| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3764228 | 0 (0.000) | 10 (0.010) | 8/248 | NT | 100% | coding (2046/4134 nt) | rhsA | Rhs protein with putative toxin 55 domain; putative polysaccharide synthesis/export protein; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3764260 | NA (NA) | coding (2078/4134 nt) | rhsA | Rhs protein with putative toxin 55 domain; putative polysaccharide synthesis/export protein; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
ACGCGCAGTATGGAATACGATGCTGCCGGACGGGTCATCCGCCTGACCAGTGAAAACGGCAGCCACACCACCTTCCGTTACGATGTACTTGACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCTGACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3764076‑3764228‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgaccAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA < NC_000913/3764260‑3764113 ACGCGCAGTATGGAATACGATGCTGCCGGACGGGTCATCCGCCTGACCAGTGAAAACGGCAGCCACACCACCTTCCGTTACGATGTACTTGACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGCCGGCCGCACACAGGGTTATCACCACGACCT > 2:5415547/1‑149ACGCGCAGTATGGAATACGATGCTGCCGGACGGGTCATCCGCCTGACCAGTGAAAACGGCAGCCACACCACCTTCCGTTACGATGTACTTGACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCT > 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< 1:525953/149‑1ACGCGCAGTATGGAATACGATGCTGCCGGACGCGTCATCCGCCTGACCAGTGAAAACGGCAGCCACACCACCTTCCGTTACGATGTACTTGACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCT < 4:3323980/149‑1 CGCGCAGTATGGAATACGATGCTGCCGGACGGGTCATCCGCCTGACCAGTGAAAACGGCAGCCACACCCCCTTCCGTTACGATGTACTTGACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCTG < 2:2170043/149‑1 CGCGCAGTATGGAATACGATGCTGCCGGACGGGTCATCCGCCTGACCAGTGAAAACGGCAGCCACACCACCTTCCGTTACGATGTACTTGACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCTG > 1:6784446/1‑149 GCGCAGTATGGAATACGATGCTGCCGGACGGGTCATCCGCCTGACCAGTGAAAACGGCAGCCACACCACCTTCCGTTACGATGTACTTGACCGGCTGATACGGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCTGA > 3:6289842/1‑149 GCGCAGTATGGAATACGATGCTGCCGGACGGGTCATCCGCCTGACCAGTGAAAACGGCAGCCACACCACCTTCCGTTACGATGTACTTGACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCTGA > 4:6632716/1‑149 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CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA < 1:2738309/149‑1 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA > 4:5164201/1‑149 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA > 1:4330990/1‑149 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA > 1:229748/1‑149 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA > 3:1602335/1‑149 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA < 4:4013144/149‑1 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA < 2:3598618/149‑1 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA < 3:3021992/149‑1 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA < 3:1663408/149‑1 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA > 3:840904/1‑149 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA < 3:182539/149‑1 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA < 2:1315044/149‑1 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA < 3:6181233/149‑1 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA > 3:6101542/1‑149 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA > 3:5161947/1‑149 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA < 3:3664745/149‑1 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA < 3:2939234/149‑1 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTG > 4:1963345/1‑123 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTG < 3:1963345/123‑1 CAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTG > 4:1667362/1‑121 ACGCGCAGTATGGAATACGATGCTGCCGGACGGGTCATCCGCCTGACCAGTGAAAACGGCAGCCACACCACCTTCCGTTACGATGTACTTGACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCTGACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3764076‑3764228‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgaccAGACCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCAAGTACATCGTAACGGAAGGTGGTGTGGCTGCCGTTTTCACTGGTCAGGCGGA < NC_000913/3764260‑3764113 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |