New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 341210 | 73 (0.530) | 6 (0.050) | 6/216 | NT | 7.3% | coding (86/1383 nt) | yahJ | putative metallo‑dependent hydrolase domain deaminase |
? | NC_000913 | = 341232 | 83 (0.630) | coding (108/1383 nt) | yahJ | putative metallo‑dependent hydrolase domain deaminase |
CTGCGCGGCGAAACGGGCACTCATATTATTAAAACGTAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTTTTGACTACGAAAATGGCGTGGCGGTGCAGACCCGCACG > NC_000913/341077‑341355 | cTGCGCGGCGAAACGGGCACTCATATTATTAAAACGTAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATgcggc < 2:942950/149‑1 (MQ=255) cgAAACGGGCACTCATATTATTAAAACGTAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCa < 1:770674/135‑1 (MQ=255) cgAAACGGGCACTCATATTATTAAAACGTAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCa > 2:770674/1‑135 (MQ=255) gggCACTCATATTATTAAAACGTAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCAccc > 4:627670/1‑149 (MQ=255) tCATATTATTAAAACGTAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACt > 2:697087/1‑149 (MQ=255) atatTATTAAAACGTAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTaaa < 2:1342366/145‑1 (MQ=255) atatTATTAAAACGTAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTaaa > 1:1342366/1‑145 (MQ=255) tattatTAAAACGTAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTgcg > 4:1227328/1‑149 (MQ=255) tattatTAAAACGTAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTgcg < 3:627670/149‑1 (MQ=255) ttaAAACGTAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCagctaccgccgcatgggcgagcggcacagag > 2:674341‑M1/1‑106 (MQ=255) ttaAAACGTAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCagctaccgccgcatgggcgagcggcacagag < 1:674341‑M1/137‑32 (MQ=255) aaaaCGTAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTgcgaagcgaa < 1:697087/149‑1 (MQ=255) tAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTgcgaagcgaa < 2:168568/143‑1 (MQ=255) tAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTgcgaagcgaa > 1:168568/1‑143 (MQ=255) gACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATg > 2:210476/1‑149 (MQ=255) gTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCAt > 2:595010/1‑101 (MQ=255) gTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCAt < 1:595010/101‑1 (MQ=255) gATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCa > 2:535507/1‑149 (MQ=255) aTGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCAc > 2:1258190/1‑149 (MQ=255) tGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCATAGCGGTAAGATGGTCACGGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACt > 4:991173/1‑149 (MQ=255) aaagaaagCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGc > 3:506929/1‑104 (MQ=255) aaagaaagCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGc < 4:506929/104‑1 (MQ=255) aaagaaagCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTgcgaagcgaa > 1:310471/1‑128 (MQ=255) aaagaaagCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTgcgaagcgaa < 2:310471/128‑1 (MQ=255) aagaaagCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTgcgaagcga < 2:1070812/126‑1 (MQ=255) aagaaagCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTgcgaagcga > 1:1070812/1‑126 (MQ=255) gaaagCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTgc < 2:513367/117‑1 (MQ=255) gaaagCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTgc > 1:513367/1‑117 (MQ=255) aaagCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCg > 2:1245017/1‑149 (MQ=255) aagCAATAGCCACCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGc > 1:1086812/1‑149 (MQ=255) cAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGa < 1:151193/131‑1 (MQ=255) cAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGa > 2:151193/1‑131 (MQ=255) aaTAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATgc < 1:1081761/86‑1 (MQ=255) aaTAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATgc > 2:1081761/1‑86 (MQ=255) aTAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTAc > 2:988327/1‑149 (MQ=255) tAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACt < 1:210476/149‑1 (MQ=255) aGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGaaa < 1:574851/129‑1 (MQ=255) aGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCACGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACTACACCATGaaa > 2:574851/1‑129 (MQ=255) gccgccGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTAt < 1:1258190/149‑1 (MQ=255) gccgccGTGAATCTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTAt < 3:991173/149‑1 (MQ=255) gTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGAt < 3:241594/149‑1 (MQ=255) tGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGaacaac > 3:1171146/1‑112 (MQ=255) tGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGaacaac < 4:1171146/112‑1 (MQ=255) gAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATaa < 1:988327/149‑1 (MQ=255) aTTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACg > 1:1099530/1‑149 (MQ=255) tttCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCagctaccgccgcatgggcgagcggcacagagg < 4:1089684‑M1/91‑33 (MQ=255) tttCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCagctaccgccgcatgggcgagcggcacagagg > 3:1089684‑M1/1‑59 (MQ=255) tGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGAcc < 4:1127810/123‑1 (MQ=255) tGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGAcc > 3:1127810/1‑123 (MQ=255) ccAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCagctaccgccgcatgggcgagcg > 2:1163634‑M1/1‑51 (MQ=255) ccAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCagctaccgccgcatgggcgagcg < 1:1163634‑M1/74‑24 (MQ=255) agagCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGaa > 4:284689/1‑149 (MQ=255) agagCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGaa > 4:1437289/1‑149 (MQ=255) agagCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGaa > 4:476055/1‑149 (MQ=255) gagCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGaaa < 3:1437289/149‑1 (MQ=255) agCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAAc < 2:1086812/149‑1 (MQ=255) tAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCa < 2:1156051/114‑1 (MQ=255) tAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCa > 1:1156051/1‑114 (MQ=255) aTGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTTTTGa < 1:535507/149‑1 (MQ=255) aTGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTTTTGa < 3:476055/149‑1 (MQ=255) ggTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAAc > 4:823775/1‑70 (MQ=255) ggTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAAc < 3:823775/70‑1 (MQ=255) ggTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTTTTGACt > 4:1414362/1‑149 (MQ=255) tCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCAGCATTANTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTNTTGACTAc > 4:379009/1‑149 (MQ=255) aCCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGttt > 1:166563/1‑140 (MQ=255) aCCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGttt < 2:166563/140‑1 (MQ=255) gccgccgcGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTTTTGACTACGaaaa < 3:284689/149‑1 (MQ=255) cgccgcGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGTTGCTGGAAACCGGTTTTGACTACGAAAAtg < 3:1227328/149‑1 (MQ=255) gcTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTaaa > 4:235407/1‑54 (MQ=255) gcTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTaaa < 3:235407/54‑1 (MQ=255) ggTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTAc > 3:1050071/1‑90 (MQ=255) ggTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTAc < 4:1050071/90‑1 (MQ=255) ggTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTTTTGACTACGAAAATGGCGTGGCGGTGCa > 2:136877/1‑149 (MQ=255) tACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGtttt < 3:132978/121‑1 (MQ=255) tACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGtttt > 4:132978/1‑121 (MQ=255) ccTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTggcacagaggtaccaaacagcgcggcggcggtgaccatcttaccgctctggctcagaaa < 4:1089684‑M2/91‑60 (MQ=255) ccTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTggcacagaggtaccaaacagcgcggcggcggtgaccatcttaccgctctggctcagaaa > 3:1089684‑M2/1‑32 (MQ=255) ctctGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTggcacagaggtaccaaacagcgcggcggcggtgaccatcttaccgctctggctcagaaattcacggcggctattgctttctttcatcttacgtccttacgttttaa < 1:674341‑M2/137‑107 (MQ=255) ctctGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTggcacagaggtaccaaacagcgcggcggcggtgaccatcttaccgctctggctcagaaattcacggcggctattgctttctttcatcttacgtccttacgttttaa > 2:674341‑M2/1‑31 (MQ=255) ctctGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTAtct < 1:953407/90‑1 (MQ=255) ctctGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTAtct > 2:953407/1‑90 (MQ=255) ctctGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTTTTGACTACGAAAATGGCGTGGCGGTGCAGAccc > 4:1154747/1‑149 (MQ=255) tctGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTTTTGACTACGAAAATGGCGTGGCGGTGCAGACCCg > 1:83209/1‑149 (MQ=255) tgCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACTCCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTTTTGACTACGAAAATGGCGTGGCGGTGCAGACCCGCACg > 4:1007911/1‑149 (MQ=255) gCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTTTTGACTa > 2:912671/1‑117 (MQ=255) gCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTTTTGACTa < 1:912671/117‑1 (MQ=255) cGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTggcacagaggtaccaaacagcgcggcggcggtgaccatcttaccgctctgg < 1:1163634‑M2/74‑52 (MQ=255) cGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTggcacagaggtaccaaacagcgcggcggcggtgaccatcttaccgctctgg > 2:1163634‑M2/1‑23 (MQ=255) cGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTTTTGACTa > 2:308530/1‑115 (MQ=255) cGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTTTTGACTa < 1:308530/115‑1 (MQ=255) | CTGCGCGGCGAAACGGGCACTCATATTATTAAAACGTAAGGACGTAAGATGAAAGAAAGCAATAGCCGCCGTGAATTTCTGAGCCAGAGCGGTAAGATGGTCACCGCCGCCGCGCTGTTTGGTACCTCTGTGCCGCTCGCCCATGCGGCGGTAGCTGGCACCCTAAACTGCGAAGCGAACAACACCATGAAAATCACTGACCCGCATTACTATCTCGATAACGTGCTGCTGGAAACCGGTTTTGACTACGAAAATGGCGTGGCGGTGCAGACCCGCACG > NC_000913/341077‑341355 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |