| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,293,006 | IS1 (+) Δ9 bp | 87.2% | intergenic (‑84/‑513) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 291401 | NA (NA) | 8 (0.060) | 6/226 | NT | 55.3% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1293005 | 7 (0.050) | intergenic (‑83/‑522) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1293015 = | 7 (0.050) | 87 (0.630) | 62/226 | NT | 93.1% | intergenic (‑93/‑512) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 4519239 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
CATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTT > NC_000913/1292861‑1293152 | cATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGGGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAATTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg > 1:238074/1‑149 (MQ=255) ttCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg > 4:92981/1‑147 (MQ=255) ttCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg < 3:92981/147‑1 (MQ=255) ctTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg < 2:1325132/143‑1 (MQ=255) ctTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg > 1:1325132/1‑143 (MQ=255) gAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtga < 4:975849‑M2/131‑6 (MQ=255) gAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtga > 3:975849‑M2/1‑126 (MQ=255) gagTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgct < 2:238074‑M1/149‑10 (MQ=255) gttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttac < 1:988520‑M1/149‑20 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactga > 1:446320‑M1/1‑127 (MQ=255) ttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTc > 3:364900/1‑119 (MQ=255) ttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTc < 4:364900/119‑1 (MQ=255) ttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgct > 3:373836‑M1/1‑126 (MQ=255) ttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgct < 4:373836‑M1/135‑10 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgattta > 1:700707‑M1/1‑123 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgattta > 2:1127585‑M1/1‑123 (MQ=255) gTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 1:1127585‑M1/149‑37 (MQ=255) gTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 3:539230‑M1/149‑37 (MQ=255) cTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagt > 2:1246652‑M1/1‑110 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtga > 1:1358898‑M1/1‑109 (MQ=255) gCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattt > 1:1411348‑M1/1‑106 (MQ=255) cTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgatttt < 2:1411348‑M1/149‑45 (MQ=255) aTTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaag < 4:382472‑M1/149‑48 (MQ=255) aTTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg > 3:819601‑M1/1‑102 (MQ=255) gtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgta < 1:1092484‑M1/127‑32 (MQ=255) gtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTATGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgta > 2:1092484‑M1/1‑96 (MQ=255) taATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttg > 4:176358‑M1/1‑95 (MQ=255) taATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttg > 4:923999‑M1/1‑95 (MQ=255) aTCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTaa > 2:355089/1‑79 (MQ=255) aTCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTaa < 1:355089/79‑1 (MQ=255) tctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgt > 1:573485‑M1/1‑92 (MQ=255) ctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 1:998159‑M1/127‑37 (MQ=255) ctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg > 2:998159‑M1/1‑91 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgat > 4:750537‑M1/1‑90 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgat < 3:750537‑M1/113‑24 (MQ=255) aaaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgt > 4:1230555‑M1/1‑88 (MQ=255) aaaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgt < 3:1230555‑M1/145‑58 (MQ=255) cTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgttt > 3:990760‑M2/1‑68 (MQ=255) ttATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt < 3:433540‑M1/122‑39 (MQ=255) atTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttc < 2:700707‑M1/149‑70 (MQ=255) atTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGccc < 1:433458/149‑1 (MQ=255) ttGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgc > 1:703173‑M1/1‑79 (MQ=255) ttGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgc < 2:703173‑M1/130‑52 (MQ=255) ggtggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatca < 3:176358‑M1/149‑75 (MQ=255) tggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag > 4:939233‑M2/1‑56 (MQ=255) tggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag < 3:939233‑M2/103‑48 (MQ=255) gtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaag < 2:572066‑M1/118‑48 (MQ=255) gtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaag > 1:572066‑M1/1‑71 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggct > 2:1285848‑M1/1‑61 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggct < 1:1285848‑M1/122‑62 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagt < 4:281865‑M1/89‑29 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagt > 3:281865‑M1/1‑61 (MQ=255) taataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgattta > 1:206117‑M1/1‑57 (MQ=255) taataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgattta < 2:206117‑M1/83‑27 (MQ=255) aataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgc > 1:1235950‑M1/1‑56 (MQ=255) taGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAAGTGAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtataatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgcta > 4:1221064‑M1/1‑54 (MQ=255) gagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtg > 1:734422‑M1/1‑52 (MQ=255) gagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtg < 2:734422‑M1/91‑40 (MQ=255) agCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaa > 2:37120‑M1/1‑51 (MQ=255) agCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaa < 1:37120‑M1/97‑47 (MQ=255) gCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTg < 2:52755/50‑1 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg < 1:512880‑M2/135‑104 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg > 2:285147‑M2/1‑32 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg > 2:512880‑M2/1‑32 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatca < 3:1284782‑M1/123‑75 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatatccatca > 4:1284782‑M1/1‑49 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaag > 4:898323‑M1/1‑49 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaag < 3:898323‑M1/96‑48 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgattta < 3:502531‑M1/75‑27 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgattta > 4:502531‑M1/1‑49 (MQ=255) ttAAATTCGGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaagg > 3:1028643‑M1/1‑47 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaagg > 3:180269‑M1/1‑47 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgc < 1:1103370‑M1/135‑89 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgc > 2:1103370‑M1/1‑47 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgatt > 3:70242‑M1/1‑47 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgatt < 4:70242‑M1/89‑43 (MQ=255) aaTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgt > 2:1013083‑M1/1‑44 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtgg > 1:429258‑M1/1‑42 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtgg > 2:1010912‑M1/1‑42 (MQ=255) tCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggt < 1:1013083‑M1/149‑109 (MQ=255) gtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtc > 3:1081375‑M1/1‑35 (MQ=255) gtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtc < 4:1081375‑M1/115‑81 (MQ=255) tgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaac < 3:1221064‑M1/149‑116 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcc < 4:317471‑M1/116‑86 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcc > 3:317471‑M1/1‑31 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac < 2:1134616/109‑1 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac > 1:1134616/1‑109 (MQ=255) aTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg > 4:630111‑M1/1‑30 (MQ=255) aTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 3:630111‑M1/66‑37 (MQ=255) ccAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaag > 3:138327‑M1/1‑26 (MQ=255) ccAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaag < 4:138327‑M1/127‑102 (MQ=255) ccAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttcc > 1:1224695‑M1/1‑26 (MQ=255) ccAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttcc < 2:1224695‑M1/96‑71 (MQ=255) cAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaa > 4:656759‑M1/1‑25 (MQ=255) cAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaa < 3:656759‑M1/139‑115 (MQ=255) aGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagca > 1:885554‑M1/1‑24 (MQ=255) ggAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcaga < 4:942534‑M1/99‑77 (MQ=255) ggAATGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatgtccatcagatgtccatcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcac < 4:730330‑M1/149‑127 (MQ=255) aaTGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcactg < 2:1235950‑M1/149‑129 (MQ=255) tGTAAGGAATTCAAAATTGggtaatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgattttaaggtgcttgcgtggcttccatttccatcagatgtccttcctgctccgctactgaaggcgtggtgcgtaacggcaaaagcactgcc > 3:796978‑M1/1‑19 (MQ=255) | CATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTT > NC_000913/1292861‑1293152 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |