| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4615251 | 767 (0.970) | 8 (0.010) | 6/246 | NT | 1.1% | coding (293/864 nt) | yjjW | putative pyruvate formate lyase activating enzyme |
| ? | NC_000913 | = 4615269 | 743 (0.990) | coding (275/864 nt) | yjjW | putative pyruvate formate lyase activating enzyme | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 852 total aligned reads displayed.
CGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCATTGCAACGTCCCATCG > NC_000913/4615121‑4615416 | cGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATgg < 3:3932502/149‑1 (MQ=255) ggATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATgg < 3:6265089/148‑1 (MQ=255) gATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGgc > 2:6288361‑M2/1‑147 (MQ=255) gATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGgc < 1:314177‑M2/149‑3 (MQ=255) gATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGgc < 4:2228474‑M2/149‑3 (MQ=255) aTCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGgcg < 3:775683‑M2/149‑4 (MQ=255) aTCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGgcg < 4:3529689‑M2/149‑4 (MQ=255) cGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGgcgtg > 2:5635575‑M2/1‑144 (MQ=255) gTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGgcgtgg > 2:5163365‑M2/1‑143 (MQ=255) tttttGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGc > 3:944272/1‑149 (MQ=255) tGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGt < 3:4048996/149‑1 (MQ=255) aTAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGTCATGGGCGTGGCATGTTg < 3:3290308/149‑1 (MQ=255) aTAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTg < 2:5513030/149‑1 (MQ=255) tAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGc > 4:3023697/1‑149 (MQ=255) tAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGc > 4:5234070/1‑149 (MQ=255) aGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCGCTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCg > 1:6109794/1‑149 (MQ=255) aGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGGGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCg > 1:5194042/1‑149 (MQ=255) aGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCg < 2:2953760/149‑1 (MQ=255) 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cTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACGTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGgcacgcac > 4:4798376/1‑149 (MQ=255) ttCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACt > 2:4706757/1‑149 (MQ=255) gTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTccc > 1:4714487/1‑149 (MQ=255) gTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTccc < 2:1267493/149‑1 (MQ=255) tCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGgcgtggacgaagtgcttagccatgtccgcaaagcagtgctgtttatcgaagggataacggtgagtggcg < 4:3941376‑M2/94‑70 (MQ=255) tCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTcaa > 4:2363967/1‑106 (MQ=255) tCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTccc > 1:2678996/1‑148 (MQ=255) aCGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCcaca > 4:4488877/1‑149 (MQ=255) tCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCa > 3:3143009/1‑149 (MQ=255) tCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCa > 1:7280562/1‑149 (MQ=255) tCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCa > 4:3282070/1‑149 (MQ=255) aTGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCAtt < 4:2712699/149‑1 (MQ=255) aTGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCAtt < 2:661071/149‑1 (MQ=255) aTGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGACGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCAtt > 3:5812192/1‑149 (MQ=255) tGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCATTg < 1:2941337/149‑1 (MQ=255) ggATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCAcaccac > 3:6488141/1‑84 (MQ=255) aTTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCATTGCaa > 1:2136568/1‑149 (MQ=255) ttGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGt < 4:5621513/89‑1 (MQ=255) ttGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGt > 3:5621513/1‑89 (MQ=255) ttGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCATTGCAAc < 2:4933149/149‑1 (MQ=255) gcCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCca > 3:6951821/1‑71 (MQ=255) aTGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCt > 1:5823343/1‑91 (MQ=255) | CGGATCGTTTTTGATAGCAGTAAACAGCGCCACCACAAACGGCAGCTGGGTCGTGGCTTCACCGCCACTCACCGTTATCCCTTCGATAAACAGCACTGCTTTGCGGACATGGCTAAGCACTTCGTCCACGCTCATGGATTGCGCCATGGGCGTGGCATGTTGCGGACACCTCTTCAGGCAGGTATCACACTGCTCGCAAACCACAGCGTTCCACACCACTTTGCCGTCAACAATCTGCAACGCCTGATGCGGACACTGTGGCACGCACTCCCCACAGTCATTGCAACGTCCCATCG > NC_000913/4615121‑4615416 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |