New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 732312 = | 110 (0.900) | 11 (0.090) | 4/512 | 11.3 | 9.2% | coding (2730/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
? | NC_000913 | = 3621805 | NA (NA) | coding (2614/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCGGTGGGTGCGCTCATCATCCGTGCGGATAACCCCTTCCGGGATGAGGTCGGTTTTCTCTGTCAGCCTGCCGTGACGGTCATACCGGTAAAGATAGTGCGCGTCACGGGCGATACGGTTATCCGGCCACATGCTGAGGGCGCTGTCCGGGTGCAGCTCCGGGTCGGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/732524‑732312 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTA‑ACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCGGTATACAGCGGTTCGCC < NC_000913/3621805‑3621531 GTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCGGTGAGTCCGCTCATCATCCGTGCGGATAACCCCTTCCGGGATGAGGTCGGTTTTCTCTGTCAGCCTGCCGTGACGGTCATACCGGTAAAGATAGTGCGCGTCACGGGCGATACGGTTATCCGGCCACATGCTGAGGGTGCTGTCCGGGTGCAGCTCCGGGTCGGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAG > 1:390001/1‑274 CGGAGAACCCCGGCGGGGAGGGGGTGGGTTTGGTCGGTCGGCCGGCCGTGACGGTCATACCGGTAAAGGAAGTGCGCGTAACGGGCGATACGGTTATCCGGCCACATGCTGAGGGTGCTGTCCGGGTGCAGCTCCGGGTCGGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCG < 3:390001/275‑1 tggtgcgttatCTCCGGGGGGGGGGCGGGCGGGGGCTGCGGAGGAGTTGGCCGTTGCCGTGCCGGGGGGATGCGCGGTCAGACAGCAGGGTGTTCAGGGGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCAGAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTA‑ACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGG < 4:472880/264‑1 gtaggcgtAGCTCCGTGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTA‑ACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCT < 2:149883/268‑1 gtgcggtgaCTCCGGGTGCGGCTCGGTCGTCGGATGCGGATGTGTTCGCCGTGGTCTTTCCAGGTTTAATCGCGGTCAGACAGTGGGCTGTGCAGGTGCTGGCGCTGTCACGGTCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTA‑ACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCT < 4:608358/266‑1 gcgctcgagacgCGGGTCGGGCGCGGGCTGTTGGTGCGGCGGATTTCTCCGTGGTCGTTCCGGGTGTGACCGGGGTCAGACAGCAGGCGGTTCGGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATATGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTA‑ACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCT < 4:130910/263‑1 gctggagtTCCGGGTTGGGTGGTGGCGGCGGATGCGGATGGGTTGGCCGTTGTCGTTCCAGGTGGAAGCGCGGTCAGACAGCAGGCGGTTGAGGTGCTGGCTCTGTAACGGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTA‑ACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTC < 4:103803/268‑1 ctgtggcggCGGGTGGGGCGCGGGGTGGTGGGGGGGCTGAGTTCGCGGTTGTCGTTCCAGGCGTAATCGGGGTCAGACAGCAGGCGGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTA‑ACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTC < 4:538826/266‑1 ggtacgcctGGTCGGGTCCGTGCTTCTGATGCGGTTGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTGATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTACCTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTA‑ACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCG < 2:296748/266‑1 ggaaccgCGGGTAGGGCGCGGGCTGTTGATGGGGGTGGGTTCGCCGTTGTCGTTCCCGGGGTGATGGCGGTCAGAGAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACGGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTA‑ACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCG < 3:502980/268‑1 taaCTCCGGGTCGGGGGCGGGCTGATGATGCGGAGGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGATGTAGTCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTA‑ACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCG < 3:522316/271‑1 GGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTCTAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCCCCAGCGGTGTGTCGCCGCGGTTCATCCCTGCCAGGGATGCCGC‑GACGTTGGTCAGACATTCCCCGTCGGGCACGCTGTCGGGGTTACGGCGGTTt > 3:81628/1‑274 GGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGGGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGCGTTTCATGCCTGCACGGTA‑ACCGCTGCCGTAGGCGAGCCATTCCCCGGCGGCCCTGCGGTCCGGTGTCCGGCGGTgc > 4:362979/1‑273 GCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTA‑ACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCGGTATACAGCGGTTCG > 1:391153/1‑275 CGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTAC < 4:416968/174‑1 CGCGGGCGGCTGATGCGGATGAGGTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTA‑ACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCGGTATACAGCGGTTCGCC < 2:220991/276‑1 GTCCGCGTGTAGTGCACCAGCCGGTGCTGACTGTCGTAATGGTACCGGTGGGTGCGCTCATCATCCGTGCGGATAACCCCTTCCGGGATGAGGTCGGTTTTCTCTGTCAGCCTGCCGTGACGGTCATACCGGTAAAGATAGTGCGCGTCACGGGCGATACGGTTATCCGGCCACATGCTGAGGGCGCTGTCCGGGTGCAGCTCCGGGTCGGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/732524‑732312 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTA‑ACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCGGTATACAGCGGTTCGCC < NC_000913/3621805‑3621531 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |