| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 4263934 = | 92 (0.960) | 4 (0.040) | 4/252 | NT | 4.6% | coding (298/984 nt) | qorA | quinone oxidoreductase, NADPH‑dependent |
| ? | NC_000913 | 4263974 = | 78 (0.840) | coding (258/984 nt) | qorA | quinone oxidoreductase, NADPH‑dependent | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
GCTGCGTGGAACAGGAACTGTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGG > NC_000913/4263786‑4264076 | gCTGCGTGGAACAGGAACTGTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGtt < 1:555447/149‑1 (MQ=255) tGCGTGGAACAGGAACTGTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTAt < 2:785404/149‑1 (MQ=255) gCGTGGAACAGGAACTGTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATg < 3:522347/149‑1 (MQ=255) ggcatcaattttatcgacacatatatccgcagcggcctttacccgccgccatcgctacccagcggattaggcaccgaagcagcaggcatcgtgagtaaagtcggcagtggtgtaaagcatattaaggcaggcgatcgtgtagtcTATGc > 2:692303‑M1/145‑149 (MQ=255) ggcatcaattttatcgacacatatatccgcagcggcctttacccgccgccatcgctacccagcggattaggcaccgaagcagcaggcatcgtgagtaaagtcggcagtggtgtaaagcatattaaggcaggcgatcgtgtagtcTATGc > 2:48665‑M1/145‑149 (MQ=255) ggcatcaattttatcgacacatatatccgcagcggcctttacccgccgccatcgctacccagcggattaggcaccgaagcagcaggcatcgtgagtaaagtcggcagtggtgtaaagcatattaaggcaggcgatcgtgtagtcTATGc > 3:486232‑M1/145‑149 (MQ=255) ggcatcaattttatcgacacatatatccgcagcggcctttacccgccgccatcgctacccagcggattaggcaccgaagcagcaggcatcgtgagtaaagtcggcagtggtgtaaagcatattaaggcaggcgatcgtgtagtcTATGc > 1:262663‑M1/145‑149 (MQ=255) tGGAACAGGAACTGTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGcac > 1:618922/1‑149 (MQ=255) ggAACAGGAACTGTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGcaca > 2:523020/1‑149 (MQ=255) ggAACAGGAACTGTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGcaca > 2:714620/1‑149 (MQ=255) aaCAGGAACTGTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACaga < 4:198799/149‑1 (MQ=255) aCAGGAACTGTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACagag < 1:348104/149‑1 (MQ=255) aGGAACTGTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCt > 2:731585/1‑149 (MQ=255) aaCTGTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTa > 4:442185/1‑149 (MQ=255) tGTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAgc < 4:765393/149‑1 (MQ=255) gTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAgcg > 1:646833/1‑149 (MQ=255) ttCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAgcgc < 4:607855/149‑1 (MQ=255) ttCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAgcgc < 1:774601/149‑1 (MQ=255) ttCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAgcgc > 1:742690/1‑149 (MQ=255) 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gcagcaGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGa > 4:624058/1‑149 (MQ=255) cagcagATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGAt < 2:547544/149‑1 (MQ=255) agcagATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATc < 2:58591/149‑1 (MQ=255) cagATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGa < 3:201125/126‑1 (MQ=255) cagATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGa > 4:201125/1‑126 (MQ=255) cagATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCgc > 2:825610/1‑149 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aaaaGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCctg > 3:683463/1‑149 (MQ=255) aaaGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCctgc > 3:108303/1‑149 (MQ=255) aaaGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACACAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCctgc > 1:567124/1‑149 (MQ=255) ttGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCg > 4:378208/1‑149 (MQ=255) cGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGc < 3:694195/149‑1 (MQ=255) 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agAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATcc > 4:324317/1‑149 (MQ=255) aaTCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGc < 2:668593/149‑1 (MQ=255) aTCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCt < 4:525421/149‑1 (MQ=255) aTCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCt < 1:370493/149‑1 (MQ=255) ccgcTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGt < 1:148565/149‑1 (MQ=255) cTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGc > 1:425535/1‑149 (MQ=255) gCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATggcgg < 4:369034/149‑1 (MQ=255) gCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATggcgg > 1:497124/1‑149 (MQ=255) gCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATggcgg > 4:311226/1‑149 (MQ=255) ataatGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGcggcgg < 2:718557/149‑1 (MQ=255) taatGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCggg > 4:438103/1‑149 (MQ=255) | GCTGCGTGGAACAGGAACTGTTCATCGGGTTTAATTTCATAGGTTTTGCGCAGCAGATAATAAACCGTTAAGCCTTTCAGGAAGGATGCCGCAGCTTGCTCAAAAGAAATTGCCGCAGGCAGAATCGCCGCTTTATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGG > NC_000913/4263786‑4264076 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |