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| * | NC_000913 | 1,472,757 | 0 | C | T | 6.6% | 2760.2 / 111.4 | 850 | pseudogene (2241/3497 nt) | ydbA | pseudogene, autotransporter homolog; interrupted by IS2 and IS30 |
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Only 100 of 862 total aligned reads displayed.
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cAACGTTAACGGCAGCGCCGGGAAGCTGAAGGTTAACAATGCCAGCATGAACGGCGTGGAGATTAACACGGGCTTTACCGCTGGTACGGCAGACACCACTGTGAGTTTTGATAACGTAGTGGAAGGTAGCAACCTGACCGAc > 1:5449331/1‑142 (MQ=255) cAACGTTAACGGCAGCGCCGGGAAGCTGAAGGTTAACAATGCCAGCATGAACGGCGTGGAGATTAACACGGGCTTTACCGCTGGTACGGCAGACACCACTGTGAGTTTTGATAACGTAGTGGAAGGTAGCAACCTGACCGACGCTGACg > 4:3205452/1‑149 (MQ=255) aaCGTTAACGGCAGCGCCGGGAAGTTGAAGGTTAACAATGCCAGCATGAACGGCGTGGAGATTAACACGGGCTTTACCGCTGGTACGGCAGACACCACTGTGAGTTTTGATAACGTAGTGGAAGGTa > 1:7007704/1‑127 (MQ=255) aaCGTTAACGGCAGCGCCGGGAAGCTGAAGGTTAACAATGCCAGCATGAACGGCGTGGAGATTAACACGGGCTTTACCGCTGGTACGGCAGACACCACTGTGa < 2:3633842/103‑1 (MQ=255) gTTAACGGCAGCGCCGGGAAGCTGAAGGTTAACAATGCCAGCATGAACGGCGTGGAGATTAACACGGGCTTTACCGCTGGTACGGCAGACACCACTGTGAGTTTTGATAACGTAGTGGAAGGTAGCAACCTGACCGACGCTGACGCCAt > 2:695603/1‑149 (MQ=255) tAACGGCAGCGCCGGGAAGCTGAAGGTTAACAATGCCAGCATGAACGGCGTGGAGATTAACACGGGCTTTACCGCTGGTACGGCAGACACCACTGTGAGTTTTGATAACGTAGTGGAAGGTAGCAACCTGACCGACGCTGACGCCATCa < 3:5306911/149‑1 (MQ=255) aaCGGCAGCGCCGGGAAGCTGAAGGTTAACAATGCCAGCATGAACGGCGTGGAGATTAACACGGGCTTTACCGCTGGTACGGCAGACACCACTGTGAGTTTTGATAACGTAGTGGAAGGTAGCAACCTGACCGACGCTGACGCCATCAc > 3:63767/1‑149 (MQ=255) aCGGCAGCGCCGGGAAGCTGAAGGTTAACAATGCCAGCATGAACGGCGTGGAGATTAACACGGGCTTTACCGCTGGTACGGCAGACACCACTGTGAGTTTTGATAACGTAGTGGAAGGTAGCAACCTGACCGACGCTGACGCCATCAcc < 4:256930/149‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCGGGAAGCTGAAGGTTAACAATGCCAGCATGAACGGCGTGGAGATTAACACGGGCTTTACCGCTGGTACGGCAGACACCACTGTGAGTTTTGATAACGTAGTGGAAGGTAGCAACCTGACCGACGCTGACGCCATCACCTc > 2:2953633/1‑149 (MQ=255) cgcCGGGAAGCTGAAGGTTAACAATGCCAGCATGAACGGCGTGGAGATTAACACGGGCTTTACCGCTGGTACGGCAGACACCACTGTGAGTTTTGATAACGTAGTGGAAGGTAGCAACCTGACCGACGCTGACGCCATCACCTCAACGt > 4:2858059/1‑149 (MQ=255) gcCGGGAAGCTGAAGGTTAACAATGCCAGCATGAACGGCGTGGAGATTAACACGGGCTTTACCGCTGGTACGGCAGACACCACTGTGAGTTTTGATAACGTAGTGGAAGGTAGCAACCTGACCGACGCTGACGCCATCACCTCAACGTc < 2:567071/149‑1 (MQ=255) cTGAAGGTTAACAATGCCAGCATGAACGGCGTGGAGATTAACACGGGCTTTACCGCTGGTACGGCAGACACCACTGTGAGTTTTGATAACGTAGTGGAAGGTAGCAACCTGACCGACGCTGACGCCATCACCTCAACGTCCGTGGTATg < 3:2275344/149‑1 (MQ=255) | CGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTCAACGGCTATGTCGTCGGTACCAACGTTAACGGCAGCGCCGGGAAGCTGAAGGTTAACAATGCCAGCATGAACGGCGTGGAGATTAACACGGGCTTTACCGCTGGTACGGCAGACACCACTGTGAGTTTTGATAACGTAGTGGAAGGTAGCAACCTGACCGACGCTGACGCCATCACCTCAACGTCCGTGGTATG > NC_000913/1472609‑1472905 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |