Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,754,874 | G→A | 5.5% | intergenic (‑446/+99) | yiaW ← / ← aldB | DUF3302 family inner membrane protein/aldehyde dehydrogenase B |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,754,874 | 0 | G | A | 5.5% | 790.7 / 22.7 | 234 | intergenic (‑446/+99) | yiaW/aldB | DUF3302 family inner membrane protein/aldehyde dehydrogenase B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (112/109); new base A (7/6); total (119/115) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
GCCCGCTCACCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTG > NC_000913/3754726‑3755021 | cccGCTCACCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCgtgt < 3:358114/149‑1 (MQ=255) cgaaCCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGc < 4:100618/146‑1 (MQ=255) cACCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCt > 4:411139/1‑149 (MQ=255) aCCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCtt > 1:571635/1‑149 (MQ=255) ccATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTa < 2:571635/149‑1 (MQ=255) aTCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGccc < 4:1439683/145‑2 (MQ=255) aTCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGccc > 3:1439683/1‑144 (MQ=255) aaaCGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGc < 1:511127/149‑1 (MQ=255) cgcgAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCgg > 4:63007/1‑145 (MQ=255) gaTTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTa < 3:636958/128‑1 (MQ=255) aTTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGcc < 1:762198/131‑1 (MQ=255) cTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTcc < 3:623345/149‑1 (MQ=255) cTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTcc < 1:1446769/149‑1 (MQ=255) tCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTccc > 3:668897/1‑149 (MQ=255) tCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATAAGGCGTACACGccgcatc > 4:760235/1‑124 (MQ=255) tCCTGACAAAAAACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTATCAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCCTATCCGGCCTACGGTCAGGTTccc > 3:963800/1‑149 (MQ=255) tGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCgtgt > 4:533713/1‑116 (MQ=255) acacGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGa < 3:411139/149‑1 (MQ=255) acGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGTCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATa > 4:906102/1‑149 (MQ=255) cccAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCg < 3:76963/115‑1 (MQ=255) ccAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGTCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGAcg < 3:906102/149‑1 (MQ=255) ccAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTccc < 2:903734/132‑1 (MQ=255) ccAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGAGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTccc > 1:903734/1‑132 (MQ=255) cAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGc > 4:766283/1‑115 (MQ=255) aGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGAcgcg < 4:963800/149‑1 (MQ=255) aaCGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATcc > 3:1389207/1‑108 (MQ=255) cGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGc < 4:663294/149‑1 (MQ=255) ttCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTc < 1:218282/147‑1 (MQ=255) ttCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTc > 2:218282/1‑147 (MQ=255) gTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCa > 2:1114618/1‑149 (MQ=255) gCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCa > 2:1241891/1‑149 (MQ=255) tCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCa < 1:152414/113‑1 (MQ=255) tCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCa > 2:152414/1‑113 (MQ=255) tGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAGCAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTc < 3:224999/131‑1 (MQ=255) tGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGcc > 2:1155389/1‑79 (MQ=255) tGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATAc > 3:433465/1‑149 (MQ=255) ggTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGc < 2:322512/126‑1 (MQ=255) ggTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGc > 1:322512/1‑126 (MQ=255) gTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGAcgc < 4:1377618/119‑1 (MQ=255) ttGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTc > 4:341487/1‑124 (MQ=255) gcACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTc < 2:787067/120‑1 (MQ=255) gTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGa > 1:276073/1‑104 (MQ=255) gTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCACTGCGAc < 2:1219237/144‑1 (MQ=255) tAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGctt > 1:1216661/1‑149 (MQ=255) aGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGAt > 4:1075432/1‑98 (MQ=255) gTTTAAAACGTAAATTGTACCAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAgg < 2:397738/80‑1 (MQ=255) gTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAgg > 1:397738/1‑80 (MQ=255) gTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTccc < 2:1140945/85‑1 (MQ=255) gTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCAt > 1:95344/1‑93 (MQ=255) gTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCAt < 2:95344/93‑1 (MQ=255) gTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATaa < 3:320085/98‑1 (MQ=255) gTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATaa > 4:320085/1‑98 (MQ=255) gTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGAc > 1:1145001/1‑101 (MQ=255) gTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGcttctt < 2:820600/149‑1 (MQ=255) tttAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATaa > 3:1098900/1‑97 (MQ=255) aaaaCGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAg > 4:1182964/1‑104 (MQ=255) aaaaCGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAg < 3:1182964/104‑1 (MQ=255) aaaCGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTc < 4:614940/107‑1 (MQ=255) aaaCGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGAcc < 2:585279/136‑1 (MQ=255) aaCGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCa > 3:1142265/1‑149 (MQ=255) aCGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCTTACGCGTc > 1:864139/1‑105 (MQ=255) gTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGaa > 2:645515/1‑149 (MQ=255) tAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAg < 3:1060370/79‑1 (MQ=255) tAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCaa > 3:187072/1‑124 (MQ=255) tAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCaa < 4:187072/124‑1 (MQ=255) tAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAAc > 1:62776/1‑149 (MQ=255) aTTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGAc > 3:764190/1‑88 (MQ=255) ttGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAg < 4:439604/75‑1 (MQ=255) ttGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGt > 2:1018799/1‑97 (MQ=255) tAACAACGTGCGCTTTGTTTATGTCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGTaa < 2:1418384/106‑1 (MQ=255) aacGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGccc > 4:256934/1‑143 (MQ=255) cGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGtt < 1:484442/149‑1 (MQ=255) tGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTa < 4:1142265/149‑1 (MQ=255) gcgcTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTAt < 1:645515/149‑1 (MQ=255) cgcTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATc < 2:496562/149‑1 (MQ=255) cTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGtt > 1:1003351/1‑53 (MQ=255) cTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGAc > 3:1041986/1‑72 (MQ=255) cTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGAc < 4:1041986/72‑1 (MQ=255) gTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGc > 3:607004/1‑111 (MQ=255) tttATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATg < 3:341471/60‑1 (MQ=255) tttATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATAccc > 1:803448/1‑98 (MQ=255) ttATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGc < 1:1024635/74‑1 (MQ=255) gCCGGATAAGGCGTACACGCCGCATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTta > 2:447676/1‑111 (MQ=37) gCCGGATAAGGCGTACACGCCGCATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTta < 1:447676/111‑1 (MQ=37) gCCGGATAAGGCGTACACGCCGCATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGcccc > 1:1192195/1‑126 (MQ=38) ccGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGtt < 2:717595/132‑1 (MQ=255) cGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATc < 3:826383/135‑1 (MQ=255) ggATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAG > 3:5169‑M1/1‑149 (MQ=255) gataaggcgtacacGCCGCATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGC > 2:878253‑M1/6‑149 (MQ=255) ataaggcgTACACGCCGCATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGcttc < 2:1291559/99‑1 (MQ=37) ataaggcgTACACGCCGCATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCa < 4:1465217/107‑1 (MQ=38) ataaggcgTACACGCCGCATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGa < 2:353363/131‑1 (MQ=39) ataaggcgTACACGCCGCATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGa > 1:353363/5‑135 (MQ=39) taaggcgTACACGCCGCATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGt < 1:1240572/123‑1 (MQ=38) tGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGGCGCGTAAGCGTCGCATCCGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACcagcag > 1:1373138/1‑149 (MQ=255) gcggcgTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAAt > 2:199496/1‑89 (MQ=255) gcggcgTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAAt < 1:199496/89‑1 (MQ=255) ggcgTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCa > 2:230912/1‑70 (MQ=255) gcgTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTc > 1:1119249/1‑63 (MQ=255) gcgTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAAt < 4:1063203/86‑1 (MQ=255) | GCCCGCTCACCATCGAAACGCGAGATTAAACTCCTGACAAAACACGCCCCAGAAACGTACTTCTGTTGGCGTAGTCTGGGTTATTGCGCACGTAGGTTTAAAACGTAAATTGTAACAACGTGCGCTTTGTTTATGCCGGATGCGGCGTGTACGCCTTATCCGGCCTACGGTCAGGTTCCCGTAGGCATGATAAGACGCGTAAGCGTCGCATCAGGCAATGAATACCCAATGCGACCAGCTTCTTATATCAGAACAGCCCCAACGGTTTATCCGAGTAGCTCACCAGCAGGCACTTG > NC_000913/3754726‑3755021 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |