| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 81840 | 121 (0.880) | 7 (0.050) | 6/216 | NT | 5.6% | coding (119/1092 nt) | leuB | 3‑isopropylmalate dehydrogenase, NAD(+)‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 81876 | 119 (0.900) | coding (83/1092 nt) | leuB | 3‑isopropylmalate dehydrogenase, NAD(+)‑dependent | |||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GCTGGTCTGGTGGTAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTTG > NC_000913/81694‑81985 | gCTGGTCTGGTGGTAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCtggtg < 1:1072834/149‑1 (MQ=255) gtctggtGGTAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGa > 4:1125650/1‑149 (MQ=255) gtctggtGGTAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGa > 2:498707/1‑149 (MQ=255) gtAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGgtggtg < 2:1105726/140‑1 (MQ=255) tAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCtggtg < 4:258198/136‑1 (MQ=255) tAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCtggtg > 3:258198/1‑136 (MQ=255) ttCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGc > 3:977553/1‑149 (MQ=255) tCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCg < 4:1416901/149‑1 (MQ=255) cccACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCgg > 2:180126/1‑149 (MQ=255) cACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGtt < 3:1125650/149‑1 (MQ=255) cACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGACTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGatgccgtgcgcaaccgctttgcgat > 3:634839‑M1/1‑124 (MQ=255) aCTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTg > 1:1030654/1‑149 (MQ=255) ttCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGtt < 3:141079/146‑1 (MQ=255) gccgccTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGatgccgtgcgcaaccgctttgcgatgcgcatca < 4:1405135‑M1/149‑34 (MQ=255) 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tAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGttt < 1:1425829/149‑1 (MQ=255) aTGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCAGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTc > 2:1140216/1‑149 (MQ=255) ggCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCATGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGt < 4:743225/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGt < 1:819335/148‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGt > 2:819335/1‑148 (MQ=255) cTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCAGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTtg < 1:1140216/149‑1 (MQ=255) ggatgccgtgcgcaaccgctttgcgatgcgcatcaccaccagccattacgatgtaggcggcgcagccattgataaccacgggcaaccactgccgcctgcgacggttgaaggttgt < 1:74892‑M1/115‑114 (MQ=255) ggatgccgtgcgcaaccgctttgcgatgcgcatcaccaccagccattacgatgtaggcggcgcagccattgataaccacgggcaaccactgccgcctgcgacggttgaaggttgt > 2:74892‑M1/1‑2 (MQ=255) ggatgccgtgcgcaaccgctttgcgatgcgcatcaccaccagccattacgatgtaggcggcgcagccattgataaccacgggcaaccactgccgcctgcgacggttgaag < 3:654265‑M1/110‑109 (MQ=255) ggatgccgtgcgcaaccgctttgcgatgcgcatcaccaccagccattacgatgtaggcggcgcagccattgataaccacgggcaaccactgccgcctgcgacggttgaag > 4:654265‑M1/1‑2 (MQ=255) | GCTGGTCTGGTGGTAAATGTTCCCACTTCGGGCCGCCTACCGAGCCAAACAGCACGGCATCGGCTTGCTCACAACCTTCAACCGTCGCAGGCGGCAGTGGTTGCCCGTGGTTATCAATGGCTGCGCCGCCTACATCGTAATGGCTGGTGGTGATGCGCATCGCAAAGCGGTTGCGCACGGCATCCAGCACTTTCAGCGCCTGGGTCATCACTTCCGGACCAATACCGTCCCCCGGCAATACGGCAATATGGTAATTCTTCGACATCACACGGTTTCCTTGTTGTTTTCGTTG > NC_000913/81694‑81985 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |