| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3154353 | 92 (0.670) | 6 (0.050) | 5/208 | NT | 6.0% | coding (866/957 nt) | yqhC | transcriptional activator of yqhD |
| ? | NC_000913 | = 3154366 | 103 (0.810) | coding (853/957 nt) | yqhC | transcriptional activator of yqhD | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAA > NC_000913/3154227‑3154492 | tttCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGc < 2:303368/136‑1 (MQ=255)tttCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGc > 1:303368/1‑136 (MQ=255) ccGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCtt > 1:1430865/1‑124 (MQ=255) ccGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCtt < 2:1430865/124‑1 (MQ=255) ttCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgctgc > 3:1107368/1‑144 (MQ=255) ttCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgctgc < 4:1107368/144‑1 (MQ=255) ttCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATAGCGATGCGCgtcggctatgaaagc > 4:252834‑M1/1‑119 (MQ=255) ttCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATAGCGATGCGCgtcggctatgaaagc < 3:252834‑M1/134‑16 (MQ=255) cccGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcgc > 2:283876‑M2/1‑130 (MQ=255) gTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgc > 1:679996‑M2/1‑126 (MQ=255) tGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATg > 4:347429/1‑149 (MQ=255) tACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatc < 2:929363‑M2/126‑8 (MQ=255) tACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatc > 1:929363‑M2/1‑119 (MQ=255) tACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTgcgc > 3:7453/1‑136 (MQ=255) acGGGAACGTCTTTAATTCCCCCGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACAGAAGTAACGTTTAAACTCAAGGCTACATTGCGATGCGCTATCATAGAAGACGCGCATCACTGCAGCGATGGCCTTCATgtagt > 4:246950/2‑145 (MQ=255) gTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCCTAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGgatg < 3:347429/149‑1 (MQ=255) ttAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatca > 2:772597/1‑149 (MQ=255) aaTTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatcatc > 4:754430/1‑149 (MQ=255) ttCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatc < 4:1127989/144‑1 (MQ=255) ttCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatc > 3:1127989/1‑144 (MQ=255) tCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatcatcatc > 3:1082207/1‑149 (MQ=255) cccTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCcg > 1:789587/1‑149 (MQ=255) ccTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGcc > 3:1100383/1‑119 (MQ=255) tGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgcgc > 4:117135/1‑149 (MQ=255) gCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCAt > 1:218098/1‑129 (MQ=255) gCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGcc > 3:1421488/1‑149 (MQ=255) cccGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGc > 1:548836/1‑149 (MQ=255) ccGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCATCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCgtcggctatgaaagcgcatc > 4:857038‑M1/1‑74 (MQ=255) cGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgctgct < 4:837056/99‑1 (MQ=255) cGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgctgct > 3:837056/1‑99 (MQ=255) cGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 3:3438/1‑149 (MQ=255) gCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatc < 3:198055/128‑1 (MQ=255) gCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatc > 4:198055/1‑128 (MQ=255) aTTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatcatca < 1:1065767/130‑1 (MQ=255) aTTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatcatca > 2:1065767/1‑130 (MQ=255) tGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAAt < 2:789587/149‑1 (MQ=255) gCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAAttctt < 3:754430/149‑1 (MQ=255) gCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAAttctt > 2:1447848/1‑149 (MQ=255) cTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCaaa > 4:1335882/1‑149 (MQ=255) ttCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGc > 2:1038716/1‑90 (MQ=255) ttCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGc < 1:1038716/90‑1 (MQ=255) cccccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATAc > 4:758640/1‑149 (MQ=255) ccccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGga > 2:290155/1‑104 (MQ=255) ccccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGga < 1:290155/104‑1 (MQ=255) ccccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCtt < 3:1376704/123‑1 (MQ=255) cccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatc > 4:1268769/1‑108 (MQ=255) cccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatc < 3:1268769/108‑1 (MQ=255) cccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTaa < 3:209520/135‑1 (MQ=255) ccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGc > 2:1285732/1‑125 (MQ=255) ccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGc < 1:1285732/125‑1 (MQ=255) gCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAAc < 4:1082207/149‑1 (MQ=255) gTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCgtcggctatgaaagc > 3:1035072‑M1/1‑46 (MQ=255) gTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCgtcggctatgaaagc < 4:1035072‑M1/61‑16 (MQ=255) tCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGc > 3:1211740/1‑149 (MQ=255) acacCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGa < 1:1447848/149‑1 (MQ=255) acacCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGa < 3:758640/149‑1 (MQ=255) acacCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGa < 3:246950/149‑1 (MQ=255) cacCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAg < 4:1421488/149‑1 (MQ=255) acCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATATCCGACTCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCt > 3:1150516/1‑110 (MQ=255) acCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgcgc > 1:1226163/1‑108 (MQ=255) acCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCt < 4:1150516/110‑1 (MQ=255) acCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTAt > 3:1349361/1‑113 (MQ=255) acCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTAt < 4:1349361/113‑1 (MQ=255) acCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAAc < 1:593327/142‑1 (MQ=255) acCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAAc > 2:593327/1‑142 (MQ=255) acCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAgg > 1:882295/1‑149 (MQ=255) gAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTAc < 2:548836/149‑1 (MQ=255) gAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTAc > 2:1350506/1‑149 (MQ=255) aCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGa < 3:117135/149‑1 (MQ=255) gTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGt > 4:1140795/1‑145 (MQ=255) tttAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAAttcttc > 3:387440/1‑118 (MQ=255) tttAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAAttcttc < 4:387440/118‑1 (MQ=255) ttAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGa < 2:882295/149‑1 (MQ=255) taCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGAATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTggc < 2:714991/142‑3 (MQ=255) aaCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAAttcttc < 1:965031/114‑1 (MQ=255) aaCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAAttcttc > 2:965031/1‑114 (MQ=255) aaCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTgtc > 1:714991/1‑141 (MQ=255) aCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTa < 4:3438/149‑1 (MQ=255) tCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCa < 2:1340616/69‑1 (MQ=255) tCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCa > 1:1340616/1‑69 (MQ=255) tCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATg > 3:128670/1‑95 (MQ=255) tCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATg < 4:128670/95‑1 (MQ=255) gCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTAt < 1:772597/149‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTAtggtg > 4:1378042/1‑149 (MQ=255) aTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGAc > 4:205730/1‑90 (MQ=255) aTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGt < 3:332936/127‑1 (MQ=255) gCGATGCGCgtcggctatgaaagcgcatcgcaatttagccgtgagtttaaacgttacttcggtgtgacgccgggggaagatgcggcaagaatgcgggcgatgcaggggaattaaatacgttcccggtacagcaaccggg < 1:283876‑M1/139‑131 (MQ=255) gCGATGCGCgtcggctatgaaagcgcatcgcaatttagccgtgagtttaaacgttacttcggtgtgacgccgggggaagatgcggcaagaatgcgggcgatgcaggggaattaaatacgttcccggtacagcaaccggg > 2:283876‑M1/1‑9 (MQ=255) gATGCGCgtcggctatgaaagcgcatcgcaatttagccgtgagtttaaacgttacttcggtgtgacgccgggggaagatgcggcaagaatgcgggcgatgcaggggaattaaatacgttcccggta < 2:929363‑M1/126‑120 (MQ=255) gATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcgcaatttagccgtgagtttaaacgttacttcggtgtgatgccgggggaagatgcggcaagaatgcgg < 3:857038‑M2/94‑75 (MQ=255) gATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACtt < 4:641752/131‑1 (MQ=255) gATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGaa > 1:927841/1‑146 (MQ=255) tGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgcgc > 1:396553/1‑72 (MQ=255) gcgtcggctatgaaagcgcatcgcaatttagccgtgagtttaaacgttacttcggtgtgacgccgggggaagatgcggcaagaatgcgggcgatgcaggggaattaaatacgttcccggtacagcaac > 1:679996‑M1/1‑2 (MQ=255) gcgtcggctatgaaagcgcatcgcaatttagccgtgagtttaaacgttacttcggtgtgacgccgggggaagatgcggcaagaatgcgggcgatgcaggggaattaaatacgttcccggtacagcaac < 2:679996‑M1/128‑127 (MQ=255) gcTTTCATAGCCGACgcgcatcgctatttagccgtgagtttaaacgttacttcggtgtgacgccgggggaagatgcggcaagaatgcgggcgatgcaggggaattaaatacgttcccggtacagcaaccgggaa > 4:252834‑M2/1‑15 (MQ=255) gcTTTCATAGCCGACgcgcatcgcaatttagccgtgagtttaaacgttacttcggtgtgac < 4:1035072‑M2/61‑47 (MQ=255) gcTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATg < 2:592161/75‑1 (MQ=255) gcTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGt > 3:229761/1‑117 (MQ=255) gcTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGt < 4:229761/117‑1 (MQ=255) | TTTCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACGGTAATTCTTCAAATACTGCAACGGCGAGGTACTGGTGACAGACTTAAAATTATGGTGGAA > NC_000913/3154227‑3154492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |