New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 2794419 = | 104 (0.870) | coding (167/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CGGAGCCGCTCTCCGGCAAAAAGAATCAATAACAATTATACGCGTGACCCGGCGCGGGAAATGTCGGGGCGCTCTCCCAAGTGACACACTTTCGAGAGGATTCAGGATGGGGCAATCATCGCAACCACATGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCA‑GCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTAT‑CTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGTTTTCCACCTATGCCGATAAAGCCATTGGTCGCTGGGCGGGCTATACC‑ATCGGCTGGTTGTACTGGTGGTTTTGGGTACTGGTTATCCCGCTGGAAGCCAACATCGCCGCCATGATCCTGCACTCATGGGTTCCAGGCATTCCCATCTGGTTATTTTCCCTCGTCATTACCCTCGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCG > NC_000913/2794147‑2794685 | cGGGGCCGCGCTACGGAAAAAAGAATAAAAAAAAATGATAGCCGTGACCAGGGACGGGAAATGTCGGGGCGCTCTCCCAAGTGACACACTTTCGGGGGGATTCAGGATGGGGCAATCATCGCAACCACATGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCGGCGCAAGTCTGTTTGTCGGTTCCA‑GCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTAT‑CTGTTCGCCGGGCTAc < 4:522091/275‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |