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(MQ=255) tGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATc < 4:5068100/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCg > 3:191491/1‑144 (MQ=255) gTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCa < 3:4412801/149‑1 (MQ=255) ttGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAg < 2:4489195/149‑1 (MQ=255) ttGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAg > 1:6490895/1‑149 (MQ=255) tGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAgg < 1:3633021/149‑1 (MQ=255) cGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCaa < 1:4922204/149‑1 (MQ=255) gTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAAt < 2:6336484/149‑1 (MQ=255) gTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAAt < 1:1357666/149‑1 (MQ=255) gTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGaa < 1:629725/149‑1 (MQ=255) tCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCa < 4:3812850/139‑1 (MQ=255) cTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATa < 1:2473212/149‑1 (MQ=255) tGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAAt > 3:5401118/1‑143 (MQ=255) tGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATAc > 1:1605182/1‑149 (MQ=255) ggTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGaa < 3:1388630/144‑1 (MQ=255) GCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGa > 2:4023632‑M1/1‑149 (MQ=255) | CAATTATCTACCGTTTATTGCTGATTGGCCTCGGATCACCAATGGTGATTTACGGCCTGGTTCGCCCGCTCACCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGA > NC_000913/3754663‑3754959 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |