3:469003/149‑1 (MQ=255) aCGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGcggcgg < 1:794194/149‑1 (MQ=255) cGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGt < 3:63575/149‑1 (MQ=255) gTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGtt > 3:616442/1‑149 (MQ=255) gTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGtt < 3:107799/149‑1 (MQ=255) tGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTAc < 2:345360/149‑1 (MQ=255) gATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACg > 4:831603/1‑149 (MQ=255) gCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAg > 2:580126/1‑149 (MQ=255) tGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGcc < 4:433715/149‑1 (MQ=255) ggCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCa > 1:485628/1‑149 (MQ=255) aaGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCCTTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAacgtccattggctgcgtaaccgccgccaatg < 1:701247‑M1/149‑32 (MQ=255) aaGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGa < 1:118183/149‑1 (MQ=255) tGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTGTTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATgagaga < 4:67538/149‑1 (MQ=255) tGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGa < 3:753066/149‑1 (MQ=255) 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aCCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGAtaa < 2:161353‑M2/149‑4 (MQ=255) ccGAGATGGTGATCTCCCGCGTCCTGCATCTGACGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGCTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGAtaac > 3:530190‑M2/1‑145 (MQ=255) gagaTGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAtcgctcatggctgcgtaaccgccgccaatggacgttaaccc < 3:238493‑M1/149‑42 (MQ=255) agaTGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAtcgctcatggctgcgtaaccgccgccaatggacgttaaccca < 3:441856‑M1/149‑43 (MQ=255) ggTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCg > 1:396777/1‑149 (MQ=255) 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(MQ=255) gatgatTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAAc > 2:308911/1‑149 (MQ=255) gatgatTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAAc > 4:141722/1‑149 (MQ=255) gCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCcttac < 2:656675/149‑1 (MQ=255) tGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCcttactta > 4:377548/1‑149 (MQ=255) tCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTAcg > 2:672442/1‑149 (MQ=255) cGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTAcgc > 1:13043/1‑149 (MQ=255) cGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTAcgc < 4:443413/149‑1 (MQ=255) gCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTAcgcg > 1:14597/1‑149 (MQ=255) gCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTAcgcg > 2:292006/1‑149 (MQ=255) cTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTCAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTACGCGt < 3:509355/149‑1 (MQ=255) aaTTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGAtaacccaacctgaattagcgacaggccgataatcatcaccacaacgcca > 2:802409‑M2/1‑51 (MQ=255) aaTTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGAtaacccaacctgaattagcgacaggccgataatcatcaccacaacgcca < 1:802409‑M2/100‑50 (MQ=255) aTTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTACGCGTGGc > 2:641803/1‑149 (MQ=255) ttCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTACGCGTGGcc > 1:162735/1‑149 (MQ=255) aGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTACGCGTGGCCTCa > 2:360103/1‑149 (MQ=255) ggTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTACGCGTGGCCTCAc < 1:342708/149‑1 (MQ=255) ggTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTACGCGTGGCCTCACTGGTa > 2:711838/1‑149 (MQ=255) gTTAtcgctcatggctgcgtaaccgccgccaatggacgttaacccaacctgaattagcgacaggccgataatcatcaccacaacgccagaaaccagcggcgtaataatgcggcgcgccagatgcagaacgcgggagatcaccatctcgg > 4:768554‑M1/1‑4 (MQ=255) ttAtcgctcatggctgcgtaaccgccgccaatggacgttaacccaacctgaattagcgacaggccgataatcatcaccacaacgccagaaaccagcggcgtaataatgcggcgcgccagatgcagaacgcgggagatcaccatctcggt < 2:522744‑M1/149‑147 (MQ=255) ttAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATc < 3:128140/99‑1 (MQ=255) ttAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATc > 4:128140/1‑99 (MQ=255) ttAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTACGCGTGGCCTCACTGGTAAt > 1:368920/1‑149 (MQ=255) atcgctcatggctgcgtaaccgccgccaatggacgttaacccaacctgaattagcgacaggccgataatcatcaccacaacgcca < 2:475597‑M1/85‑85 (MQ=255) atcgctcatggctgcgtaaccgccgccaatggacgttaacccaacctgaattagcgacaggccgataatcatcaccacaacgcca > 1:475597‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGGCGGCTTTGTTCGGCACGTTGATGCTGGCAAGTTGCACCGAGATGGTGATCTCCCGCGTTCTGCATCTGGCGCGCCGCATTATTACGCCGCTGGTTTCTGGCGTTGTGGTGATGATTATCGGCCTGTCGCTAATTCAGGTTGGGTTAACGTCCATTGGCGGCGGTTACGCAGCCATGAGCGATAACACCTTCGGCGCACCGAAAAATCTGCTGCTGGCAGGCGTGGTCTTAGCCTTAATTATCCTGCTTAACCGTCAACGTAACCCTTACTTACGCGTGGCCTCACTGGTAATTG > NC_000913/3829330‑3829626 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |