| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4162515 | 141 (1.150) | 6 (0.050) | 5/506 | 10.6 | 4.1% | coding (756/1101 nt) | trmA | tRNA m(5)U54 methyltransferase, SAM‑dependent; tmRNA m(5)U341 methyltransferase |
| ? | NC_000913 | = 4162526 | 140 (1.170) | coding (745/1101 nt) | trmA | tRNA m(5)U54 methyltransferase, SAM‑dependent; tmRNA m(5)U341 methyltransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
CGTTCGACCTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATA‑CGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCGATGTTGTATTGCGCAGCAGCAACCGACGGCTTAGCGATTTCGGTGGCTAATACCCGATCAAAATTACGCGCCAGCGCTAATGAAAAGTTACCGTTGCCGCAGTACAGCTCCAGTAAATCGCCTTTTGAGCCTTTGGTTACGTCCAGCGCCCATTCCAGCATCTGAATATTCATCGCCGCGTTCGGCTGGGTAAAGCTGTTTTCTACCTGACGGTAGATCATCTCTTTCCCTGCGACCGGCAGACGTTCATCGATGTAATCCTGATCCAGCTCG > NC_000913/4162240‑4162788 | cGTTCGACCTTGGGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATA‑CGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCg < 2:115125/276‑1 (MQ=255) ccTTGTGCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATA‑CGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCTCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTTTTCTTCCGCCATCCGACTAATTTGTACGTTATCAATTTGGTTAGCTGCGAtgttt > 1:624550/1‑274 (MQ=255) tgtgCGTCTGGCTTAATGTTTCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATA‑CGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCGATGTTGTa > 1:252020/1‑274 (MQ=255) cttctatactAATGTTTCGAGATTCTTGGATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATA‑CGCGGATACCCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTTTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCGATGTTGTATTgcg < 3:493562/266‑1 (MQ=255) tcTTACTGTTTCCAGATTCTTTCATAACGTGTCCGGGTTACAGGAGATGTACATAATA‑CGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTGTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAGATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGAGCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCGATGTTGTATTGCgcagcag < 3:135149/274‑1 (MQ=255) tCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATA‑CGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAACATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCCCACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAAAATGGTTAGCTGCTATGTTGTATTTCGCCGCTGCACCAGACGGc > 4:513687/1‑276 (MQ=255) tCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATA‑CGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTACATTCTTCTGCCGCCATACGACTAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCGATGTTGTATTGCGCAGCAGCAACCGACgg > 3:246304/1‑275 (MQ=255) tCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATA‑CGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGACTAATTTGTACGTTATTAATATGTTTAGCTGAGTTGTTGTATTGCtcagatagccatcttga > 1:358032/1‑262 (MQ=255) tCCAGATTCTTGCATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATA‑CGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCGATGTTGTATTGCGCAGCAGCAACCGACgg > 1:206445/1‑275 (MQ=255) tGCATAACGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATA‑CGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGGTAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCGAGGTTGTATTGCTCAGCAGCAACCGAGGGCTGAGCGAt > 1:541344/1‑274 (MQ=255) 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cGTTTCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATA‑CGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCCGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGACTAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCGATGTTGTATTGCGCAGCAGCAACCGACGGCTTAGCGATTTCGGTGGc > 2:275540/1‑276 (MQ=255) tCCGGGTTACAGGAGATGTACAAAATA‑CGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCGAtgt > 3:277006/1‑229 (MQ=255) ggTTACAGGAGATGTACAAAATA‑CGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCGATGTTGTa < 1:277006/229‑1 (MQ=255) ggAGATGTACAAAATA‑CGCGGATACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCGATGTTGTATTGCGCAGCAGCAACCGACGGCTTAGCGATTTCGGTGGCTAATACCCGATCaa < 3:45988/275‑1 (MQ=255) cAAAATG‑CTCGGAGACGCCTTCACCAGTTTCTCGGTTTCACGGTCCAGACCGCTTAGCTGCGTGTTGACAAAAATGTGTTCGCACTGATAACTCTGTAAGTCGGTCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCAGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCGATGTGGTATTGCGCAGCAGCAACCGACGGCTTAGCGATTTCGGTGGCTAATACCCGATCAAAATTACgcgc < 4:538148/276‑1 (MQ=255) cAAAATACCGCGG‑TACGCCGGCACCATTTTTTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCCGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTAACAATATGGTTAGCTGCGATGTTGTATTGCGCAGCAGCAACCGACGGCTTAGCGATTTCGGTGGCTAATACCCGATCAAAATTACgcgc < 4:275540/276‑1 (MQ=255) taccccgtcatcATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGCCCGTGGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCGATGTTGTATTGCGCAGCAGCAACCGACGGCTTAGCGATTTCGGTGGCTAATACCCGATCAAAATTACGCGCCAGCGCTAATGaa < 4:438059/265‑1 (MQ=255) tACGCCTGCACCATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCCATATGGTTATCTGCGATGTTGTATTGAGCAGCAGCAACCGACGGCTTAGCGATTTCGGTTGCTATATCACGATCACAATTACGCGCCacgtccaatga > 4:182863/1‑265 (MQ=255) cATTTTCTCGGTTTCACTGTCCAGACCGCTGCGCGGAGGGTCGACAAAAATGGTTTCGCACTGATAACTCTTTAAGTCGATCCCTTGCAGGCGGTTAAACTCGCGCACACCATTCATCGCCTGAGTAAATTCTTCTGCCGCCATACGAATAATTTGTACGTTATCAATATGGTTAGCTGCGATGTTGTATTGCGCAGCAGCAACCGACGGCTTAGCGATTTCGGTGGCTAATACCCGATCAAAATTACGCGCCAGCGCTAATGAAAAGTTACCGt < 1:513515/275‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |