| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,401,582 | A→T | 5.2% | L584Q (CTG→CAG) | csrD ← | targeting factor for csrBC sRNA degradation |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,401,582 | 0 | A | T | 5.2% | 711.9 / 20.6 | 193 | L584Q (CTG→CAG) | csrD | targeting factor for csrBC sRNA degradation |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (94/89); new base T (5/5); total (99/94) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.28e-01 | |||||||||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
AAGTGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGTTGACGGCTACCCGTACCCCTAAAGCATTCACTAA > NC_000913/3401434‑3401730 | aGTGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACcagcag < 1:408605/149‑1 (MQ=255) tGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCagcagc > 3:1427226/1‑148 (MQ=255) tGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCagcagc < 4:1427226/148‑1 (MQ=255) tGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCt > 2:195644/1‑149 (MQ=255) gAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCTGCTGGTtcaa < 4:1179567/149‑3 (MQ=255) gAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTtctc > 1:324550/1‑149 (MQ=255) gcgAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTtctc < 2:486063/143‑1 (MQ=255) gcgAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTtctc > 1:486063/1‑143 (MQ=255) gcgAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCg > 1:1239644/1‑149 (MQ=255) gAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCt > 4:579665/1‑149 (MQ=255) aaaaaTCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCTGCTGGTtcaaa > 2:623838/1‑137 (MQ=255) cccTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCaa > 4:825179/1‑146 (MQ=255) cccTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCaa < 3:825179/146‑1 (MQ=255) cTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGttt < 3:1211914/149‑1 (MQ=255) ccGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTtct > 4:1249445/1‑136 (MQ=255) ccGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGAc < 2:1354881/149‑1 (MQ=255) cTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTgg > 3:239877/1‑116 (MQ=255) cTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAAt < 3:11072/136‑1 (MQ=255) cTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAAt > 4:11072/1‑136 (MQ=255) gTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAAt < 2:577257/134‑1 (MQ=255) cacCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGa < 3:495333/149‑1 (MQ=255) gcgcTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGa > 3:93394/1‑149 (MQ=255) aaTCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGa < 2:862053/149‑1 (MQ=255) tCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGt > 3:1324107/1‑149 (MQ=255) tCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGt > 2:1261133/1‑149 (MQ=255) aGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTaa < 3:988176/149‑1 (MQ=255) gggTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAAc < 1:1031537/149‑1 (MQ=255) ccACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGt < 1:1021077/110‑1 (MQ=255) ccACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAAc < 4:167548/142‑1 (MQ=255) ccACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACAt > 1:1270058/1‑149 (MQ=255) aCTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGAc < 2:788853/115‑1 (MQ=255) tCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAg < 4:1324107/149‑1 (MQ=255) gCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACt < 3:375283/137‑1 (MQ=255) gCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACt < 2:849177/137‑1 (MQ=255) gCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACt > 4:375283/1‑137 (MQ=255) cTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTc < 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gAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATg < 1:859485/116‑1 (MQ=255) gAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATg > 3:304765/1‑116 (MQ=255) gAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGAt < 4:934470/149‑1 (MQ=255) aaCGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTgg < 3:1028676/74‑1 (MQ=255) aaCGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTgg > 4:1028676/1‑74 (MQ=255) aaCGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAAt > 4:237425/1‑94 (MQ=255) acgcacgcCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATcc < 1:195644/149‑1 (MQ=255) cacgcCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAAc < 2:476540/149‑1 (MQ=255) caccggCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTa < 4:346645/145‑1 (MQ=255) gTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAg > 1:830921/1‑113 (MQ=255) aaaCCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTg < 1:329708/137‑1 (MQ=255) aaaCCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTa > 4:665421/1‑140 (MQ=255) aaaCCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTa < 3:665421/140‑1 (MQ=255) cTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTTAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTa < 4:1067043/136‑1 (MQ=255) cTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTaa < 2:1028205/116‑1 (MQ=255) cTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTa > 3:1067043/1‑136 (MQ=255) cTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCa > 1:1100759/1‑149 (MQ=255) tGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGcc > 1:588998/1‑149 (MQ=255) ggTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGa > 2:341035/1‑86 (MQ=255) 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2:495911/1‑142 (MQ=255) aGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGTTGACGGCTAccc < 1:495911/142‑1 (MQ=255) aGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGTTGACGGCTACCCGTAcccc > 3:122732/1‑149 (MQ=255) ggCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCa < 4:832651/122‑1 (MQ=255) ggCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCa > 3:832651/1‑122 (MQ=255) gCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGTTGACGGCTACCCGTACCCCTa > 3:1007870/1‑149 (MQ=255) tttGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGc < 3:1052083/121‑1 (MQ=255) tttGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGc > 4:1052083/1‑121 (MQ=255) tttGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGtt > 3:226681/1‑127 (MQ=255) tttGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGTTGACGGCTACCCGTACCCCTaaa > 4:1286325/1‑149 (MQ=255) ttGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGc > 3:1468073/1‑120 (MQ=255) ttGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGc < 4:1468073/120‑1 (MQ=255) gAACCAGCTGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGTTGACGGCTACCCGTACCCCTaaa < 2:1315044/146‑1 (MQ=255) aaCCAGCTGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGTTGACGGCTACCCGTACCCCTAAAGCAt > 4:911099/1‑149 (MQ=255) aaCCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGTTGACGGCTACCCGTACCCCTAAAGCAt > 1:895783/1‑149 (MQ=255) aCCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGTTGACGGCTACCCGTACCCCTAAAGCAtt > 4:512261/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGTTGACGGCTACCCGTACCCCTAAAGCAtt > 3:751052/1‑148 (MQ=255) ccAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGTTGACGGCTACCCGTACCCCTAAAGCAtt < 4:751052/148‑1 (MQ=255) gcagcTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGTTGACGGCTACCCGTACCCCTAAAGCATTCACt > 2:1088761/1‑149 (MQ=255) agcTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGTTGACGGCTACCCGTACCCCTAAAGCATTCACTaa > 2:275477/1‑149 (MQ=255) | AAGTGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTACTTACCAGCGTCAAACCAGCCTGGTTGACGGCTACCCGTACCCCTAAAGCATTCACTAA > NC_000913/3401434‑3401730 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |